Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | CP006584 | 3,431,620 | Δ68 bp | coding (288‑355/879 nt) | LY180_16320 → | protease |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | CP006584 | 3431620 | 3431687 | 68 | 54 [0] | [0] 54 | LY180_16320 | protease |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | CP006584 | = 3431619 | 0 (0.000) | 54 (1.300) | 49/586 | 0.0 | 100% | coding (287/879 nt) | LY180_16320 | protease |
? | CP006584 | 3431688 = | 0 (0.000) | coding (356/879 nt) | LY180_16320 | protease |
GCAGGCCGCCACCAGCAGCGCCGACGTGATTTATCTTGGTGAAGCGGTATGCAGCAAGCGCCGGGCAACCAAAGTTGGCGACTGGCTGGAGATGGCAAAATCGCTCGCCGGAAGTGGCAAGCAGATTGTGCTCTCCACGCTGGCGCTGGTGCAGGCATCCTCTGAACTGGGCGAACTGAAACGCTATGTTGAGAACGGTGAGTTTCTGATTGAAGCCAGCGATCTCGGCGTGGTGAATATGTGCGCTGAACGCAAACTGCCGTTCGTCGCCGGGCACGCGCTGAACTGCTACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGAGCTGGGCATTCGCAACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCATCTACCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTGCTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTA > CP006584/3431398‑3431980 | gcaatgcaatattccttagggccagtgctgtggtactggccaaaagagacgctggaagatttttatcagcaggccgccaccagcagcgccgacgtgatttatcttggtgaagcggtatgcagcaagcgccgggcaacccaagttggcgactggctggagatggcaaaatcgctcgccggaagtggcaagccgattgtgctctccaccctggcgctggtgcaggcatcctctgaactggtcgaactgaaacgctatgttgcgaacggtgcgtttcggcttgaaaccagcgaACCAcgcg > 2:428159‑M2/291‑298 (MQ=255) aatgaaatattccttagggccagtgctgtggtactggccaaaagagacgctggaagatttttatcagcaggccgccaccagcagcgccgacgtgatttatcttggtgaagcggtatgcagcaagcgccgggcaaccaaagttggcgactggctggagatggcaaaatcgctcgccggaagtggcaagcagattgtgctctccacgctggcgctggtgcaggcatcctctgaactgggcgaactgaaacgctatgttgagaacggtgagtttctgattgaagccagcgaACAACGCGGt < 1:210463‑M2/10‑1 (MQ=255) tagggccagtgctgtggtactggccaaaagagacgctggaagatttttatcagcaggccgccaccagcagcgccgacgtgatttatcttggtgaagcggtatgcagcaagcgccgggcaaccaaagttggcgactggctggagatggcaaaatcgctcgccggaagtggcaagcagattgtgctctccacgctggcgctggtgcaggcatcctctgaactgggcgaactgaaacgctatgttgagaacggtgagtttctgattgaagccagcgaACAACGCGGTGACGCTGAAAatat < 1:359015‑M2/24‑1 (MQ=255) cagtgctgtggtactggccaaaagagacgctggaagatttttatcagcaggccgccaccagcagcgccgacgtgatttatcttggtgaagcggtatgcagcaagcgccgggcaaccaaagttggcgactggctggagatggcaaaatcgctcgccggaagtggcaagcagattgtgctctccacgctggcgctggtgcaggcatcctctgaactgggcgaactgaaacgctatgttgagaacggtgagtttctgattgaagccagcgaACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCa < 1:292528‑M2/30‑1 (MQ=255) 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gaactgaaacgctatgttgagaacggtgagtttctgattgaagccagcgaACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGAGCTGGGCATTCGCAACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCATCTACCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTGCTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCg < 1:285452‑M2/248‑1 (MQ=255) ctgaaacgctatgttgagaacggtgagtttctgattgaagccagcgaACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGTGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGAGCTGGGCATTCGCAACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCATCTACCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTGCTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAAc < 2:197737‑M2/251‑1 (MQ=255) gaacggtgagtttctgattgaagccagcgaACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGAGCTGGGCATTCGCAACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCATCTACCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTGCTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTc > 1:171327‑M2/31‑298 (MQ=255) 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agccagcgaACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGAGCTGGGCATTCGCAACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCATCTACCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTGCTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGtt > 1:25373‑M2/10‑298 (MQ=255) agcgaACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGAGCTGGGCATTCGCAACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCATCTACCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTGCTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTa > 1:178234‑M2/6‑298 (MQ=255) | GCAGGCCGCCACCAGCAGCGCCGACGTGATTTATCTTGGTGAAGCGGTATGCAGCAAGCGCCGGGCAACCAAAGTTGGCGACTGGCTGGAGATGGCAAAATCGCTCGCCGGAAGTGGCAAGCAGATTGTGCTCTCCACGCTGGCGCTGGTGCAGGCATCCTCTGAACTGGGCGAACTGAAACGCTATGTTGAGAACGGTGAGTTTCTGATTGAAGCCAGCGATCTCGGCGTGGTGAATATGTGCGCTGAACGCAAACTGCCGTTCGTCGCCGGGCACGCGCTGAACTGCTACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGAGCTGGGCATTCGCAACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCATCTACCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTGCTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTA > CP006584/3431398‑3431980 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |