New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP006584 | = 2891935 | NA (NA) | 34 (1.210) | 30/584 | 0.1 | 97.2% | intergenic (+12/+249) | LY180_13750/LY180_13755 | hypothetical protein/transcriptional regulator |
? | CP006584 | = 3268631 | 1 (0.040) | coding (88/1119 nt) | LY180_15515 | hydrogenase 2 small subunit |
AATACCGTTATCTTTTAATGGGATGGAACCATCCACAACCAACACATACTGCCCTTTGTACTTCTCAAGTGCGTTATGTTTGTTCTCTTCGACCTGATGACCGAAGGCGGCGGAAAGCACTTCGTGATACTCCAGAGAGATAGTCTCCAGCACGAGGTTTTCTACCGTTGGATGCGTTGCACGAAGCAGAGATTCCGTACAACCGGTGCACTCCTGCGCGCCAATCCAGATAACTGGCGGACGCTGCGGGTTAGTAACCGATTCGGCCATCTCTGCAGCGGCTTTGCTACTTAACCCCATGGTGGCGGCTAATGCTGCACAAAGCTTCATGAAATCACGACGGTTAATGCCGTGAGAATGGATGAGGGTGTTATCTCCAGTCATTTATAGTTATTCCGTTGCGAAGACCTGGCATATATTTTGCCTCAATCGCAAAATCAATAATGCGATCGATGCGCCATTTACCACACATTTATTATGGTTATCGATATCATGATACTGCGGCGGGGCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGTTTGATCAATTTTCGAGGCGATAACC > CP006584/3268335‑3268927 | aaTACCGTTATCTTTTAATGGGATGGAACCATCCACAACCAACACATACTGCCCTTTGTACTTCTCAAGTGCGTTATGTTCGTTCTCTTCGACCTGATGACCGATGGCGGCGGAAAGCACTTCGCGATACTCCAGCGAGATAGTCTCCAGCACGAGGTTTTCTACCGTCGGAGTCGTTGCACGAAGCAGAGATCCCGTACAACACGTGCACTCCTGCGCGCCAACCCACAATAGTGCCGGACGCTGCGGGATGGTAACAGCTACGGCCATATCTCCAGCGGCTTTGCTCCTTACCCCt < 2:84380‑M2/298‑2 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |