| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3644951 = | 16 (0.690) | 5 (0.230) | 5/240 | NT | 24.2% | intergenic (‑3/+63) | PP_3211/PP_3212 | ABC transporter ATP‑binding protein/Rieske 2Fe‑2S family protein |
| ? | NC_002947 | 3644975 = | 16 (0.720) | intergenic (‑27/+39) | PP_3211/PP_3212 | ABC transporter ATP‑binding protein/Rieske 2Fe‑2S family protein | |||||
GGCATGGGTGCCATTGCTGTAGGTTTTTTCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGAT > NC_002947/3644826‑3645101 | cggacaagcccgggttggttatccgtcggcaactactgggtctgcttgaagcccatggcgagagcgaagtgttcctcagccactgacacttgcccaacgacccaatacaccggggcatacaccacCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCgg > 1:569244‑M1/126‑150 (MQ=255) tGCCATTGCTGTAGGTTTTTTCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTAt < 2:91247/150‑1 (MQ=255) gCCATTGCTGTAGGTTTTTTCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATg > 1:494818/1‑150 (MQ=255) cATTGCTGTAGGTTTTTTCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGcc > 2:559181/1‑150 (MQ=255) gTTTTTTCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCg > 2:249918/1‑150 (MQ=255) ccTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTggg < 1:559181/150‑1 (MQ=255) ccTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTACGCCCCGGTGCGCCGGGGcatacac < 1:122577/150‑7 (MQ=255) tactgggtctgcttgaagcccatggcgagagcgaagtgttcctcagccactgacacttgcccaacgccccggtgcgccggggcatacaccacCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTAt > 1:554761‑M1/93‑125 (MQ=255) tactgggtctgcttgaagcccatggcgagagcgaagtgttcctcagccactgacacttgcccaacgccccggtgcgccggggcatacaccacCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTAt < 2:554761‑M1/33‑1 (MQ=255) cTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGc > 1:512563/1‑150 (MQ=255) gaagcccatggcgagagcgaagtgttcctcagccactgacacttgcccaacgccccggtgcgccggggcatacaccacCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCggt > 1:269121‑M1/79‑104 (MQ=255) gaagcccatggcgagagcgaagtgttcctcagccactgacacttgcccaacgccccggtgcgccggggcatacaccacCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCggt < 2:269121‑M1/26‑1 (MQ=255) ggCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATggg > 1:177009/1‑150 (MQ=255) ggCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATggg > 1:213998/1‑150 (MQ=255) cAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCt < 2:494818/150‑1 (MQ=255) gggCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGATCTCGCCATGGGCTTc < 2:512563/150‑1 (MQ=255) ccTGCGTCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAg < 1:490449/150‑1 (MQ=255) cTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGAccc > 2:414544/1‑150 (MQ=255) ccTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGccc > 2:221284/1‑149 (MQ=255) aTCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCgg < 2:213998/150‑1 (MQ=255) atacaccaccgctcatgacccacggggagagcgGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCagta > 1:554761‑M2/34‑125 (MQ=255) atacaccaccgctcatgacccacggggagagcgGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCagta < 2:554761‑M2/92‑1 (MQ=255) cAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCCAATCAGAGGTGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGc < 1:414544/150‑1 (MQ=255) accgctcatgacccacggggagagcgGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTc < 2:269121‑M2/78‑1 (MQ=255) accgctcatgacccacggggagagcgGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTc > 1:269121‑M2/27‑104 (MQ=255) ccgctcatgacccacggggagagcgGTGGTGTATGCCCCGGTGTATTGGGTCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCg > 1:569244‑M2/26‑150 (MQ=255) GCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCTAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGAt > 1:249918‑M1/1‑150 (MQ=255) | GGCATGGGTGCCATTGCTGTAGGTTTTTTCCACCTGATTGGCGAACAAAGGGGTGTCCACACCGATGGTGTTCGGCAGGGCCTGCGGCTGGACGTCGGCCTTGGATAGGGTCTGCATCAACATAGCGCTCTCCCCGTGGGTCATGAGCGGTGGTGTATGCCCCGGCGCACCGGGGCGTTGGGCAAGTGTCAGTGGCTGAGGAACACTTCGCTCTCGCCATGGGCTTCAAGCAGACCCAGTAGTTGCCGACGGATAACCAACCCGGGCTTGTCCGAT > NC_002947/3644826‑3645101 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |