| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP006584 | 4496128 = | NA (NA) | 63 (1.070) | 59/536 | 0.1 | 98.6% | intergenic (‑2037/‑83) | LY180_21445/LY180_21450 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | CP006584 | 4565632 = | 1 (0.020) | intergenic (‑372/+82) | LY180_21775/LY180_21780 | hypothetical protein/lysine 2,3‑aminomutase | |||||
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
TGTGGAGGTGACGATTACCTAACAATCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGT‑TTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACcaaaatcattaggggattcatcag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP006584/4496424‑4496128‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCTGCCGTGCTTCGTCATCACTCACCATAAAATGCGCCGCGCCCTGTACTTTATCGAGCACATGCAGGTAATACGGCATTACGCCGGCATCGAACAACGCATTACTCAGGTTTGCCAGCGTTT > CP006584/4565632‑4565949 TGTGGAGGTGACGATTACCTAACAATCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGT‑TTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACC > 1:358432/1‑298 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ACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCTGCCGTGCTTCGTCATCACTCACCATAAAATGCGCCGCGCCCTGTACTTTATCGAGCACATGCAGGTAATACGGCATTA > 1:78013/1‑298 AACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCTGCCGTGCTTCGTCATCACTCACCATAAAATGCGCCGCGCCCTGTACTTTATCGAGCACATGCAGGTAATACGGCATTACGCCG < 1:296331/298‑1 AATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCTGCCGTGCTTCGTCATCACTCACCATAAAATGCGCCGCGCCCTGTACTTTATCGAGCACATGCAGGTAATACGGCATTACGCCGGCATC > 2:175141/1‑298 TGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCTGCCGTGCTTCGTCATCACTCACCATAAAATGCGCCGCGCCCTGTACTTTATCGAGCACATGCAGGTAATACGGCATTACGCCGGCATCGA > 1:327336/1‑298 CAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCTGCCGTGCTTCGTCATCACTCACCATAAAATGCGCCGCGCCCTGTACTTTATCGAGCACATGCAGGTAATACGGCATTACGCCGGCATCGAACAACGCATT < 1:166030/298‑1 AAATCATTAGGGGATTCATCAGGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCTGCCGTGCTTCGTCATCACTCACCATAAAATGCGCCGCGCCCTGTACTTTATCGAGCACATGCAGGTAATACGGCATTACGCCGGCATCGAACAACGCATTAC < 1:321157/298‑1 TCATTAGGGGATTCATCAGGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCTGCCGTGCTTCGTCATCACTCACCATAAAATGCGCCGCGCCCTGTACTTTATCGAGCACATGCAGGTAATACGGCATTACGCCGGCATCGAACAACGCATTACTCA > 1:50282/1‑298 TCAGGGGCTGATAAGCGTAGCGGATCAGGCTATTTTATTGTTTAATGTCCCTTGTTAATCAGTTACTGCGGGCGTAGCGGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAAGTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCTGCCGTGCTTCGTCATCACTCACCATAAAATGCGCCGCGCCCTGTACTTTATCGAGCACATGCAGGTAATACGGCATTACGCCGGCATCGAACAACGCATTACTCAGGTTTGCCAGCGTTT < 2:276242/298‑1 TGTGGAGGTGACGATTACCTAACAATCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGT‑TTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACcaaaatcattaggggattcatcag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP006584/4496424‑4496128‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCTGCCGTGCTTCGTCATCACTCACCATAAAATGCGCCGCGCCCTGTACTTTATCGAGCACATGCAGGTAATACGGCATTACGCCGGCATCGAACAACGCATTACTCAGGTTTGCCAGCGTTT > CP006584/4565632‑4565949 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |