New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 337811 | 22 (0.560) | 14 (0.450) | 13/210 | 1.6 | 42.2% | intergenic (‑58/+71) | PP_0279/PP_0280 | hypothetical protein/amino acid ABC transporter permease |
? | NC_002947 | = 337839 | 21 (0.680) | intergenic (‑86/+43) | PP_0279/PP_0280 | hypothetical protein/amino acid ABC transporter permease |
CCAGCTGCAGGCTGGTGAAGGGGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/337639‑337811 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cttcgcgggcacgcccgctcccacaggtGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGACCAGTTCCT < NC_002947/337839‑337692 CCAGCTGCAGGCTGGTGAAGGGGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAATGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCG > 2:328300/1‑150 CTGCAGGCTGGTGAAGGGGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAATGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGG < 1:328300/150‑1 CTGCAGGCTGGTGAAGGGGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGG < 2:611812/150‑1 GCAGGCTGGTGAAGGGGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCA > 2:940328/1‑150 GCTGGTGAAGGGGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCC < 1:846116/150‑1 GCTGGTGAAGGGGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCC < 1:818420/150‑1 GGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTTGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAG < 1:140331/150‑1 GTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAG > 2:569990/1‑144 GTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAG < 1:569990/144‑1 ACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGG < 2:29591/120‑1 ACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGG > 1:29591/1‑120 CTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCTACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGC > 1:206946/1‑150 GGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACC < 1:639681/150‑1 GAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCA < 2:668594/92‑1 GAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCA > 1:668594/1‑92 TGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGC < 2:152716/127‑1 TGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGC > 1:152716/1‑127 TTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATAC < 1:284910/119‑1 TTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATAC > 2:284910/1‑119 GAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTG < 2:219007/108‑1 GAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTG > 1:219007/1‑108 GTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATAC > 1:355044/1‑97 GTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATAC < 2:355044/97‑1 GCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TG > 2:968372/1‑83 GCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TG < 1:968372/83‑1 TGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATAC > 1:62337/1‑73 TGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATAC < 2:62337/73‑1 GGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAA > 2:122006/1‑138 GGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAA < 1:122006/138‑1 ACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGG > 2:884561/1‑150 CCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCT > 1:354122/1‑150 CCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGG < 2:831013/146‑1 CCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGG > 1:831013/1‑146 CCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGACCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCT > 1:675716/1‑150 CGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTC > 2:814451/1‑150 CGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTC > 2:722651/1‑150 CTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGA > 1:102733/1‑150 CTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGA < 1:814451/150‑1 TCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGAC < 2:102733/150‑1 CCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGACCA < 1:860481/150‑1 CCACAGGTATAGCGCC‑ACATTCAAGGG‑TGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAA < 2:26372/125‑1 CCACAGGTATAGCGCC‑ACATTCAA‑GGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGTGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGACCc > 1:650199/1‑149 CCACAGGTATAGCGCC‑ACATTCAA‑GGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAA > 1:26372/1‑125 CCACAGGTATAGCGCC‑ACATTCAA‑GGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGACCA > 2:206946/1‑150 CACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAG < 1:693313/138‑1 CACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAG > 2:693313/1‑138 CACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGACCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGACCAc < 2:675716/150‑2 ACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATG < 2:862972/95‑1 ACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATG > 1:862972/1‑95 ACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCAAACAACCGTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGACCAGT > 2:280917/1‑150 ACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑CA‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGACCAGT > 1:624219/1‑150 GGTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGACCAGTTCC > 1:865048/1‑150 GTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCC < 1:856142/125‑1 GTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCC > 2:856142/1‑125 GTGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGCAGTTGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGACCAGTTCCT < 1:409166/150‑1 CCAGCTGCAGGCTGGTGAAGGGGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/337639‑337811 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cttcgcgggcacgcccgctcccacaggtGTAGCGCCAACCTTGAA‑TG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGACCAGTTCCT < NC_002947/337839‑337692 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |