New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 375999 = | 29 (1.250) | 3 (0.140) | 3/232 | NT | 9.9% | coding (43/771 nt) | PP_0313 | electron transfer flavoprotein subunit beta |
? | NC_002947 | 376055 = | 28 (1.310) | coding (99/771 nt) | PP_0313 | electron transfer flavoprotein subunit beta |
GACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCATAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCAACCGGCCGGGGCCGATGTGCTGGGCGTGCTGGGCGATTA > NC_002947/375908‑376204 | gtccaggcccatgcccaggtaagcgcgcaaggcctcttcctgtggattgcccgcatgcaccacctgcaagttatccccagccagctgcaaaCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGttt > 2:397719‑M1/92‑150 (MQ=255) gACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCATAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGttt < 2:570389/150‑1 (MQ=255) aaCTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCATAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCa > 1:427856/1‑150 (MQ=255) aCTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCCACACGGCATAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAg > 1:391504/1‑150 (MQ=255) cTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCATAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAgc > 2:367382/1‑150 (MQ=255) aGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCATAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGctggctgg < 2:179596/150‑1 (MQ=255) gCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCATAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGCTTGCAGCTGGCTggg > 2:430322/1‑150 (MQ=255) cgcgACGCGGCATAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCa < 1:35740/150‑1 (MQ=255) gcgACGCGGCATAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAg < 1:26658/150‑1 (MQ=255) aTAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATg > 1:574910/1‑150 (MQ=255) tACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTCCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCCGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGATGGTGCCTGAGGGCACTCCACAggcaca > 2:496861/1‑146 (MQ=255) tCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCgg < 1:128642/123‑1 (MQ=255) tCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCgg > 2:128642/1‑123 (MQ=255) tttCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTgg < 1:367382/150‑1 (MQ=255) tttCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTgg > 2:258608/1‑150 (MQ=255) cATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCAt < 2:404193/150‑1 (MQ=255) ttGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTAAACTGGGCATgg > 2:111210/1‑150 (MQ=255) ccACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGa > 1:92419/1‑150 (MQ=255) ccACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATACACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGa < 1:385893/150‑1 (MQ=255) aaacccagctccacggcacgggcatcctgctcggcgcggcgggcgcggccggagctgggTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGac > 2:397719‑M2/60‑150 (MQ=255) CCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGaccac > 2:574910‑M1/1‑150 (MQ=255) ccagctccacggcacgggcatcctgctcggcgcggcgggcgcggccggagctgggTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGaccacc > 1:530108‑M2/56‑150 (MQ=255) AGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCAACTc < 2:294663‑M1/150‑1 (MQ=255) CTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGCATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCATTCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGa > 2:512622‑M1/1‑150 (MQ=255) CGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGa > 1:537992‑M1/1‑138 (MQ=255) CGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGa < 2:537992‑M1/138‑1 (MQ=255) cgcccgccGCGCCGAGCAGGCTGCCCGTGCCGTGGAGCTTGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGa < 1:130710/150‑1 (MQ=255) cgcccgccGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGa > 1:77175/1‑150 (MQ=255) cgcccgccGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGa < 2:54448/150‑1 (MQ=255) cgggcatcctgctcggcgcggcgggcgcggccggagctgggTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAg < 1:397719‑M2/109‑1 (MQ=255) ccgccgCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCa > 2:370340/1‑150 (MQ=255) gccgcgccgAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAgacag < 1:21542/150‑5 (MQ=255) gccgcgccgAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCAAc < 2:117367/150‑1 (MQ=255) cgcgccgAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCAAccg < 1:258608/150‑1 (MQ=255) cgAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCAAccggccgg > 2:19905/1‑150 (MQ=255) aGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCAACCGGCCgggg < 1:19905/150‑1 (MQ=255) gCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCAACCGGCCGGGGc < 2:427856/150‑1 (MQ=255) ccgtgccgtgGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCAACCGGCCGGGGCCGATgtgct > 1:461229/1‑150 (MQ=255) tgggTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCAACCGGCCGGGGCCGATGtgctgggcgtgctgggcg > 2:311910‑M2/5‑150 (MQ=255) gTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCGAAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCAGCCGGCCGGGGCCGATGTGCTGGGCGTGCTGGGCGAtt > 1:506230‑M2/2‑150 (MQ=255) gTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCAACCGGCCGGGGCCGATGTGCTGGGCGTGCTGGGCGAtt < 1:496861‑M2/149‑1 (MQ=255) tttGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCAACCGGCCGGGGCCGATGTGCTGGGCGTGCTGGGCGATTa > 2:298958/1‑150 (MQ=255) | GACAACTACCGCAGCGGCAGCCAGCGCGACGCGGCATAAGGGCACGAGCATGAGTACGAAAGTGATCAGCCTGGTTTCCATTGGTGCCCACCCCAGCTCCGGCCGCGCCCGCCGCGCCGAGCAGGATGCCCGTGCCGTGGAGCTGGGTTTGCAGCTGGCTGGGGATAACTTGCAGGTGGTGCATGCGGGCAATCCACAGGAAGAGGCCTTGCGCGCTTACCTGGGCATGGGCCTGGACCACCTCGACGTGCTGGAGCAACCGGCCGGGGCCGATGTGCTGGGCGTGCTGGGCGATTA > NC_002947/375908‑376204 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |