New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2872929 | 19 (0.820) | 3 (0.140) | 3/236 | NT | 13.1% | coding (189/1164 nt) | PP_2525 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2872955 | 22 (1.010) | coding (163/1164 nt) | PP_2525 | hypothetical protein |
TGGCAGGCCGAGGGTGATGGCAAAACCGAGGTCTTCGGTGGCAAAGCCCAGGCGCAGGCGCCTGACTTCGCTCGGATGCTGGCCTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCTTCGACCACACCGCCCTGTGCGGTTTCGGCCAGCAGGCGCAGCGCCTTGTACAGGTTGGATTTGCCGCTGCCGTTGGCACCGGTCACCAGGTTGAGTTGGCTCAGCGGCAGCACCAGGTGG > NC_002947/2872782‑2873076 | tGGCAGGCCGAGGGTGATGGCAAAACCGAGGTCTTCGTTGGCAAAGCCCAGGCGCAGGCGCCTGACTTCGCTCGGATGCTGGCCTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAAgc > 2:488623‑M1/1‑148 (MQ=255) aGGCCGAGGGTGATGGCAAAACCGAGGTCTTCGGTGGCAAAGCCCAGGCGCAGGCGCCTGACTTCGCTCGGATGCTGGCCTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGc > 2:578753/1‑150 (MQ=255) tCTTCGGTGGCAAAGCCCAGGCGCAGGCGCCGGACTTCGCTCGGATGCTGGCCTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCCGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCttcgacc < 2:346517‑M2/150‑8 (MQ=255) ggCAAAGCCCAGGCGCAGGCGCCTGACTTCGCTCGGATGCTGGCCTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAAgccctcgcccgtgaaggcgggctggattcgacctggtgggc < 1:488623‑M1/150‑42 (MQ=255) aaaGCCCAGGCGCAGGCGCCTGACTTCGCTCGGATGCTGGCCTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGc > 2:549266/1‑112 (MQ=255) aaaGCCCAGGCGCAGGCGCCTGACTTCGCTCGGATGCTGGCCTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGc < 1:549266/112‑1 (MQ=255) aaGCCCAGGCGCAGGCGCCTGACTTCGCTCGGATGCTGGCCTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCTTCGACCACACCGCCCtgt < 2:597918/150‑1 (MQ=255) aaGCCCAGGCGCAGGCGCCTGACTTCGCTCGGATGCTGGCCTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCTTCGACCACACCGCCCtgt > 1:597918/1‑150 (MQ=255) gtcaggcgcctgcgCCTGACTTCGCTCGGATGCTGGCCTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCTTCGACCACACCGCCCTGTGCg < 1:101996/148‑1 (MQ=255) gcgcCTGACTTCGCTCGGATGCTGGCCTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCTTCGACCACACCGCCCTGTGCGGTTTCGGCcag > 1:94798/1‑150 (MQ=255) ccTGACTTCGCTCGGATGCTGGCCTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCTTCGACCACACCGCCCTGTGCGGTTTCGGCcagcag > 2:348492/1‑150 (MQ=255) gACTTCGCTCGGATGCTGGCCTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCTTCGACCACACCGCCCTGTGCGGTTTCGGCCAGCAGgcg > 2:430653/1‑150 (MQ=255) tCGGATGCTGGCCTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCTTCGACCACACCGCCCTGTGCGGTTTCGGCCAGCAGGCGCAGCGCCt > 2:510743/1‑150 (MQ=255) tGGCCTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAAgccctcgcccgtgaaggcgggctggattcga > 2:264059‑M1/1‑69 (MQ=255) tGGCCTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAAgccctcgcccgtgaaggcgggctggattcga < 1:264059‑M1/100‑32 (MQ=255) gCCTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCTTCGACCACACCGCCCTGTGCGGTTTCGGCCAGCAGGCGCAGCGCCTTGTACAGGtt < 1:207527/150‑1 (MQ=255) gCCTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCCGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCTTCGACCACACCGCCCTGTGCGGTTTCGGCCAGCAGGCGCAGCGCCTTGTACAGGtt < 1:346517/150‑1 (MQ=255) cTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCTTCGACCACACCGCCCTGTGCGGTTTCGGCCAGCAGgc < 1:386662/129‑1 (MQ=255) cTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCTTCGACCACACCGCCCTGTGCGGTTTCGGCCAGCAGgc > 2:386662/1‑129 (MQ=255) gCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCTTCGACCACACCGCCCTGTGCGGTTTCGGCCAGCAGGCGCAGCGCCTTGTACAGGTTGGATTTGCCGc > 2:30677/1‑150 (MQ=255) cTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCTTCGACCACACCGCCCTGTGCGGTTTCGGCCAGCAGGCGCAGCGCCTTGTACAGGTTGGATTTGCCGCTGc > 1:51578/1‑150 (MQ=255) tCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCTTCGACCACACCGCCCTGTGCGGTTTCGGCCAGCAGGCGCAGCGCCTTGTACAGGTTGGATTTGCCGCTGCCGTTGGCACCGGTCACCAGGTTGAGTTgg < 1:249541/150‑1 (MQ=255) gCCCACCAGGTCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCttcgacctggtgggctggcccagaaaccagcgcacgaatgcggcgcggcgaagtgcccatccaaggccagcatccgagcgaagtcaggcgcctgcgcctgggctttgcc < 1:488623‑M2/150‑110 (MQ=255) accaGGTCGAATCGAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCTTCGACCACACCGCCCTGTGCGGTTTCGGCCAGCAGGCGCAGCGCCTTGTACAGGTTGGATTTGGCGTTGCCGTTGGCACCGGTCACCAGGTTGAGTTGGCTCAGCGgcagca > 2:479071/1‑150 (MQ=255) ggTCGAAgccctcgcccgtgaaggcgggctggattcgacctggtgggctggcccggaaaccagcgcacgaatgcggcgcggcgaagtgcccatccaaggccagcatccgagcgaagtccggcgcctgcgcctgggctttgccaccgaaga < 2:346517‑M1/150‑144 (MQ=255) ggTCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCTTCGACCACACCGCCCTGTGCGGTTTCGGCCAGCAGGCGCAGCGCCTTGTACAGGTTGGGTTTGCCGCTGCCGTTGGCACCGGTCGCAAGTGTTAGTTGGCTCAGCGGCAGCACCAg > 1:157037/1‑150 (MQ=255) tCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCttcgacctggtgggctggcccagaaaccagcgcacgaatgcggcgcggcgaagtgcccatccaaggcca > 2:264059‑M2/1‑31 (MQ=255) tCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCttcgacctggtgggctggcccagaaaccagcgcacgaatgcggcgcggcgaagtgcccatccaaggcca < 1:264059‑M2/100‑70 (MQ=255) gAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCTTCGACCACACCGCCCTGTGCGGTTTCGGCCAGCAGGCGCAGCGCCTTGTACAGGTTGGATTTGCCGCTGCCGTTGGCACCGGTCACCAGGTTGAGTTGGCTCAGCGGCAGCACCAggtgg < 2:71920/150‑1 (MQ=255) | TGGCAGGCCGAGGGTGATGGCAAAACCGAGGTCTTCGGTGGCAAAGCCCAGGCGCAGGCGCCTGACTTCGCTCGGATGCTGGCCTTGGATGGGCACTTCGCCGCGCCGCATTCGTGCGCTGGTTTCTGGGCCAGCCCACCAGGTCGAATCCAGCCCGCCTTCACGGGCGAGGGCTTCGACCACACCGCCCTGTGCGGTTTCGGCCAGCAGGCGCAGCGCCTTGTACAGGTTGGATTTGCCGCTGCCGTTGGCACCGGTCACCAGGTTGAGTTGGCTCAGCGGCAGCACCAGGTGG > NC_002947/2872782‑2873076 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |