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| MC JC | CP006584 | 3,431,620 | Δ68 bp | coding (288‑355/879 nt) | LY180_16320 → | protease |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| ? | CP006584 | 3431688 = | 0 (0.000) | coding (356/879 nt) | LY180_16320 | protease | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
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ggtgagtttctgattgaagccagcgaACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGAGCTGGGCATTCGCAACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCATCTACCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTGCTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAg < 1:46036‑M2/272‑1 (MQ=255) tgagtttctgattgaagccagcgaACAACGCGGTTACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGCGCTGTGCATTCGCAACCCATTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCATCTCCCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTGCCTTACCCCGCGCTCGGAACCCCGCCCGAACACTGAGTGTGAAACCCGCTGCATTAAGTATCCGCACGGGCGCACCGTGACGTcgcaaca > 2:910894‑M2/25‑295 (MQ=255) tgagtttctgattgaagccagcgaACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGAGCTGGGCATTCGAAACCAGTTTGAAGTGGAAGTACTGAGCTACGGTCATCTACCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTGCTTGAACGCGAGTTCGGAAGCCCACCCGAAAGAGGATTTGGAAACGTGCTGCATTCAGTATCCGAACGGGACCAACGTGctgtcgtgaga > 2:329055‑M2/25‑293 (MQ=255) gtttctgattgaagccagcgaACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGAGCTGGGCATTCGCAACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCATCTACCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTGCTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGaaaa < 1:990849‑M2/277‑1 (MQ=255) tgattgaagccagcgaACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGAGCTGGGCATTCGCAACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCATCTACCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTGCTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACcaac > 1:15994‑M2/17‑298 (MQ=255) gagtgaagccggcgaACACGGCGGTGAGGCTGAAAGGATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTTGGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAGTCTGCTTAATCAGTGCGATGAGCTGGGCATTCGCAACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCATCTACCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTGCTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACcaaca < 2:204677‑M2/283‑1 (MQ=255) tgaaggcagggaACAACGTGGTGACGCGGAAAAATGTGCTCTAACGAGGTTGGGTGGGCTGGTTGAGGCGGGTGGGGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAAGCTGCTGAATCAGTGCGATGGGCTGGGCATTCGCAACCCGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAACTACGGTCATCTACCTCTGTCCTACGCCGCCCGCTGCTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGGCGCAGGAAAACCAACAAgt < 2:253555‑M2/286‑1 (MQ=255) cagcgaACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGCGCTGGGCATTCGCCACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCACCTACCGCTGGCCTCCTCCGCCCGCTGCTTTCCCGCGCGTTCGGAAGCCCCCCCGAAAGAAGAGTGTGCAACCCGCTGCCTTAAGTATCCGAACGGGCGCAACCTGCTGTCGCAGGCACAACAACACACGTTTGt > 2:546551‑M2/7‑298 (MQ=255) gaACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGAGCTGGGCATTCGCAACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCATCTACCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTACTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTc > 1:410104‑M2/3‑298 (MQ=255) | TTTATCAGCAGGCCGCCACCAGCAGCGCCGACGTGATTTATCTTGGTGAAGCGGTATGCAGCAAGCGCCGGGCAACCAAAGTTGGCGACTGGCTGGAGATGGCAAAATCGCTCGCCGGAAGTGGCAAGCAGATTGTGCTCTCCACGCTGGCGCTGGTGCAGGCATCCTCTGAACTGGGCGAACTGAAACGCTATGTTGAGAACGGTGAGTTTCTGATTGAAGCCAGCGATCTCGGCGTGGTGAATATGTGCGCTGAACGCAAACTGCCGTTCGTCGCCGGGCACGCGCTGAACTGCTACAACGCGGTGACGCTGAAAATATTGCTCAAACAGGGCATGATGCGCTGGTGTATGCCGGTGGAGCTTTCCCGCGACTGGCTGGTGAATCTGCTTAATCAGTGCGATGAGCTGGGCATTCGCAACCAGTTTGAAGTGGAAGTCCTGAGCTACGGTCATCTACCGCTGGCCTACTCCGCCCGCTGCTTTACCGCGCGTTCGGAAGACCGCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTC > CP006584/3431391‑3431983 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |