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| MC JC | CP006584 | 3,431,620 | Δ68 bp | coding (288‑355/879 nt) | LY180_16320 → | protease |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
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GTTTCTGATTGAAGCCAGCGAACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGAGCTGGGCATTCGCAACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCATCTACCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTGCTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAA < 1:990849/298‑1 TGATTGAAGCCAGCGAACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGAGCTGGGCATTCGCAACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCATCTACCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTGCTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAAC > 1:15994/1‑298 gagTGAAGCCGGCGAACACGGCGGTGAGGCTGAAAGGATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTTGGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAGTCTGCTTAATCAGTGCGATGAGCTGGGCATTCGCAACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCATCTACCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTGCTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACA < 2:204677/295‑1 TGAAGGCAGGGAACAACGTGGTGACGCGGAAAAATGTGCTCTAACGAGGTTGGGTGGGCTGGTTGAGGCGGGTGGGGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAAGCTGCTGAATCAGTGCGATGGGCTGGGCATTCGCAACCCGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAACTACGGTCATCTACCTCTGTCCTACGCCGCCCGCTGCTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGGCGCAGGAAAACCAACAAGT < 2:253555/298‑1 CAGCGAACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGCGCTGGGCATTCGCCACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCACCTACCGCTGGCCTCCTCCGCCCGCTGCTTTCCCGCGCGTTCGGAAGCCCCCCCGAAAGAAGAGTGTGCAACCCGCTGCCTTAAGTATCCGAACGGGCGCAACCTGCTGTCGCAGGCACAACAACACACGTTTGT > 2:546551/1‑298 GAACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGAGCTGGGCATTCGCAACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCATCTACCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTACTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTC > 1:410104/1‑298 GAGAAGAGCAATGAAATATTCCTTAGGGCCAGTGCTGTGGTACTGGCCAAAAGAGACGCTGGAAGATTTTTATCAGCAGGCCGCCACCAGCAGCGCCGACGTGATTTATCTTGGTGAAGCGGTATGCAGCAAGCGCCGGGCAACCAAAGTTGGCGACTGGCTGGAGATGGCAAAATCGCTCGCCGGAAGTGGCAAGCAGATTGTGCTCTCCACGCTGGCGCTGGTGCAGGCATCCTCTGAACTGGGCGAACTGAAACGCTATGTTGAGAACGGTGAGTTTCTGATTGAAGCCAGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP006584/3431323‑3431619‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGAGCTGGGCATTCGCAACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCATCTACCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTGCTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTC > CP006584/3431688‑3431983 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |