| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,653,231 | Δ2,028 bp | IS5‑mediated | [yhiS]–[yhiD] | [yhiS], slp, dctR, [yhiD] |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3652132–3653236 | 3655258 | 2023–3127 | 15 [12] | [0] 85 | insH1–[yhiD] | insH1, yhiS, slp, dctR, [yhiD] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3653230 | NA (NA) | 85 (1.360) | 42/214 | 0.3 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3655259 = | 0 (0.000) | coding (644/648 nt) | yhiD | putative Mg(2+) transport ATPase, inner membrane protein | |||||
CTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3653099‑3653230‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGACCACTTCATGATCTTCATTTTCCTGCAACGAAACTAAATCAGT > NC_000913/3655259‑3655395 ctaTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTG < 2:389273/136‑1 TTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAA < 1:505150/139‑1 TTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAA < 1:142586/139‑1 TTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAA < 2:947183/139‑1 GCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCC < 2:415392/139‑1 TACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCA < 1:1411776/139‑1 AATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGATGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTCCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTT > 2:355896/1‑139 ATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTA < 1:485305/139‑1 ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAA > 1:1355568/1‑139 ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAA > 1:1216760/1‑139 GGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAA < 2:1216760/139‑1 GCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAAC < 2:753824/139‑1 GCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAAC < 2:832444/139‑1 GCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAAC > 2:594502/1‑139 GCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAAC > 1:957531/1‑139 ATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGA > 2:1101854/1‑139 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTG > 2:1261780/1‑139 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGC > 2:277682/1‑115 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGC < 1:277682/115‑1 TGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCAT < 2:247956/139‑1 ACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAA > 2:657217/1‑139 CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAG < 1:1101854/139‑1 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCA > 1:1341097/1‑80 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCA < 2:1341097/80‑1 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCT > 2:557225/1‑54 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCT < 1:557225/54‑1 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCC > 1:33139/1‑53 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCC < 2:33139/53‑1 CTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAA > 1:312783/1‑59 CTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAA < 2:312783/59‑1 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCA < 1:336212/119‑1 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCA > 2:336212/1‑119 CAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCG < 1:594502/139‑1 GATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGAC < 1:657217/139‑1 GATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGAC < 2:72619/139‑1 ATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGACC < 1:782195/139‑1 CAAACATGATCTCATATCAGAGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTG < 1:509404/119‑1 CAAACATGATCTCATATCAGAGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTG > 2:509404/1‑119 ATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGACCACTTCATGATCT > 2:1333897/1‑139 TCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCG > 1:1233661/1‑91 TCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCG < 2:1233661/91‑1 TCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAAT > 2:1171320/1‑72 TCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAAT < 1:1171320/72‑1 ATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGACCACTTCATGATCTTCATT > 1:1483202/1‑139 ATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGT < 1:891484/78‑1 ATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGT > 2:891484/1‑78 TATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCA > 2:22693/1‑53 TATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCA < 1:22693/53‑1 GGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGACCACTTCATGATCTTCATTTTCCTGC > 2:599160/1‑139 GGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGACCACTTCATGATCTTCATTTTCCTGC > 1:1477004/1‑139 GGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGACCACTTCATGATCTTCATTTTCCTGC > 1:631541/1‑139 GGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGACCACTTCATGATCTTCATTTTCCTGC > 2:584384/1‑139 GGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGAC < 2:989798/114‑1 GGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGAC > 1:989798/1‑114 GGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATG < 2:687623/93‑1 GGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATG > 1:687623/1‑93 GGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCA > 2:172446/1‑47 GGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCA < 2:1266691/47‑1 GGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCA > 1:1266691/1‑47 GGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCA < 2:631575/47‑1 GGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCA > 1:631575/1‑47 GGACTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCA < 1:172446/47‑1 CTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGACCACTTCATGATCTTCATTTTCCTGCAAC > 1:1388295/1‑139 CTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGACCACT > 1:1048464/1‑115 CTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGACCACT < 2:1048464/115‑1 CTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATG > 2:15351/1‑90 CTTGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATG < 1:15351/90‑1 TGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGACCACTTCATGATCTTCATTTTCCTGCAACGA < 1:355896/139‑1 TGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGACCACTTCATGATCTTCATTTTCCTGCAACGA > 2:501390/1‑139 TGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCA < 1:537881/42‑1 TGTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCA > 2:537881/1‑42 GTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAAC > 1:976573/1‑61 GTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAAC < 2:976573/61‑1 GTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCA > 2:1294467/1‑41 GTTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCA < 1:1294467/41‑1 TTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCG < 2:12402/105‑1 TTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCG > 1:12402/1‑105 TTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAG > 1:986598/1‑89 TTCGCACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAG < 2:986598/89‑1 ACCTTCCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGACCACTTCATGATCTTCATTTTCCTGCAACGAAACTAAA > 1:1421424/1‑139 CCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGACCACTTCATGATCTTCATTTTCCTGCAACGAAACTAAATCAGT > 2:732556/1‑139 CCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAAC > 2:1377305/1‑50 CCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAAC > 1:1229990/1‑50 CCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAAC < 1:1377305/50‑1 CCCTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAAC < 2:1229990/50‑1 CTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3653099‑3653230‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAATTGAAACGCCTTTCACCCCTGCCATACCTTTTAATAATCGCAACAGGTCTTCTATCGACGTTGTGGCATGAAGCTGGATATCAATGGCGACCACTTCATGATCTTCATTTTCCTGCAACGAAACTAAATCAGT > NC_000913/3655259‑3655395 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |