| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4159142 | 41 (1.330) | 10 (0.370) | 10/238 | 1.6 | 21.9% | intergenic (+46/‑163) | PP_3661/PP_3662 | membrane protein/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 4159170 | 35 (1.290) | intergenic (+74/‑135) | PP_3661/PP_3662 | membrane protein/hypothetical protein | |||||
CCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGC > NC_002947/4158994‑4159289 | cgaGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCNGNCTGGAGNCCGAGTCGGCTGNTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAngt < 1:432659/148‑1 (MQ=255) ccACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCTAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGcc > 1:65191/1‑150 (MQ=255) ccACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGcc > 1:113253/1‑150 (MQ=255) cACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtc > 1:548955‑M1/1‑138 (MQ=255) ggCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGaa < 1:454221/150‑1 (MQ=255) aCCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggt > 2:621085/1‑125 (MQ=255) aCCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggt < 1:621085/125‑1 (MQ=255) tGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacct < 2:548955‑M1/150‑32 (MQ=255) gATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGtgctg > 2:36425/1‑125 (MQ=255) gATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGtgctg < 1:36425/125‑1 (MQ=255) aTCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtag > 2:439071‑M1/1‑115 (MQ=255) tCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagc > 1:741818‑M2/1‑139 (MQ=255) aCCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcggg < 1:439071‑M1/150‑43 (MQ=255) aCCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTAACCTGGGGGTGGAGAAGCTGTTGGGGTGACTGGAGCCCGGGTCGGCTGCTTCGCCGGTAAAGCCGGTACTACAGGTTGGTGACGCCGGGACGACGGAAAGGGCACTGGAGTATCggg > 2:301381/1‑150 (MQ=255) aCCGGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGAGTGCCCTGGGGGTGCAGAAGTTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcggg > 1:154402‑M2/1‑136 (MQ=255) ccTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcgggt < 2:73165‑M2/150‑16 (MQ=255) cTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcgggtt < 2:682011‑M2/150‑17 (MQ=255) tgtgGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTc < 1:73165/150‑1 (MQ=255) tgGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCAc < 1:327711/150‑1 (MQ=255) tGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGAAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCcgc < 1:137281/150‑1 (MQ=255) gTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGa > 2:247195/1‑150 (MQ=255) ttGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGCTGCCTGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcgggtttacccgcgaa < 2:193946‑M1/150‑55 (MQ=255) gCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGGAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAgca < 2:113253/150‑1 (MQ=255) ggggggCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCTAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAgcagg < 2:65191/150‑1 (MQ=255) ggggggCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAgcagg > 2:22319/1‑150 (MQ=255) ggggggCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAgcagg < 1:247195/150‑1 (MQ=255) ggggggCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAgcagg < 1:682011/150‑1 (MQ=255) gggggCTTGCGATGACCCCGGGGCTGCAGAAGCTGTTGCGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcgggtttacccgcgaagcagcc < 2:345275‑M1/150‑61 (MQ=255) cccTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTTGAGACCGAGCTGCCTGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcgg > 2:362890‑M1/1‑75 (MQ=255) cccTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTTGAGACCGAGCTGCCTGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcgg < 1:362890‑M1/116‑42 (MQ=255) cccTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGCTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAgg > 2:180824/1‑150 (MQ=255) ccTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGt > 1:68610/1‑150 (MQ=255) tGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTcaca > 2:666666/1‑150 (MQ=255) gggCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTg > 2:255543/1‑150 (MQ=255) gACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctg < 2:195539‑M1/80‑33 (MQ=255) gACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctg > 1:195539‑M1/1‑48 (MQ=255) aCCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGATGCCCTGCAGATGGCGAGGCCCTTGTAGCAGTTGTGTAACTCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTTTAAAGGTTTATACCAGAGACCTCCGTTGCCGTCCACATTtc > 2:173783/1‑150 (MQ=16) cGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTc > 1:284110/1‑140 (MQ=255) cGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTc < 2:284110/140‑1 (MQ=255) gAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCg < 1:666666/150‑1 (MQ=255) ggCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcgggtttacccgcgaagcagccgactcggtctccagtcagcgcaacagcttctgcagccccggggtcatcgcaagccccc < 2:345275‑M2/150‑91 (MQ=255) gctgctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTg > 2:520974/1‑128 (MQ=255) gctgctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTg < 1:520974/128‑1 (MQ=255) gctgctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTAtgg > 1:752835/1‑150 (MQ=255) gctgctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTAt > 1:437410/1‑148 (MQ=255) gctgctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTAt < 2:437410/148‑1 (MQ=255) tgctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTAtggtg < 2:68610/150‑1 (MQ=255) ctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATggtggt < 1:22319/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcgggttcacccgcgaagcaggcagctcggtctccagtcagcccaacagcttctgcacccccagggtaatcgccagccccccgccaa < 2:193946‑M2/150‑97 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGgtggtg < 2:275784/143‑1 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGgtggtg > 1:275784/1‑143 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAaagaa < 1:255543/150‑1 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcgggtttacccgcgaagcagccgactcggtctccagtcagcccaacagcttctgcacccccagggtaatcgccagccccccgccaaccagccacag < 2:682011‑M1/150‑135 (MQ=255) aCCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcgggtttacccgcgaagcagccgactcggtctccagtcagcccaacagcttctgcacccccagggtaatcgccagccccccgccaaccagccacagg < 2:73165‑M1/150‑136 (MQ=255) cccGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcgggtttacccgcgaagcagccgactcggtctccagtcagcccaacaacttctgcacccccagggcactcgccagccccccgccaaccagccaccggt > 1:154402‑M1/1‑14 (MQ=255) cccGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcgggtttacccgcgaagcagccgactcggtctccagtcagcccaacagcttctgcacccccagggtaatcgccagccccccgccaaccagccacaggt < 1:439071‑M2/150‑109 (MQ=255) cccGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGAt > 2:353869/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGAt > 1:530770/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcgggttcacccgcgaagcaggcagctcggtctcaagtcagcccaacagcttctgcacccccaggg > 2:362890‑M2/1‑41 (MQ=255) ccGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcgggttcacccgcgaagcaggcagctcggtctcaagtcagcccaacagcttctgcacccccaggg < 1:362890‑M2/116‑76 (MQ=255) ccGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATg > 1:520797/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcgggtttacccgcgaagcagccgactcggtctccagtcagcccaacagcttctgcacccccagggtaatcgccagccccccgccaaccagccacaggttga > 1:741818‑M1/1‑11 (MQ=255) cTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcgggtttacccgcgaagcagccgactcggtctccagtcagcccaacagcttctgcacccccagggtaatcgccagccccccgccaaccagccacaggttgaggat > 2:439071‑M2/1‑35 (MQ=255) cTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTAc < 2:520797/150‑1 (MQ=255) aCAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGTATGTTTTAccc < 1:180824/150‑1 (MQ=255) cAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcgggtttacccgcgaagcagccgactcggtctccagtc > 1:195539‑M2/1‑32 (MQ=255) cAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcgggtttacccgcgaagcagccgactcggtctccagtc < 2:195539‑M2/80‑49 (MQ=255) aGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcgggttcacccgcgaagcagccgactcggtctccagtcagcccaacagcttctgcacccccagggtaatcgccagccccccgccaaccagccacaggttgaggatcgca < 2:548955‑M2/150‑120 (MQ=255) | CCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGC > NC_002947/4158994‑4159289 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |