| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
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ggATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTATTTATCGCC‑GCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAG‑TATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTAGTTCATTGTCTAACCTGGATATTGAAGGCa < 1:597505/298‑1 (MQ=255) tctctcAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTATTTATCGCC‑GCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAG‑TATGGACAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCAAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTAGTTCATTGTCTAACCTGGAATCTGAAGGTAAAg > 2:178471/1‑298 (MQ=255) tcAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCGCAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTATTTATCGCC‑GCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAG‑TATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTAGTTCATTGTCTAACCTGGATATTGAAGGCAAAGTCGa > 1:559701/1‑298 (MQ=255) | CGAACGAGCAGCTCAGAGCGTTTTGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTATTTATCGCC‑GCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAG‑TATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTAGTTCATTGTCTAACCTGGATATTGAAGGCAAAGTCGA > CP006584/4187795‑4188380 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |