| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP006584 | 346068 = | NA (NA) | 73 (1.190) | 59/586 | 0.1 | 96.0% | intergenic (‑51/‑107) | LY180_01675/LY180_01680 | CadC family transcriptional regulator/hypothetical protein |
| ? | CP006584 | = 363812 | 3 (0.050) | intergenic (‑39/‑249) | LY180_01770/LY180_01775 | outer membrane phosphoporin protein E/gamma‑glutamyl kinase | |||||
ATCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP006584/346364‑346068‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTTTGCCGGAAATAAAG < CP006584/363812‑363518 ATCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCATCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTTATCAGC > 2:225416/1‑298ATCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGC < 1:294646/298‑1 CGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTCATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTGAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAACGAGAGTCGTGTAAACTATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTACCTTAATGATTTTTACCAAAATAATTAGGGGATTCATCAGCct > 2:367074/1‑296 CGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGC < 1:25492/298‑1 agtTTCGTTTGATGTTTTGTTTTGTTCTTGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAA < 2:229650/295‑1 ttGTTTGTGGTGATTTTTTGTTCTCGCGTTGGTTGGCAGGTTAGGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCcaagcgcc < 2:13125/296‑9 TGATGTTTTGTTTTTTTTTTGCTTTTGTTGGCAGGTTAAGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGGGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTTA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCcaagcgcctgtgc < 2:112919/298‑14 GATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCcaagcgcctgtgcc > 1:230273/1‑284 GATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCG > 1:465792/1‑298 GATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGCTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCcaagcgcctgtgcc > 1:19255/1‑284 GTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTGGGAAAGGGTGAGAGTTTTAAAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTGTATTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTTTAAAATATCGAGGTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAA < 2:341184/298‑1 TTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAG > 1:157349/1‑298 TTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAG < 1:33651/298‑1 GGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCAGTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTC < 2:415490/298‑1 GCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCT > 1:4683/1‑298 GCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGCTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATGAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCT > 2:60649/1‑298 AAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTTTCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGAGCCTATGATAAGATGTGTATCCACCGTAACTTAATGATTTTTAACAAAATCATTAGGGTGTTCATGAGCGCTTAAAATTCGCGCTTTAATTAAAATAAAGAATTAAAAGCAAAAAAAGCACTCTAGC > 2:358002/1‑298 AAGCTCGGGCAGAGGGAGATGTTTAAATTTAAGGAATGGGTGGCAAGCCAGAGTTAAGCTGTTGGGTCGTGTTAATGGTAATTCGGGGCAGAAGTGGTAAATAGAGTCGTGTAAAATGTCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCGTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGC < 2:226477/298‑1 GTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCAT < 1:419335/298‑1 TCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTA < 1:441872/298‑1 GGTAAGGTTGATAGTTTTACAGTAAAGTAATGCGGTGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAAGTCGGGGCAGAATTGGTAAAGGTAGTCTTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTATATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGT < 2:628109/298‑1 GAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGA > 1:331439/1‑298 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TTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGTGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCACCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGT < 1:634117/298‑1 TTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGT > 1:75023/1‑298 TCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTAGCGAAACCATTTGCTCATATGACAAGATGTGTATCCACATTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGAGCTGAATATTCGCGCGTTTATTAAAATAGGGAATGATAATGAAAAAGAGCACCCTGGCATCAGTGGTGATGGGCATTGTGGacact > 2:304645/1‑293 AAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGC < 1:312214/298‑1 TAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATC < 1:69916/298‑1 AGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGC > 1:109726/1‑298 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GAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAACAGGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCCGAAATAAATCACAAAGACGGTAATAAACAGCATGTATATGGCAAAGTTAAAGCCA > 2:294262/1‑298 GTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGAACTCTGGCATGAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGAATCCTTACAGGCCGCAGAACTATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCaaagaa > 2:132420/1‑292 TATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGAATTGTGGCATCTGCATCCGCACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACGGGATGTCTATGCCAAATTTAAAGCCATGCACTCAATGAGTt > 2:100685/1‑297 cggttttagaaATCTTTTTGTTTATTTATTAA‑TTTTTTGGTAAACCATTTAATCAAACGACAAGATGTGGATCAACCTTACCTTAAAGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGAGTTAATTAAAATCAGGCATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATA < 2:465792/287‑1 GTTCGTACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACG > 1:545943/1‑298 TCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAG > 1:202886/1‑298 GTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGA < 1:449753/298‑1 TGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCA > 1:171279/1‑298 ATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGA < 1:304645/298‑1 atttgtagtGAAACCATTTTAGCATATTACAAGAGGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCAGAAGAGTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATAT < 2:523809/289‑1 CGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTG < 1:427034/298‑1 ACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCTTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGGTT > 1:198486/1‑298 CATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACATTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCAATGCATTATCTGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACAAGAGGTATATCAGTTTTGGTTGTA > 2:118360/1‑298 ATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAA > 1:88714/1‑298 TTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATA < 1:646944/188‑1 TTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATA > 2:646944/1‑188 TTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGA > 1:367510/1‑263 TTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGA < 2:367510/263‑1 GATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGCAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCAAAACAAAAACTA > 2:449012/1‑298 CACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACT > 1:361947/1‑298 TTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATCTGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTCTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATAAACGCTCAACTTACT > 2:279734/1‑298 CTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCT < 1:502313/298‑1 ATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGGAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTACAAGGCGAAAACAAAATTAACGAACAAACGACTGTCTATGGCCGTTGTGAAGagag > 2:403498/1‑294 ATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTT > 2:197403/1‑298 TTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTTT > 1:513965/1‑298 TTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTTT < 1:60196/298‑1 AGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTTTGC > 1:53338/1‑298 TTCATCAGCGCGGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTTTGCCGGAAA < 1:100685/298‑1 TCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTTTGCCGGAAAT < 1:375727/298‑1 CAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTTTGCCGGAAATAAAG < 1:118360/298‑1 ATCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGA‑TTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP006584/346364‑346068‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAACACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTTTGCCGGAAATAAAG < CP006584/363812‑363518 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |