| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2732251 | 23 (0.820) | 4 (0.150) | 4/234 | NT | 14.8% | coding (1545/2361 nt) | polB | DNA polymerase II |
| ? | NC_002947 | = 2732271 | 24 (0.900) | coding (1565/2361 nt) | polB | DNA polymerase II | |||||
CAAGCGCGAGGGCAATGCGCCGCTGTCGCAGGCCTTGAAAATCATCATGAATGCCTTTTATGGCGTGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGATGTGATCTACGGTGACACCGACTCCACCTTTGTCTGGCTCAAGGGTGCCCACGCCGAGGAAGACGCGGCGCGCATTGGCCGA > NC_002947/2732149‑2732410 | cAAGCGCGAGGGCAATGCGCCGCTGTCGCAGGCCTTGAAAATCATCATGAATGCCTTTTATGGCGTGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCATGGTGATCGACGA‑CGCCAGgcgcgggtcgaa > 1:399101‑M2/1‑123 (MQ=255)cAAGCGCGAGGGCAATGCGCCGCTGTCGCAGGCCTTGAAAATCATCATGAATGCCTTTTATGGCGTGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCATGGTGATCGACGA‑CGCCAGgcgcgggtcgaa < 2:399101‑M2/135‑13 (MQ=255) gCAGGCCTTGAAAATCATCATGAATGCCTTTTATGGCGTGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTa < 2:119536/150‑1 (MQ=255) ttGAAAATCATCATGAATGCCTTTTATGGCGTGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGcc < 2:444421/112‑1 (MQ=255) ttGAAAATCATCATGAATGCCTTTTATGGCGTGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGcc > 1:444421/1‑112 (MQ=255) ttGAAAATCATCATGAATGCCTTTTATGGCGTGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGAtgtg > 2:509221/1‑150 (MQ=255) ttGAAAATCATCATGAATGCCTTTTATGGCGTGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGAtgtg > 1:732816/1‑150 (MQ=255) tcatcaTGAATGCCTTTTATGGCGTGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGATGTGATCTACg < 1:509221/150‑1 (MQ=255) atGAATGCCTTTTATGGCGTGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGATGTGATCTACGGTGac > 2:673787/1‑150 (MQ=255) cTTTTATGGCGTGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGccacca < 2:53442/81‑1 (MQ=255) cTTTTATGGCGTGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAg > 1:21540/1‑112 (MQ=255) cTTTTATGGCGTGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAg < 2:21540/112‑1 (MQ=255) cTTTTATGGCGTGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGATGTGATCTACGGTGACACCGACTc > 2:508756/1‑150 (MQ=255) cTTTTATGGCGTGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑GCGTCGATCACCATGCGCGGccacca > 1:53442/1‑81 (MQ=255) ttttATGGCGTGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGAtgt > 1:199135/1‑128 (MQ=255) ttttATGGCGTGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGAtgt < 2:199135/128‑1 (MQ=255) ttttATGGCGTGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGATGTGATCTACGGTGACACCGACTcc > 1:68257/1‑150 (MQ=255) tGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGATGTGATCTACGGTGACACCGACTCCACCTTTGTCt < 2:68257/150‑1 (MQ=255) cTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGATGTGATCTACGGTGACACCGACTCCACCTTTGTCTGGCTCaa > 2:414537/1‑150 (MQ=255) ccAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGATGTGATCTACGGTGACACCGACTCCACCTTTGTCTGGCTCAAgg < 1:673787/150‑1 (MQ=255) cttcGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGATGTGATCTACGGTGACACCGACTCCACCTTTGTCTGGCTCAAGGGTGCCCACGCCGAGGa < 1:238995/150‑1 (MQ=255) ttcGACCCGTGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATTCGCCAAACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGATGTGATCTACGGTGACACCGACTCCACCTTTGTCTGGCTCAAGGGTGCCCACGCCGAGGaa > 2:47753/1‑150 (MQ=255) ttcGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGATGTGATCTACGGTGACACCGACTCCACCtt < 2:603742/119‑1 (MQ=255) ttcGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGATGTGATCTACGGTGACACCGACGCCACCtt > 1:603742/1‑119 (MQ=255) ccGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATgcgcgggtcgaagaaacggcaaccgctggagccaagcacgccataaaaggcattcatgat < 1:518357‑M2/86‑61 (MQ=255) ccGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATgcgcgggtcgaagaaacggcaaccgctggagccaagcacgccataaaaggcattcatgat > 2:518357‑M2/1‑26 (MQ=255) tcgATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGATGTGATCTACGGTGACACCGACTCCACCTTTGTCTGGCTCAAGGGTGCCCACGCCGAGGAAGACGCGGCGCGCATTGGCCga < 1:508756/150‑1 (MQ=255) tcgATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGATGTGATCTACGGTGACACCGACTCCACCTTTGTCTGGCTCAAGGGTGCCCACGCCGAGGAAGACGCGGCGCGCATTGGCCga < 1:414537/150‑1 (MQ=255) cATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGATGTGATCTACGGTGACACCGACTCCACCTTTGTCTGGCTCAAgg < 2:423031/104‑1 (MQ=255) cATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGATGTGATCTACGGTGACACCGACTCCACCTTTGTCTGGCTCAAgg > 1:423031/1‑104 (MQ=255) | CAAGCGCGAGGGCAATGCGCCGCTGTCGCAGGCCTTGAAAATCATCATGAATGCCTTTTATGGCGTGCTTGGCTCCAGCGGTTGCCGTTTCTTCGACCCGCGCCTGGCG‑TCGTCGATCACCATGCGCGGCCACCAGATCATGCGCCAGACCAGGTCCCTGATCGAGGCGTGTGGCTACGATGTGATCTACGGTGACACCGACTCCACCTTTGTCTGGCTCAAGGGTGCCCACGCCGAGGAAGACGCGGCGCGCATTGGCCGA > NC_002947/2732149‑2732410 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |