New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP006584 | 4496128 = | NA (NA) | 63 (1.070) | 59/536 | 0.1 | 98.6% | intergenic (‑2037/‑83) | LY180_21445/LY180_21450 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | CP006584 | 4565632 = | 1 (0.020) | intergenic (‑372/+82) | LY180_21775/LY180_21780 | hypothetical protein/lysine 2,3‑aminomutase |
CAGCGGGTCGATAACAATAATGCCTTTCTCGCCCTCAACGAACGTAATGTTAGAGATATCCTGGCCGCGCACCTGATACATTTTATCGGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAATAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAGCGAGAACAAAACATAACATCAAACGAATCGA > CP006584/4495833‑4496395 | cAGCGGGTCGATAACAATAATGCCTTTCTCGCCCTCAACGAACGTAATGTTAGAGATATCCTGGCCGCGCACCTGATACATTTTATCGGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTa > 1:92682/1‑298 (MQ=255) gTCGCTAACAATAATGCCTTTCTCGCCCTCAACGAACGTAATGTTAGAGATATCCTGGCCGCGAACCTGATACATTTTATCGGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACAGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTAATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATc < 1:550130/298‑1 (MQ=255) gATAACAATAATGCCTTTCTCGCCCTCAACGAACGTAATGTTAGAGATATCCTGGCCGCGCACCTGATACATTTTATCAGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCAtt > 1:124785/1‑298 (MQ=255) aataatGCCTTTCTCGCCCTCAACGAACGTAATGTTAGAGATATCCTGGCCGCGCACCTGATACATTTTATCGGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCAttaagtta < 1:155036/298‑1 (MQ=255) aataatGCCTTTCTCGCCCTCAACGAACGTAATGTTAGAGATATCCTGGCCGCGCACCTGATACATTTTATCGGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCAttaagtta > 1:494778/1‑298 (MQ=255) aatGCCTTTCTCGCCCTCAACGAACGTAATGTTAGAGATATCCTGGCCGCGCACCTGATACATTTTATCGGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAgg > 1:119908/1‑298 (MQ=255) aatGCCTTTCTCGCCCTCAACGAACGTAATGTTAGAGATATCCTGGCCGCGCACCTGATACATTTTATCGGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAgg > 1:118471/1‑298 (MQ=255) aatGCCTCTCTCGCCCTCAACGAACGTAATGTTAGAGATATCCTGGCCGCGCACCTGATACATTTTATCGGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAgg > 1:481901/1‑298 (MQ=255) ccTTTCTCGCCCTCAACGAACGTAATGTTAGAGATATCCTGGCCGCGCACCTGATACATTTTATCGGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGa < 1:386471/298‑1 (MQ=255) cTCAACGAACGTAATGTTAGAGATATCCTGGCCGCGCACCTGATACATTTTATCGGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTg < 1:584534/298‑1 (MQ=255) 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CAGCGGGTCGATAACAATAATGCCTTTCTCGCCCTCAACGAACGTAATGTTAGAGATATCCTGGCCGCGCACCTGATACATTTTATCGGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAATAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAGCGAGAACAAAACATAACATCAAACGAATCGA > CP006584/4495833‑4496395 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |