| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5506609 = | 82 (1.710) | 8 (0.210) | 10/210 | 2.7 | 12.9% | intergenic (+20/‑179) | PP_4839/cycA | iron‑regulated membrane protein/D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease |
| ? | NC_002947 | 5506680 = | 44 (1.180) | intergenic (+91/‑108) | PP_4839/cycA | iron‑regulated membrane protein/D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
TGGAAGGCGGCAGTGGCCGTGATGCTGGTGCTGGGGGTGATGTT‑CCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTT > NC_002947/5506461‑5506749 | tGGAAGGCGGCAGTGGCCGTGATGCTGGTGCTGGGGGTGATGTT‑CCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTTGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTgg > 1:674625/1‑150 (MQ=255) gtgcggttcatctgtcgctatgggtgaggtttgcgtcataggctgcagtcttcttgtcagaggtagccggctaggctaacacgcgcgttccagatcggggcgcgacagatcgactctgcattttcggctcagcatttcgcctgtaccGGc > 1:795336‑M1/148‑150 (MQ=255) tgcggttcatctgtcgctatgggtgaggtttgcgtcataggctgcagtcttcttgtcagaggtagccggctaggctaacacgcgcgttccagatcggggcgcgacagatcgactctgcattttcggctcagcatttcgcctgtaccGGcc > 1:705070‑M1/147‑150 (MQ=255) aaGGCGGCAGTGGCCGTGATGCTGGTGCTGGGGGTGATGTT‑CCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGACTTGGACAGCGCTTGAGCGTTGTGTTGCCTGTGCTGGCct > 1:864271/1‑150 (MQ=255) gcggcAGTGGCCTTGATGCTGGTGCTGGGCGTGGAGTTAACCCCTTGTTTCTTT‑TCTGTGGTTGTGATGTGGCCTTTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCtt < 1:865056/150‑1 (MQ=255) aGTGGCCGTGATGCTGGTGCTGGGGGTGATGTT‑CCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTTGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCgg < 1:1073285/150‑1 (MQ=255) tctgtcgctatgggtgaggtttgcgtcataggctgcagtcttcttgtcagaggtagccggctaggctaacacgcgcgttccagatcggggcgcgacagatcgactctgcattttcggctcagcatttcgcctgtaccGGCCTCTTCGCgg < 1:723769‑M1/13‑1 (MQ=255) ctgtcgctatgggtgaggtttgcgtcataggctgcagtcttcttgtcagaggtagccggctaggctaaaacgcgcgttccagatcggggcgcgacagatcgactctgcattttcggctcagcatttcgcctgtaccGGCCTCTTCGCggg > 2:1023301‑M1/137‑150 (MQ=255) gtcgctatgggtgaggtttgcgtcataggctgcagtcttcttgtcagaggtagccggctaggctaacacgcgcgttccagatcggggcgcgacagatcgactctgcattttcggctcagcatttcgcctgtaccGGCCTCTTCGCGGGTa < 1:261703‑M1/16‑1 (MQ=255) tcgctatgggtgaggtttgcgtcataggctgcagtcttcttgtcagaggtagccggctaggctaacacgcgcgttccagatcggggcgcgacagatcgactctgcattttcggctcagcatttcgcctgtaccGGCCTCTTCGCGggttt < 1:656208‑M1/17‑3 (MQ=255) tcgctatgggtgaggtttgcgtcataggctgcagtcttcttgtcagaggtagccggctaggctaacacgcgcgttccagatcggggcgcgacagatcgactctgcattttcggctcagcatttcgcctgtaccGGCCTCTTCGCGGGTaa < 2:322634‑M1/17‑1 (MQ=255) cGTGATGCTGGTGCTGGGGGTGATGTT‑CGCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 2:90056/150‑1 (MQ=255) tatgggtgaggtttgcgtcataggctgcagtcttcttgtcagaggtagccggctaggctaacacgcgcgttccagatcggggcgcgacagatcgactctgcattttcggctcagcatttcgcctgtaccGGCCTCTTCGCGGGTAAAccc < 2:224013‑M1/21‑1 (MQ=255) gtgctggtgctggGGGTGATGGT‑CCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGCGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:142331/149‑1 (MQ=255) aTGCTGGTGCTGGGGGTGATGTT‑CCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:938252/150‑1 (MQ=255) ggtggtgctggGGGTGATGTT‑CCCGCTGGTGGGGGTCAACCGGGGGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:912918/148‑1 (MQ=38) gctggtgctggGGGTGATGTT‑CCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 2:164354/1‑150 (MQ=255) ggtgaggtttgcgtcataggctgcagtcttcttgtcagaggtagccggctaggctaacacgcgcgttccagatcggggcgcgacagatcgactctgcattttcggctcagcatttcgcctgtaccGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 2:723769‑M1/126‑150 (MQ=255) gtgaggtttgcgtcataggctgcagtcttcttgtcagaggtagccggctaggctaacacgcgcgttccagatcggggcgcgacagatcgactctgcattttcggctcagcatttcgcctgtaccGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 2:714745‑M1/26‑1 (MQ=255) tgaggtttgcgtcataggctgcagtcttcttgtcagaggtagccggctaggctaacacgcgcgttccagatcggggcgcgacagatcgactctgcattttcggctcagcatttcgcctgtaccGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:696913‑M1/23‑1 (MQ=255) tgaggtttgcgtcataggctgcagtcttcttgtcagaggtagccggctaggctaacacgcgcgttccagatcggggcgcgacagatcgactctgcattttcggctcagcatttcgcctgtaccGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc > 2:696913‑M1/124‑146 (MQ=255) gtgctggGGGTGATGTT‑CCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc > 2:620678/1‑150 (MQ=255) gggTGATGTT‑CCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGAc > 1:873343/1‑150 (MQ=255) aTGTT‑CCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc > 2:1027089/1‑132 (MQ=255) aTGTT‑CCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:1027089/132‑1 (MQ=255) tGTT‑CCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGtt < 2:873343/150‑1 (MQ=255) tt‑CCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTTCGA‑GGGGCCCCGgtgt > 2:898839/1‑150 (MQ=255) ggctgcagtcttcttgtcagaggtagccggctaggctaacacgcgcgttccagatcggggcgcgacagatcgactctgcattttcggctcagcatttcgcctgtaccGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTg < 1:1179450‑M1/43‑1 (MQ=255) tgccccgtggtggCTGTGTCGATGGTGGTGATGTTGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCTCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGt < 1:202293/143‑1 (MQ=38) ccGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAgg > 1:572908/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAgg > 2:660434/1‑150 (MQ=255) cGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAAcc > 1:456401/1‑122 (MQ=255) cGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAAcc < 2:456401/122‑1 (MQ=255) ggtggGGGTGTGGATGGTCGTGATGTGGGGGGTGGATAGTGTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCGTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGCTCCTACGA‑GGGATCGCGTTGTAGGAGCgg < 2:534790/150‑1 (MQ=39) ggtggGGGTGTCGAGGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCgg < 2:321596/150‑1 (MQ=255) ttcttgtcagaggtagccggctaggctaacacgcgcgttccagatcggggcgcgacagatcgactctgcattttcggctcagcatttcgcctgtaccGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCggg > 2:1179450‑M1/98‑150 (MQ=255) gtggGGGTGTGTATGGTGGTGTTGGGGGTGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGACGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGTGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCggg < 1:1144382/150‑1 (MQ=38) gtggGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCggg < 2:572908/150‑1 (MQ=255) gtggGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCggg > 1:509982/1‑150 (MQ=255) gtggGGGTGTCGATGGTGGCGATGCGCGGTGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCggg < 2:875592/150‑1 (MQ=255) gggTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTa > 2:700766/1‑150 (MQ=255) tcagaggtagccggctaggctaacacgcgcgttccagatcggggcgcgacagatcgactctgcattttcggctcagcatttcgcctgtaccGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCg < 2:838499‑M1/51‑1 (MQ=255) tcagaggtagccggctaggctaacacgcgcgttccagatcggggcgcgacagatcgactctgcattttcggctcagcatttcgcctgtaccGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCg > 1:838499‑M1/92‑142 (MQ=255) ggcGATGGTGGTGATGTGGGTGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCcg < 2:728630/148‑1 (MQ=255) tCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑gg > 2:512801/1‑121 (MQ=255) tCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑gg < 1:512801/121‑1 (MQ=255) tCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCggg < 2:238199/141‑1 (MQ=255) tCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCggg > 1:238199/1‑141 (MQ=255) gATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATGGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑g > 1:1059161/1‑118 (MQ=255) gATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATGGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑g < 2:1059161/118‑1 (MQ=255) gATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTcgc > 2:959098/1‑97 (MQ=255) gATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTcgc < 1:959098/97‑1 (MQ=255) aTGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa > 2:431571/1‑150 (MQ=255) aTGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 2:18573/150‑1 (MQ=255) ggtgATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGCGGTC‑CCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGc < 1:494890/150‑1 (MQ=21) ggggATGTGGGGCGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAA‑CGCGGTCCCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGc < 1:189668/147‑1 (MQ=18) tgtgGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTa < 2:983431/150‑1 (MQ=255) gtgGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGAGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCGTTGCGGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGAGAAGAGGCCGGTAc > 1:983570/1‑150 (MQ=38) ggggggTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAg < 2:947646/150‑1 (MQ=255) ggggggGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGGCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGCCCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGc < 2:963950/150‑1 (MQ=255) ggggTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGGCGGTACAGGc < 1:700766/150‑1 (MQ=255) ggATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAAt < 2:864271/150‑1 (MQ=255) aTAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑gg > 1:344891/1‑96 (MQ=255) aTAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑gg < 2:344891/96‑1 (MQ=255) ttGGTGGGGCGGCGCCGCCGGTGGTTGGCCAGTGCTTGAGCCCTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTTGCGCGTGACCCCGCTCCTACGA‑GGCACCGTGTTTTAGGAGCCGGTGTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGc < 2:347238/150‑1 (MQ=25) ggggcgcgacagatcgactctgcattttcggctcagcatttcgcctgtaccGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCgg > 2:1001330‑M1/52‑103 (MQ=255) ggggcgcgacagatcgactctgcattttcggctcagcatttcgcctgtaccGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCgg < 1:1001330‑M1/52‑1 (MQ=255) gcgcCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCag > 2:261703/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCag < 1:431571/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCa > 2:409264/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCa < 1:409264/149‑1 (MQ=255) gccgGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGCCg > 1:559149/1‑150 (MQ=255) 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tttGGCCAGCGCTTGGGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTc < 1:898839/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt > 1:688080/1‑57 (MQ=255) ccAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt < 2:688080/57‑1 (MQ=255) ccAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGcc > 2:1038163/1‑150 (MQ=255) aGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTACACGCGCTGCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGGAGAGGCGGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCAAAAATGCAGAGACGATCTGTcgcacgcc > 1:196686/1‑145 (MQ=37) cTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTATCACCGCGAAGAGGCCGATGAGATTGATATGTTTAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATc < 1:508953/150‑1 (MQ=25) tGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTg < 1:620678/150‑1 (MQ=255) gAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTGTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTgg > 1:270065/1‑150 (MQ=255) aGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGa < 2:974420/110‑1 (MQ=255) gCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGaa < 1:138046/150‑1 (MQ=255) ttGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAAcgc > 1:714745/1‑150 (MQ=255) gtTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCgt < 1:973380/150‑1 (MQ=255) gtTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCgt < 2:509982/150‑1 (MQ=255) ttGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTc < 2:376649/118‑1 (MQ=255) ttGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTc > 1:376649/1‑118 (MQ=255) gCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGtt > 1:889244/1‑150 (MQ=255) cTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCa < 1:338921/109‑1 (MQ=255) cTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCa > 2:338921/1‑109 (MQ=255) tgCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTcgc > 2:835342/1‑121 (MQ=255) tgCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTcgc < 1:835342/121‑1 (MQ=255) GGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAAcgc > 2:473315‑M1/1‑134 (MQ=255) GGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAAcgc < 1:473315‑M1/134‑1 (MQ=255) | TGGAAGGCGGCAGTGGCCGTGATGCTGGTGCTGGGGGTGATGTT‑CCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑GGGACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTT > NC_002947/5506461‑5506749 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |