| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1114875 = | 57 (0.720) | 18 (0.280) | 16/216 | 4.1 | 26.6% | intergenic (‑64/+115) | rlmF/valS | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F/valine‑‑tRNA ligase |
| ? | NC_002947 | 1114951 = | 53 (0.820) | intergenic (‑140/+39) | rlmF/valS | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F/valine‑‑tRNA ligase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
GGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCACCGCAGGCGGGGCCTTGTCGAC > NC_002947/1114805‑1115100 | gggTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTTAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGaaa < 1:751759/150‑1 (MQ=255) tGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCg > 1:6055/1‑150 (MQ=255) tGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCg < 2:1062259/150‑1 (MQ=255) aGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGccc > 1:1179528/1‑150 (MQ=255) tataCGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACg > 1:1590701/1‑150 (MQ=255) gAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGtctc > 1:1627030/1‑150 (MQ=255) aGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGtctct > 1:1520302/1‑150 (MQ=255) gCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGtctctc < 1:591306/150‑1 (MQ=255) gCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGATGATGCGCCGACCTTTTAGATCTACAGGCCCCTCCCACATGATTGTGTC‑G‑CCGTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGCAAGCACCCTTGTGCTGCGAAAGGGTCGTACAGCGGCCCCAACGGtctctc < 2:932775/150‑1 (MQ=255) gaGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACa > 1:975662/2‑150 (MQ=255) aaGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTCGGGATTACa > 1:1576735/1‑150 (MQ=255) aaGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACa < 2:1576735/150‑1 (MQ=255) aGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAg < 2:1539400/150‑1 (MQ=255) aGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAg < 2:1520302/150‑1 (MQ=255) ccTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCt > 2:1358200/1‑150 (MQ=255) ccTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCt > 1:28187/1‑150 (MQ=255) ccTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGAGCGGC‑G‑CCATGAAGGTTGACACGAACCGGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCt > 1:1734643/1‑150 (MQ=38) ctgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAg > 2:1096618/1‑96 (MQ=255) ctgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAg < 1:1096618/96‑1 (MQ=255) cTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTc > 2:445399/1‑150 (MQ=255) cTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGAAATATAATGGCTGCACAGCGGCCCCAACGGTGTATATAGTGATTACAAGGCGGCAATGCTCGCATGCTGCTc > 1:540906/1‑150 (MQ=255) ttttGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAg < 2:1964620/125‑1 (MQ=255) ttttGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAg > 1:1964620/1‑125 (MQ=255) tttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGACGGCGCC‑AACCTTCAA‑GACGCCACCCTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCg > 2:374334/1‑150 (MQ=14) ttcgCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGACGGCGCCAA‑CCTTCAAGG‑CGCCACCCTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCAAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCgg > 1:1146486/4‑150 (MQ=11) cGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGaa < 1:1358200/150‑1 (MQ=255) cGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGaa < 2:122033/150‑1 (MQ=255) gACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACgg < 2:405802/101‑1 (MQ=255) gACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACgg > 1:405802/1‑101 (MQ=255) gACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGGTGCCCGGTGAAg > 1:906529/1‑150 (MQ=255) gACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAg > 1:922687/1‑150 (MQ=255) acacAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGAtt > 2:199978/1‑114 (MQ=255) acacAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGAtt < 1:199978/114‑1 (MQ=255) acacAAGGCCGCTCCCACAGGACGGCGCCAA‑CCTTCAAGG‑CGCCACCCTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGt > 2:1713359/1‑150 (MQ=17) aaGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGc < 2:6055/150‑1 (MQ=255) aaGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGc > 1:1908667/1‑150 (MQ=255) ggCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGt < 2:1540650/139‑1 (MQ=255) ggCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGt > 1:1540650/1‑139 (MQ=255) gCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAg > 2:913545/1‑150 (MQ=255) cGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAggg < 2:1590701/150‑1 (MQ=255) tCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCAAAAGGGctg > 1:1399359/1‑69 (MQ=255) tCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCAAAAGGGctg < 2:1399359/71‑3 (MQ=255) ggaggGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGa < 1:913545/150‑1 (MQ=255) gc‑g‑cCTTGAAGGTTGGCTCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCa > 2:752418/1‑150 (MQ=255) gc‑g‑cCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGAc < 1:221223/143‑1 (MQ=255) gc‑g‑cCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGAc > 2:221223/1‑143 (MQ=255) gc‑g‑cCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCa > 2:1959554/1‑150 (MQ=255) ccTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGa < 2:1155809/82‑1 (MQ=255) ccTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGa > 1:1155809/1‑82 (MQ=255) cTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGtc < 1:1592259/71‑1 (MQ=255) cTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGtc > 2:1592259/1‑71 (MQ=255) cTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCtt > 2:899066/1‑150 (MQ=255) ttGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAggg > 1:1822311/1‑127 (MQ=255) ttGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAggg < 2:1822311/127‑1 (MQ=255) ccGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTtct > 1:1486485/1‑150 (MQ=255) cctCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTtctc < 2:453374/148‑1 (MQ=255) cctCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCAAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGCGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTtctc < 2:1146486/148‑1 (MQ=255) cGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTtctc < 2:1734643/150‑1 (MQ=255) ccggtgGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGAt < 1:410741/147‑1 (MQ=255) ccTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGAt < 1:1704918/150‑1 (MQ=255) tgGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCt < 1:1445125/127‑1 (MQ=255) tgGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCt > 2:1445125/1‑127 (MQ=255) tgGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCAcc > 2:1494750/1‑150 (MQ=255) gAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCACCGCa < 2:1179528/150‑1 (MQ=255) ggCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCACCGCAg < 2:540906/149‑1 (MQ=255) gCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCACCGCAGGCgg < 1:374334/150‑1 (MQ=255) gCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCACCGCAGGCgg > 1:564104/1‑150 (MQ=255) ccTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCACCGCAGGCggg < 2:1627030/150‑1 (MQ=255) ccTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCACCGCAGGCggg < 1:205934/150‑1 (MQ=255) cTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCACCGCAGGCgggg < 1:1494750/150‑1 (MQ=255) ttGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTg > 1:1334893/1‑88 (MQ=255) ttGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTg < 2:1334893/88‑1 (MQ=255) gtCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTCCAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGCAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGGCTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCACCGCAGGCGGGGGCttt > 2:1563108/1‑149 (MQ=255) tCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGGTGTGGTCGTTCCTTCTCGATCACCGCAGGCGGGGCCTTGt > 1:1099130/1‑150 (MQ=255) gcgAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTgg < 2:1722760/82‑1 (MQ=255) gcgAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTgg > 1:1722760/1‑82 (MQ=255) gcgAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGTTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCACCGCAGGCGGGGCCTTGTcg > 1:1220825/1‑150 (MQ=255) gcgAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCACCGCAGGCGGGGc > 1:1489132/1‑143 (MQ=255) gcgAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCACCGCAGGCGGGGc < 2:1489132/143‑1 (MQ=255) gAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCACCGCAGGCGGGGCCTTGTcgac > 1:851899/1‑150 (MQ=255) | GGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGACTCGGCCAGCTTGGCGCGTTCCTTCTCGATCACCGCAGGCGGGGCCTTGTCGAC > NC_002947/1114805‑1115100 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |