| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP006584 | = 4334576 | 1 (0.020) | coding (21/1734 nt) | LY180_20755 | membrane protein | |||||
CCGAACGAGCAGCTCAGAGCGTTTTGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTT‑GGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAA‑GCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCT‑ACGACATTAG‑ATGTTGCCCCTGCAGAGTATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTAGTTCATTGTCTAACCTGGATATTGAAGGCAAAGTC > CP006584/4187794‑4188378 | ccGAACGCTCATCTCAGAGCGTTTTTAGATCATGCGTCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTTACATGTT‑GGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAAGACGGTTGGGACAAGCACTTGCAGGCTAACACATTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTATGCATGGAAGTTTTGCGTCATTCTGGCTACACAATAACGAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTATCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGa < 2:497334/299‑1 (MQ=11) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |