New junction evidence | |||||||||||
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? | CP006584 | = 4334576 | 1 (0.020) | coding (21/1734 nt) | LY180_20755 | membrane protein |
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TACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGG > 1:568390/1‑299 TGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTTTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTCTTCCCCTTTCCGAAGTGGTTTAACATTATTCCCGCAGTAATCGGCTTGGTGCTTTTGGCGGCCg > 2:252071/1‑298 AACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGC < 1:409697/299‑1 CCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTAGAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTTGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGTATTACAATTATTGCAGCATTAGTCGGAGTGGTGCTATGGGCTGCCcccattgagg > 2:161511/1‑289 CCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGCGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTCTTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTACGAAGCGGATTAAAATTCTTGCCGCAGTACTCGGCGTGGTCCTATGGGCGGCCTCTCTTGCGG > 2:270115/1‑299 CCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGTCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTACAATTATTCCCGCCATAATCCGCGTGTTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCTGC > 2:632642/1‑299 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AGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGATGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCACCGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCGGTCGCTGATCCCGGTATTACTCTTTCCGAAGCGGATTGAACTTATGGCCGCAGTAACCGGCGTGGTACTATGGGCGGCCTGTCTGGCGGCGCGATGCTACTACGTCACCTACGCGTAGGAGTTCGCGCCGGGCGccctggt > 2:95558/1‑292 GGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGC > 2:162086/1‑273 GGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGC < 1:162086/273‑1 GGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGAACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCTCGCAGAGCGTTCTGTTTG < 1:627059/299‑1 CAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCTCGCAGAGCGTTCTGTTTGTGATGTTCG < 1:273799/299‑1 CAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCTCGCAGAGCGTTCTGTTTGTGATGTTCG > 1:119897/1‑299 GGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCTCGCAGAGCGTTCTGTTTGTGATGTTCGAA < 1:205874/299‑1 AGCCGAACGAGCAGCTCAGAGCGTTTTGATATCATGCTGCTAATCGCC‑CTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP006584/4187792‑4188086 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCTCGCAGAGCGTTCTGTTTGTGATGTTCGAA < CP006584/4334576‑4334279 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |