| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 337811 | 22 (0.560) | 14 (0.450) | 13/210 | 1.6 | 42.2% | intergenic (‑58/+71) | PP_0279/PP_0280 | hypothetical protein/amino acid ABC transporter permease |
| ? | NC_002947 | = 337839 | 21 (0.680) | intergenic (‑86/+43) | PP_0279/PP_0280 | hypothetical protein/amino acid ABC transporter permease | |||||
TCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAA > NC_002947/337690‑337983 | tCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTac > 1:722651/1‑150 (MQ=255) aGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCAACTGCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACac < 1:409166‑M2/150‑3 (MQ=255) ggAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacc > 1:865048‑M2/1‑147 (MQ=255) aCTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCACGGTTGTTTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgt > 2:280917‑M2/1‑144 (MQ=255) aCTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑TG‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgt > 1:624219‑M2/1‑144 (MQ=255) gtgGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGTCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtg < 2:675716‑M2/149‑8 (MQ=255) tGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCC‑AACC‑TTGAATGT‑GGCGCTATacctgtgg > 2:206946‑M2/1‑142 (MQ=255) tGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgg < 1:860481‑M2/150‑9 (MQ=255) gggtCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCACGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCC‑AACC‑TTGAATGT‑GGCGCTATacctgtgg > 1:650199‑M2/2‑142 (MQ=255) gTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtggga < 2:102733‑M2/150‑11 (MQ=255) tCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggag > 1:102733‑M2/1‑139 (MQ=255) tCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggag < 1:814451‑M2/150‑12 (MQ=255) gAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcg > 2:722651‑M2/1‑137 (MQ=255) gAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcg > 2:814451‑M2/1‑137 (MQ=255) aGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGTCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgg > 1:675716‑M2/1‑136 (MQ=255) aGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgg > 1:354122‑M2/1‑136 (MQ=255) ccTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgt > 2:884561‑M2/1‑132 (MQ=255) ccTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgg > 1:831013‑M2/1‑132 (MQ=255) ccTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgg < 2:831013‑M2/146‑15 (MQ=255) cTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtg > 2:693313‑M2/1‑131 (MQ=255) cTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtg < 1:693313‑M2/138‑8 (MQ=255) gggTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACac > 2:856142‑M2/1‑123 (MQ=255) gggTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACac < 1:856142‑M2/125‑3 (MQ=255) ttAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcc < 1:122006‑M2/138‑22 (MQ=255) ttAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcc > 2:122006‑M2/1‑117 (MQ=255) ttAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCC‑AACC‑TTGAATGT‑GGCGCTATacctgtgg > 1:26372‑M2/1‑117 (MQ=255) ttAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCC‑A‑CCCTTGAATGT‑GGCGCTATacctgtgg < 2:26372‑M2/125‑9 (MQ=255) gggggCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAg < 1:626915/150‑1 (MQ=255) cATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgt > 1:862972‑M2/1‑89 (MQ=255) cATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgt < 2:862972‑M2/95‑7 (MQ=255) gtTTGGGGGGCCGCTTCCCGGCCACGCCCGCTCCCCCAGGTATCGGGCC‑A‑GA‑GTCAAGGTTGGTTCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTc < 2:409166/150‑1 (MQ=37) gCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCGGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGc > 2:571946/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTGTAGTGCCAA‑CC‑TTGAATG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCaa > 1:503807/1‑108 (MQ=11) cccGCTCCCACAGGTGTAGTGCCAA‑CC‑TTGAATG‑TGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCAc < 2:503807/109‑1 (MQ=11) ccACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACga > 2:791679/1‑150 (MQ=255) cacaGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctc > 1:219007‑M2/1‑35 (MQ=255) cacaGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctc < 2:219007‑M2/108‑74 (MQ=255) cacaGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCtt > 2:294642/1‑125 (MQ=255) cacaGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCtt < 1:294642/125‑1 (MQ=255) cacaGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACgag < 1:791679/150‑1 (MQ=255) acaGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACgaga > 2:903886/1‑150 (MQ=255) aGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGa < 1:273573/70‑1 (MQ=255) aGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGa > 2:273573/1‑70 (MQ=255) ggTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgaccagttcc < 1:639681‑M2/150‑120 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaa > 2:284910‑M2/1‑30 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaa < 1:284910‑M2/119‑90 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaac < 2:355044‑M2/97‑68 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaac > 1:355044‑M2/1‑30 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaacca < 2:62337‑M2/73‑44 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaacca > 1:62337‑M2/1‑30 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGACGTGCCCGCGGGGCAGTCAGTGAGGTCTAGGCCGCGGACCGCTTCTTTGACCCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCAc > 1:225498/1‑150 (MQ=255) gcgcC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttcca < 2:152716‑M2/127‑103 (MQ=255) gcgcC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttcca > 1:152716‑M2/1‑25 (MQ=255) ccgcC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTTTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGt > 2:674969/2‑150 (MQ=255) gcC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtaggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgaccagttcctgatcgag > 1:206946‑M2/1‑23 (MQ=255) c‑a‑ca‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgc > 2:968372‑M2/1‑21 (MQ=255) c‑a‑ca‑TTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgc < 1:968372‑M2/83‑63 (MQ=255) c‑a‑ca‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTg > 2:800898/1‑120 (MQ=255) c‑a‑ca‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTg < 1:800898/120‑1 (MQ=255) a‑ca‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAgcgc > 2:834983/1‑99 (MQ=255) a‑ca‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAgcgc < 1:834983/99‑1 (MQ=255) aaGGTTGGCGCTACACCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCt > 1:77493/1‑150 (MQ=255) ttGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTgcgg > 2:610782/1‑150 (MQ=255) cgcTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCgaa < 2:860481/150‑1 (MQ=255) | TCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CA‑TTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAACACGCCTGCGGCGAA > NC_002947/337690‑337983 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |