New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP006584 | 346068 = | NA (NA) | 87 (1.420) | 76/588 | 0.0 | 98.9% | intergenic (‑51/‑107) | LY180_01675/LY180_01680 | CadC family transcriptional regulator/hypothetical protein |
? | CP006584 | = 363812 | 1 (0.020) | intergenic (‑39/‑249) | LY180_01770/LY180_01775 | outer membrane phosphoporin protein E/gamma‑glutamyl kinase |
AATCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP006584/346365‑346068 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAAC‑ACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTTTGCC < CP006584/363812‑363528 AATCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGC > 1:3002/1‑299 ATCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCG < 1:580205/299‑1 GGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGCGTCGTTTTAAGTGTACTTCGGGGCAGAATTGGCAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCAAATCTTGTTGTCTGATTATTGCTTTTTCGCGAAACCATTTACTCATATGACAAGATGTGTATCCACTTGAACTTAATCATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCTGCGCat > 2:176368/1‑297 ttGATTCGTTTGATTTTTGGGTTTGTTCTCGTTTTGGTGGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTAAAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGGGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAA < 2:382870/297‑1 CGATTCTTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAAT < 1:396082/299‑1 CGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCcaagc > 1:290511/1‑294 tttTTTGATGTTATGTTGTGTTGTCAGTTTGGTTGGGAGGTTACGGCCAAGTTCGGGAAGAGTGTGAGTTTTACCGTCTAGTAATGCGTAGCAAGCCAACGTGAAGCTGGTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCGTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTtggcgtca < 2:224380/296‑9 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GTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGC < 1:183431/299‑1 TTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCA > 1:240060/1‑299 GGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATAAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTAGAGCGTTAATTAAAATCAGGAAGGAAAAGGAAAAAaaacaatcg > 2:412760/1‑290 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TAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGT < 1:227957/299‑1 gGAGTGTGTGGTTTACAGTTAAGTAATGGTGGGCAAGCCAACTTTTAGTTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGTAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAACAGATCGAGTTCGTACAGCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGA < 2:581006/298‑1 GAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGC > 1:47995/1‑299 AGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATT > 1:519299/1‑299 ACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCA > 1:262999/1‑299 CAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAACGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTCCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTCACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCACTGAATATTCTCTCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGACCACTCTGGCATTAGTGGGAATGGTCAGTGTGGaca > 2:321263/1‑296 GTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCT < 1:151286/299‑1 TCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTG > 1:468888/1‑299 GTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATC > 1:310806/1‑299 GGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGC < 1:314211/299‑1 AAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTCACGGCCGC > 2:424356/1‑299 AAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGC > 1:91592/1‑299 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AAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCAATCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATATGCATCCGTAAAGGCAGCAGAAATATATAACAAAGACGGTACAAAAATGGATGTCTATTGCAAAGTTAAAGC > 2:587532/1‑299 AAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCCTCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAACCGTTAATAAACCGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCC > 2:492385/1‑299 AGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCA < 1:583278/299‑1 GAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCAACTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGAATTAGTGGTGATGGGCCTTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAATTAAAGCaag > 2:24162/1‑296 cgaGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTA < 1:594135/296‑1 ggtgTCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGT < 1:356521/295‑1 AATATCGGGTTTTCACATCTTGTTGTCTGGTTATTGATTTTGCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGT < 2:655971/299‑1 GAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAAC > 1:621247/1‑299 GAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAAC < 1:456843/299‑1 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CTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGAT > 1:236623/1‑299 TCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACC < 1:590583/299‑1 TTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATGATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTAT < 1:572211/299‑1 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TTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAAATGTGTTACCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAACATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTT < 2:120839/299‑1 GCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTG < 1:412760/299‑1 AAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATA < 2:175596/257‑1 AAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATA > 1:175596/1‑257 ACCATTTGGTAAAATTACAAGATGTGTTTCCACTTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATTATTAGGGGATTAATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCTCTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTT < 2:348604/299‑1 ACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTT > 1:629993/1‑299 CATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAA > 1:550540/1‑299 ATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAA < 1:453524/299‑1 TTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGACAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATAAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTTCATCCGTACAGGCCGCACAAATTAATAACAATGACGGTACTAACAGGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGACATCCATAAAAGGAGTGATAACGACAGAAAAGATGGCGACCACGGTTATAACAGTTTTGGTTTTAACGG > 2:350826/1‑299 TCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGACATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGTTACCAGAGTTATTACGGTTTTGGGTTTAAAGGgaaa > 2:139847/1‑295 CATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAA > 1:576159/1‑299 CAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAAC‑ACAAAT < 1:6785/299‑1 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CACCTGAACTTAAGTATTGTTACCAAAAGCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCACGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCATAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAAC‑ACAAATTAACGATCAACTG < 1:283233/299‑1 ACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGCGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAAC‑ACAAATTAACGATCAACTGACTGGCT > 1:357841/1‑299 CTTAAGGATTTTTACGAAAATCATTAGGTGGTTCATCATGGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAAGGAAAAAGAGCACTCTGGCATGAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACCAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAAC‑ACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTA < 2:125328/299‑1 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGAATATTCGCGCGTTAATTAAAATCAGGAATGAAAATGAAAAAGAGCACTCTGGCATTAGTGGTGATGGGCATTGTGGCATCTGCATCCGTACAGGCCGCAGAAATATATAACAAAGACGGTAATAAACTGGATGTCTATGGCAAAGTTAAAGCCATGCATTATATGAGTGATAACGACAGTAAAGATGGCGACCAGAGTTATATCCGTTTTGGTTTTAAAGGCGAAAC‑ACAAATTAACGATCAACTGACTGGCTATGGCCGTTGGGAAGCGGAGTTTGCC < CP006584/363812‑363528 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |