| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4861171 | 29 (0.940) | 12 (0.410) | 6/272 | 2.9 | 31.3% | intergenic (‑77/+160) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
| ? | NC_002947 | = 4861264 | 25 (0.850) | intergenic (‑170/+67) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA | |||||
GCACGTAGTAGCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTC > NC_002947/4861025‑4861319 | gCACGTAGTAGCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGc < 1:447976/150‑1 (MQ=255) cACGTAGTAGCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGCCTGTGCCggcc < 1:59321‑M1/150‑5 (MQ=255) gCGATAAGTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTACGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCATAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCgg < 2:365904/150‑1 (MQ=255) aTAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTa > 1:471611/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCgg > 1:249549/1‑130 (MQ=255) gCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCgg < 2:249549/130‑1 (MQ=255) tccgccagcagttacAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCagcctcttcgcgggtaaacccgctcctacaggtac > 2:563197‑M1/8‑115 (MQ=255) ggCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGt > 1:293938/1‑150 (MQ=255) aCGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTcac > 1:333972/1‑150 (MQ=255) gCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACAt > 1:244334/1‑150 (MQ=255) gCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACAt > 2:172376/1‑150 (MQ=255) aGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGc < 2:471611/150‑1 (MQ=255) aCGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTCCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGt < 2:35982/150‑1 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGa < 2:154599/150‑1 (MQ=255) ggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGAt < 1:172376/150‑1 (MQ=255) cggcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCagcctcttcgcgggtaaacccgctcctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgccct > 2:626884‑M1/1‑87 (MQ=255) aTGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCagcctcttcgcgggtaaacccgctcctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggag > 2:609852‑M1/1‑79 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCagcctcttcgcgggtaaacccgctcctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgg < 1:609852‑M1/150‑75 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCgg < 1:3501/150‑1 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCgg < 1:3577/150‑1 (MQ=255) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCggg < 2:293938/150‑1 (MQ=255) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCagcctcttcgcgggtaaacccgctcctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggt < 1:563197‑M1/150‑77 (MQ=255) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCagcctcttcgcgggtaaacccgctcctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggt < 1:626884‑M1/150‑77 (MQ=255) tcttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTAcc < 1:274165/150‑1 (MQ=255) taaaatcttgcaaAGCAAAGTGGCATCTTGTGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGTCttgctcttcgcgggtaaacccgctcctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacc < 1:44635‑M1/145‑82 (MQ=255) ttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCggcctcttcgcgggtaaacccgctcctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagc > 2:716595‑M1/1‑67 (MQ=255) ttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCggcctcttcgcgggtaaacccgctcctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagc < 1:716595‑M1/139‑73 (MQ=255) tctcTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 2:333972/150‑1 (MQ=255) ttGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAag < 2:205223/150‑1 (MQ=255) caaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAgg > 1:608800/1‑150 (MQ=255) caaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAgg > 2:483220/1‑150 (MQ=255) aagaagaaGAGCAGCGTGGGGTGGGGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGcc < 2:424879/144‑1 (MQ=255) gCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg < 1:137713‑M2/150‑3 (MQ=255) cAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggc < 1:471589‑M2/150‑4 (MQ=255) aaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCCAGGGCGGTGATGCACCTGTAGGAAAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggccca < 1:117823‑M2/150‑7 (MQ=255) gagCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCggcctcttcgcgggtaaacccgctcctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcg < 2:484557‑M1/122‑74 (MQ=255) gagCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCcgcctcttcgcgggtaaacccgctcctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcg > 1:484557‑M1/1‑49 (MQ=255) gcagcTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGCCTGTGCGAGCCTCTTCGCGCGTAAACCCGCTTCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGcc > 1:125065/1‑149 (MQ=255) gtgCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACGAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACGACGATAcccc > 2:297613/1‑149 (MQ=255) gggTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGGGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGc < 2:488509/150‑1 (MQ=255) gggTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTCCCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGc < 2:244334/150‑1 (MQ=255) gACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg < 1:214682‑M2/103‑2 (MQ=255) gACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg > 2:214682‑M2/1‑102 (MQ=255) aCTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGgctgc > 2:308515/1‑150 (MQ=255) tgggccggcctcttcgcgggtaaaccctttcctacaggtgcatcaccgccctggggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctctt < 1:117823‑M1/147‑145 (MQ=255) gCCggcctcttcgcgggtaaacccgctcctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttg < 1:471589‑M1/150‑148 (MQ=255) gCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCgg < 1:630015/57‑1 (MQ=255) gCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCgg > 2:630015/1‑57 (MQ=255) ccggcctcttcgcgggtaaacccgctcctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgc < 1:137713‑M1/150‑149 (MQ=255) cggcctcttcgcgggtaaacccgctcctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtc < 1:214682‑M1/103‑103 (MQ=255) cggcctcttcgcgggtaaacccgctcctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtc > 2:214682‑M1/1‑1 (MQ=255) | GCACGTAGTAGCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTC > NC_002947/4861025‑4861319 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |