| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1780127 | 46 (1.020) | 18 (0.470) | 17/226 | 1.5 | 28.3% | intergenic (+44/+62) | PP_1587/dapC | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/N‑succinyl‑L,L‑diaminopimelate aminotransferase |
| ? | NC_002947 | = 1780151 | 52 (1.350) | intergenic (+68/+38) | PP_1587/dapC | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/N‑succinyl‑L,L‑diaminopimelate aminotransferase | |||||
CACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCAC > NC_002947/1780003‑1780299 | ccgatcttgggggatgaGGTGGTGCGGCAAGTCCTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTg > 1:294449‑M2/8‑149 (MQ=255) cTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTgtac > 1:712110‑M2/1‑146 (MQ=255) cTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTgtac < 1:35729‑M2/150‑5 (MQ=255) tggGGGATGAGGTGGTGCGGCGAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgt > 1:1017252‑M2/1‑142 (MQ=255) gAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTAAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGACCGCTCCCGCTCCTTCAGGTGCTACGCTTCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgtgggagcgg < 2:985063‑M2/150‑17 (MQ=255) aGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgtgg > 1:175911‑M2/1‑120 (MQ=255) aGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgtgg < 2:175911‑M2/130‑11 (MQ=255) tACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAggg < 1:527885/150‑1 (MQ=255) gggTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTg < 2:330056/150‑1 (MQ=255) ggTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACAGCGCTGAT‑TTCAAGCG‑CAGCGCAgtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaa > 1:554779‑M2/1‑113 (MQ=255) ggTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACAGCGCTGAT‑TTCAAG‑CGCAGCGCAgtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaa < 2:554779‑M2/142‑30 (MQ=255) aGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAg < 1:1057679/150‑1 (MQ=255) atGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTg > 2:2191/1‑150 (MQ=255) tgagGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCg > 1:976302/1‑139 (MQ=255) tgagGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCg < 2:976302/139‑1 (MQ=255) agGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAg > 1:1017158/1‑150 (MQ=255) agGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAg > 1:876887/1‑150 (MQ=255) gAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAggcgcgagg < 2:35729/150‑8 (MQ=255) aaCCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGcgcg > 2:314567/1‑150 (MQ=255) cTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAAt < 1:2191/150‑1 (MQ=255) tCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGAt > 1:47500/1‑114 (MQ=255) tCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGAt < 2:47500/114‑1 (MQ=255) cAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTccgccg > 2:711374/1‑150 (MQ=255) aaGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTGGATCAGCGGTTGTGCAGGAAGGCGCGAAGGCGCTCcgacgc > 1:235388/1‑150 (MQ=255) aCCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAAt > 2:686071/1‑132 (MQ=255) aCCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAAt < 1:686071/132‑1 (MQ=255) cccTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTTCGCTTGAAA‑T‑CAGCTCTATCCCTGTGAGAGCGGGCTTGCACGAGAAGGGGATGAACAACGGTTTTGCAGGAAGGCCCGAATGCGCTCCGCCGCTCCGATg > 2:49699/1‑150 (MQ=255) ccTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGc > 1:218119/1‑150 (MQ=255) ccTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGc > 1:16962/1‑150 (MQ=255) ccTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGc > 2:562683/1‑150 (MQ=255) aaGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGCGCCTGATGCCGAAAAGATGAATCAGCTGTTTTGCAGCAAGACGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCgg > 1:591677/1‑150 (MQ=255) ggCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGcc > 1:336689/1‑150 (MQ=255) ccTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGc > 2:840403/1‑150 (MQ=255) ccTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACGGGGACAGCGCTGATTTCAAGC‑G‑CAGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTACGCCGCTACGATGCATTCggaaagc > 2:858420/1‑145 (MQ=14) ttCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCgg > 2:297383/1‑150 (MQ=255) tCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGt < 1:711374/150‑1 (MQ=255) gcgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGc > 1:1131555/1‑150 (MQ=255) gcCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGaa > 2:726297/1‑97 (MQ=255) gcCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGaa < 1:726297/97‑1 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctcacccagtacttgccgcaccacct < 2:759390‑M2/150‑110 (MQ=255) cGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctcacccagtacttgccgcaccacctca < 2:1128350‑M2/150‑112 (MQ=255) cGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGccc < 2:16962/150‑2 (MQ=255) cGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGATGTATTTGTGGGACGGGGCGTGCCCGCGAAGTGGGGGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCa > 1:310906/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctcaccccgtacttgccgcaccacctcatcccc < 2:147549‑M2/150‑117 (MQ=255) ccACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatcca > 2:979944‑M2/1‑34 (MQ=255) ccACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatcca < 1:979944‑M2/116‑83 (MQ=255) ccACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCcgccgc < 1:560625/110‑1 (MQ=255) ccACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCcgccgc > 2:560625/1‑110 (MQ=255) cacaGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctcacccagtacttgccgcaccacctcatccccca < 2:1109284‑M2/150‑118 (MQ=255) cacaGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTAAATGCGGAAGAGCGCACGTCTGCGCTGGGGTTGAGCAGCGGGTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCa > 1:21373/1‑150 (MQ=255) acaGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGAt > 2:608795/1‑114 (MQ=255) acaGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGAt < 1:608795/114‑1 (MQ=255) aGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctcacccagtacttgc > 1:634067‑M2/1‑30 (MQ=255) aGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctcacccagtacttgc < 2:634067‑M2/129‑100 (MQ=255) aGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAcgc < 1:132669/150‑1 (MQ=255) tACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgtgggagcgggcctgcccgcgaagggacttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctcacccagtacttgccgcaccacctcatcccccaccagg < 2:1016285‑M2/150‑124 (MQ=255) ctgcgctgcgCTTGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatc < 2:316242‑M2/105‑81 (MQ=255) ctgcgctgcgCTTGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatc > 1:316242‑M2/1‑25 (MQ=255) tgcgctgcgcTTGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccag > 2:1091403‑M2/1‑24 (MQ=255) tgcgctgcgcTTGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccag < 1:1091403‑M2/86‑63 (MQ=255) gcgctgcgctTGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctcacccagtacttgccgcaccacctcatcccccaccaggtgct > 1:759390‑M2/1‑23 (MQ=255) cgctgcgctTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGc > 1:164711/1‑72 (MQ=255) cgctgcgctTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGc < 2:164711/72‑1 (MQ=255) cgctTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCgg < 1:297383/150‑1 (MQ=255) ttGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctca > 1:792958‑M2/1‑14 (MQ=255) ttGAAA‑T‑CAGCGCTgtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaagggccttgatagggtctacttgactgaacccaggttcgcctcactcatatccagctca < 2:792958‑M2/101‑88 (MQ=255) ttGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCcgccgc > 2:680401/1‑90 (MQ=255) ttGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCcgccgc < 1:680401/90‑1 (MQ=255) ttGAAA‑T‑CAGAGCTGTACATGTGGGAGAGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTTATAATCGGTTTTGGAGGAAGACGCGAATGCGCTCCGCAGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAAGCACCCGGCACCCGGGtt > 2:388565/1‑150 (MQ=255) aaa‑a‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACAAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCAc < 1:314567/150‑1 (MQ=255) cAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGAGTTCTGCCCa < 2:819519/150‑1 (MQ=255) aGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGc < 1:964830/56‑1 (MQ=255) aGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGc > 2:964830/1‑56 (MQ=255) aGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCAt < 2:310906/150‑1 (MQ=255) aGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCAAGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCAt < 1:985063/150‑1 (MQ=255) gcgcTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATc < 1:840403/150‑1 (MQ=255) cTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCAc < 2:21373/150‑1 (MQ=255) | CACCTGGTGGGGGATGAGGTGGTGCGGCAAGTACTGGGTGAGCTGGATATGAGTGAGGCGAACCTGGGTTCAGTCAAGTAGACCCTATCAAGGCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTACTGCGCTGCGCTTGAAA‑T‑CAGCGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGTTGATCAGCGGTTTTGCAGGAAGGCGCGAATGCGCTCCGCCGCTTCGATGCATTCGGCCAGCGGTGCAACCAGTGCCATGCGCACGCGCCCGGCACCCGGGTTCACCCCATCCAC > NC_002947/1780003‑1780299 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |