| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 204059 = | 4 (0.140) | 4 (0.150) | 4/234 | NT | 36.7% | coding (9565/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
| ? | NC_002947 | 204088 = | 10 (0.370) | coding (9594/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein | |||||
GGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGC > NC_002947/203992‑204237 | gtcgttgtagacgtcatcaccctgagcagcgtgggtgtacggcgcgctggtttcaccggccttgatgGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGaaa < 2:566760‑M1/46‑1 (MQ=255)gtcgttgtagacgtcatcaccctgagcagcgtgggtgtacggcgcgctggtttcaccggccttgatgGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGaaa > 1:566760‑M1/68‑113 (MQ=255) cctgagcagcgtgggtgtacggcgcgctggtttcaccggccttgatgGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCAcc < 1:373787‑M1/30‑1 (MQ=255) cctgagcagcgtgggtgtacggcgcgctggtttcaccggccttgatgGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCAcc > 2:373787‑M1/48‑77 (MQ=255) aaCCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAAc > 2:588430/1‑150 (MQ=31) tcagggtCACGACCAGGTCGTAAGGCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGt > 1:22433/7‑150 (MQ=11) tttcaccggccttgatggtgacctgggcattgttgctcagggtcacCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAacgac < 2:566760‑M2/67‑1 (MQ=255) tttcaccggccttgatggtgacctgggcattgttgctcagggtcacCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAacgac > 1:566760‑M2/47‑113 (MQ=255) aCGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCa > 1:246049/1‑150 (MQ=34) gACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGACCAGATCAGCCTGGGAATCAACTCGGCGGTGGAcaccacg > 1:641913/1‑149 (MQ=255) ggtgacctgggcattgttgctcagggtcacCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAgg < 1:373787‑M2/47‑1 (MQ=255) ggtgacctgggcattgttgctcagggtcacCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAgg > 2:373787‑M2/31‑77 (MQ=255) gagccTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCAGCTCAAACCAGCGCGCCGTAAACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGCCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTTCGACCtt < 2:22433/147‑1 (MQ=11) CCCTGAGCAACAATTCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCg > 1:705598‑M1/1‑150 (MQ=255) CCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGTAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGa > 1:414848‑M1/1‑150 (MQ=255) cTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCgag > 1:463545/1‑150 (MQ=35) tGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCgaga > 2:707314/1‑150 (MQ=35) caaTGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGa < 2:246049/150‑1 (MQ=35) aaTGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAg > 1:594176/1‑150 (MQ=35) aaTGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAg > 1:599142/1‑150 (MQ=34) cAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAAc > 2:731961/1‑138 (MQ=37) cAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAAc < 1:731961/138‑1 (MQ=37) gtcacCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGt > 1:345897‑M2/6‑150 (MQ=255) acCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGcc > 2:219758‑M2/3‑150 (MQ=255) cATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCcgc > 1:643284/1‑150 (MQ=40) | GGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGC > NC_002947/203992‑204237 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |