| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP006584 | = 4334576 | 4 (0.040) | coding (21/1734 nt) | LY180_20755 | membrane protein | |||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
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CP006584/4187790‑4188086‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCC‑CGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTA‑CTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCT‑CGCAGAGCGTTCTGTTTGTGATGTTCG < CP006584/4334576‑4334281 TAGCCGAACGAGCAGCTCAGAGCGTTTTGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGG > 1:843151/1‑298 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GGAAATTATGAGGGGGTATGTCAGGGCTTACCCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCC‑CGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCATTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTA‑CTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCT‑CGCAG < 2:321909/298‑1 GGGGCTCTCTCAGGGCTCAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTCTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTAAGCTCGCCGTGGTTGATCC‑CGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGCTCTATTGGCGGCATCCCCGGCGGCCCTATCCTACCTAC‑TTACCTACGGGCAGCAAGTCT‑CGCAagacgtcttgtt > 2:315693/1‑286 GGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCC‑CGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTA‑CTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCT‑CGCAGAGCGTTCTGTT < 1:540831/298‑1 GGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCC‑CGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTA‑CTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCT‑CGCAGAGCGTTCTGTTT < 1:1004764/298‑1 TCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCC‑CGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTA‑CTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCT‑CGCAGAGCGTTCTGTTTGTGA < 1:998677/298‑1 TCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCCTTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCC‑CGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCTGCCTCTCTGGCGGCCCTATGCTA‑CTACGTCCTCTACGGGCCGGGGTTCTCCGCA‑AGCGTTCTGTTgtgtatgtt > 2:950154/1‑289 ATAGCCGAACGAGCAGCTCAGAGCGTTTTGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP006584/4187790‑4188086‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCC‑CGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTA‑CTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCT‑CGCAGAGCGTTCTGTTTGTGATGTTCG < CP006584/4334576‑4334281 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |