New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2053804 | 22 (0.950) | 3 (0.140) | 3/240 | NT | 12.0% | coding (865/960 nt) | PP_1829 | alpha/beta family hydrolase |
? | NC_002947 | = 2053828 | 23 (1.040) | coding (841/960 nt) | PP_1829 | alpha/beta family hydrolase |
AGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATGCCATCGATCAGGACCAGTTGTGCATCTGGCTTGGCCGCTTTCAGCCGTTGGGCGTCGGCCACGTCCACCTGCACGTCGTTGCGCCCCTGCACGATCAGCGC > NC_002947/2053658‑2053945 | aGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGcgc > 1:216107‑M1/1‑147 (MQ=255) aGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCt > 1:281982/1‑150 (MQ=255) ctgTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTgg < 1:160690/150‑1 (MQ=255) tGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGcgcatcagccccaagggcatgagccagcagcgc < 2:216107‑M1/150‑34 (MQ=255) gagaCCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCCAAGGACAGCGCTTTATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTgg < 2:50097/150‑1 (MQ=255) cTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCAt < 2:181437/150‑1 (MQ=255) tGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATGCCATCGATCa < 1:502014/150‑1 (MQ=255) cTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATGCCATCGATCAGGa < 2:292559/150‑1 (MQ=255) gCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATGCCATCGATCAGGACCAGt > 1:252396/1‑150 (MQ=255) tCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATGCCATCGATCAGGACCAGTTGTGCATCTGGCTTGGCCGCTTTCa < 2:278160/150‑1 (MQ=255) acaATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATGCCATCGATCAGGACCAGTTGTGCATCTGGCTTGGCCGCTTTCAGc > 1:615350/1‑150 (MQ=255) caATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATGCCATCGATCAGGACCAGTTGTGCATCTGGCTTGGCCGCTTTCAGcc < 2:281982/150‑1 (MQ=255) aaTTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATGCCATCGATCAGGACCAGTTGTGCATCTGGCTTGGCCGCTTTCAGCCg > 2:539175/1‑150 (MQ=255) aTTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGAATGGGGGTCATGCCATCGATCAGGACCAGTTGTGCATCTGGCTTGGCCGCTTTCAGCCGt > 1:315845/1‑150 (MQ=255) tcgctcgcCCAGCTCACGCGCCAGCGGCCGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATGCCATCGATCAGGACCAGTTGTGCATCTGGCTTGGCCGCTTTCAGCCGTTg < 1:528416/150‑1 (MQ=255) cccAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATGCCATCGATCAGGACCAGTTGTGCATCTGGCTTGGCCGCTTTCAGCCGTTGGGCGTCg < 1:67847/150‑1 (MQ=255) cccAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATGCCATCGATCAGGACCAGTTGTGCATCTGGCTTGGCCGCTTTCAACCGTTGGGCGTCg > 2:352347/1‑150 (MQ=255) ccAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATGCCATCGATCAGGACCAGTTGTGCATCTGGCTTGGCCGCTTTCAGCCGTTGGGCGTCgg > 1:332235/1‑150 (MQ=255) ccAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATGCCATCGATCAGGACCAGTTGTGCATCTGGCTTGGCCGCTTTCAGCCGTTGGGCGTCgg > 1:190098/1‑150 (MQ=255) cAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGcgcatcagccccaagggcatga > 1:171986‑M1/1‑51 (MQ=255) cAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGcgcatcagccccaagggcatga < 2:171986‑M1/73‑23 (MQ=255) aCGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATGCCATCGATCAGGACCAGTTGTGCATCTGGCTTGGCCGCTTTCAGCTGTTGGGCGTCGGCCACGTc > 2:616453/1‑150 (MQ=255) aCGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATGCCATCGATCAGGACCAGTTGTGCATCTGGCTTGGCCGCTTTCAGCCGTTGGGCGTCGGCCACGTc > 2:600359/1‑150 (MQ=255) ccAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATACCATCGATCAGGACCAGTTGTGCATCTGGCTTGGCCGCTTTCAGCCGTTGGGCGTCGGCCACGTCCACCt > 2:161107/1‑150 (MQ=255) cAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATGCCATCGATCAGGACCAGTTGTGCATCTGGCTTGGCCGCTTTCAGCCGtt > 2:374918/1‑128 (MQ=255) cAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATGCCATCGATCAGGACCAGTTGTGCATCTGGCTTGGCCGCTTTCAGCCGtt < 1:374918/128‑1 (MQ=255) tCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATGCCATCGATCAGGACCAGTTGTGCATCTGGCTTGGCCGCTTTCAGCCGTTGGGCGTCGGCCACGTCCACCTGCACGTCGTTg < 2:252396/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGcagcagcgcgacagctacctcaaccccgagctgccgctggcgcgtgagctgggcgagcgaattgtgacgttcatccagcatttgccttcggcgtaagtcaaacaggctcaggtctca < 2:216107‑M2/150‑118 (MQ=255) | AGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGCTGATGCGCAGCATGTGGTTCATGCCATCGATCAGGACCAGTTGTGCATCTGGCTTGGCCGCTTTCAGCCGTTGGGCGTCGGCCACGTCCACCTGCACGTCGTTGCGCCCCTGCACGATCAGCGC > NC_002947/2053658‑2053945 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |