| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 5734152 | 43 (1.140) | intergenic (‑122/+35) | proY/hutH | proline (histidine) APC transporter/histidine ammonia‑lyase | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAG > NC_002947/5733955‑5734246 | cGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTTAAGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGCACGGCCg > 2:342101/1‑150 (MQ=255) ggCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTcc < 2:300943/150‑1 (MQ=255) ggCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTcc < 1:339302/150‑1 (MQ=255) ggAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcac > 1:600311/1‑150 (MQ=255) gCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg < 2:203457/150‑1 (MQ=255) ctcGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGAAAGTTTTTGAGACCTTGGGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg < 1:9808/148‑1 (MQ=38) tGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCgcgcccgctcccacagaagtaggtgcaa > 2:978079‑M1/1‑122 (MQ=255) aaCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGc < 2:235374/150‑1 (MQ=255) aCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCt < 1:929345/127‑1 (MQ=255) aCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCt > 2:929345/1‑127 (MQ=255) cGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGTGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCAc < 1:902839/150‑1 (MQ=255) ggCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCCGCTGGGC‑GGCCCTTCGCGGGCgcgcccgctcccacagaagtaggtgcaaaacaccatcccct < 1:609982‑M1/150‑42 (MQ=255) gggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCtgt < 2:600311/150‑1 (MQ=255) ggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCtgtg > 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2:127678‑M1/150‑143 (MQ=255) gcgGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCgcccgcgaaggggctgcgcagcagccccctgaatctcacgaccacaaaaacaattcaaggacgtgacatgcaacaagctcaaggtctca < 2:894286‑M2/150‑90 (MQ=255) gggCgcgcccgctcccacagaagtaggtgcaaaacaccatcccctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggctgcgcagcagccccctgaatctcacgaccacaaaaacaattcaaggacgtgacatgcaa > 1:900167‑M1/1‑4 (MQ=255) gggCgcgcccgctcccacagaagtaggtgcaaaacaccatcccctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggctgcgcagcagccccctgaatctcacgaccacaaaaacaattcaaggacgtgacatgcaa < 2:900167‑M1/132‑129 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCtgt > 2:589996/1‑47 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCtgt < 1:589996/47‑1 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCgcccgcgaaggggctgcgcagcagccccctgaatctcacgaccacaaaaacaattcaa > 1:869708‑M2/1‑59 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCgcccgcgaaggggctgcgcagcagccccctgaatctcacgaccacaaaaacaattcaa < 2:869708‑M2/117‑59 (MQ=255) 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CGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAG > NC_002947/5733955‑5734246 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |