New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 322577 = | 19 (0.820) | 3 (0.130) | 3/244 | NT | 13.3% | coding (1666/2070 nt) | PP_0267 | ferric siderophore receptor |
? | NC_002947 | 322613 = | 21 (0.940) | coding (1630/2070 nt) | PP_0267 | ferric siderophore receptor |
CCAGGTCACGAACAGGCTGCCATTGCGCTTGGCCACGTCATTGATGCGGTTGCCTTCCTGGCCGTTATTGTCCTTGACGATGATCGCATCCTGCAGGCCAATGCCGCCGCGTACATACCAGTTGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGAGCAAGATGATGTTCGGGTCGTTTGGGTCGCGGGTGCGGCGGTTGTAAAGTTCCAGCTCGTAGATGGCCAGGGTGGTGGTCAGGCGCTGATCCAACCAGTCGCTCTTTACGCCTA > NC_002947/322431‑322726 | ccAGGTCACGAACAGGCTGCCATTGCGCTTGGCCACGTCATTGATGCGGTTGCCTTCCTGGCCGTTATTGTCCTTGCCGATGATCGCATCCTGCAGGCCAATGCCGCCGCGTACATACCAGTTGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAg < 2:127054/150‑1 (MQ=255) gcTTGGCCACGTCATTGATGCGGTTGCCTTCCTGGCCGTTATTGTCCTTGACGATGATCGCATCCTGCAGGCCAATGCCGCCGCGTACATACCAGTTGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGc > 1:485767/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCACGTCATTGATGCGGTTGCCTTCCTGGCCGTTATTGTCCTTGACGATGATCGCATCCTGAAGGCCAATGCCGCCGCGTACATACCAGTTGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGcc > 2:259638/1‑150 (MQ=255) ccACGTCATTGATGCGGTTGCCTTCCTGGCCGTTATTGTCCTTGACGATGATCGCATCCTGCAGGCCAATGCCGCCGCGTACATACCAGTTGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGa > 2:239905/1‑150 (MQ=255) aCGTCATTGATGCGGTTGCCTTCCTGGCCGTTATTGTCCTTGACGATGATCGCATCCTGCAGGCCAATGCCGCCGCGTACATACCAGTTGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGAGc > 2:590427/1‑150 (MQ=255) aaagagcgactggttggatcagcgcctgaccaccaccctggccatctacgagctggaactttacaaccgccgcacccgcgacccaaacgacccgaacatcatcttgcTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGAGCAAgat > 2:471699‑M1/108‑150 (MQ=255) tGCGGTTGCCTTCCTGGCCGTTATTGTCCTTGACGATGATCGCATCCTGCAGGCCAATGCCGCCGCGTACATACCAGTTGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGCGCAAGATGATGt > 1:134605/1‑150 (MQ=255) gCGGTTGCCTTCCTGGCCGTTATTGTCCTTGACGATGATCGCATCCTGCAGGCCAATGCCGCCGCGTACATACCAGTTGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGAGCAAGATGATGtt < 1:415926/150‑1 (MQ=255) gTTGCCTTCCTGGCCGTTATTGTCCTTGACGATGATCGCATCCTGCAGGCCAATGCCGCCGCGTACATACCAGTTGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGAGCAAGATGATGTTCgg < 2:452164/150‑1 (MQ=255) ttCCTGGCCGTTATTGTCCTTGACGATGATCGCATCCTGCAGGCCAATGCCGCCGCGTACATACCAGTTGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGc < 1:14179/97‑1 (MQ=255) ttCCTGGCCGTTATTGTCCTTGACGATGATCGCATCCTGCAGGCCAATGCCGCCGCGTACATACCAGTTGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGc > 2:14179/1‑97 (MQ=255) ttCCTGGCCGTTATTGTCCTTGACGATGATCGCATCCTGCAGGCCAAGTCCGCCGCGTACATACCAGTTGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGAGCAAGATGATGTTCGGGTCGtt > 2:392974/1‑150 (MQ=255) tCCTGGCCGTTATTGTCCTTGACGATGATCGCATCCTGCAGGCCAATGCCGCCGCGTACATACCAGTTGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGAGCAAGATGATGTTCGGGTCGttt < 2:134605/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCGTTATTGTCCTTGACGATGATCGCATCCTGCAGGCCAATGCCGCCGCGTACATACCAGTTGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGAGCAAGATGATGTTCGGGTCGTTTg < 1:239905/150‑1 (MQ=255) ggCCGTTATTGTCCTTGACGATGATCGCATCCTGCAGGCCAATGCCGCCGCGTACATACCAGTTGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGAGCAAGATGATGTTCGGGTCGTTTGGGt > 1:432816/1‑150 (MQ=255) atctacgagctggaactttacaaccgccgcacccgcgacccaaacgacccgaacatcatcttgcTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGc > 1:559381‑M1/65‑87 (MQ=255) atctacgagctggaactttacaaccgccgcacccgcgacccaaacgacccgaacatcatcttgcTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGc < 2:559381‑M1/23‑1 (MQ=255) gCAGGACAATGCCGCCGCGTACATACCAGTGCCCGACGATGTTGCCGGTGGCATTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCGGCTGAGCAAGATGAGGTTCGGGTCGTTTGGGTCGCGGGTGCGGCGGTTGTAAAGTTCCAGCTCGt < 1:585662/150‑1 (MQ=255) gTACATACCAGTTGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGAGCAAGATGATGTTCGGGTCGTTTGGGTCGCGGGTGCGGCGGTTGTAAAGTTCCAGc < 2:116124/128‑1 (MQ=255) gTACATACCAGTTGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGAGCAAGATGATGTTCGGGTCGTTTGGGTCGCGGGTGCGGCGGTTGTAAAGTTCCAGc > 1:116124/1‑128 (MQ=255) aTACCAGTTGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGAGCAAGATGATGTTCGGGTCGTTTGGGTCGAAGGGACGGCGGTTGTAAAGTTCCAGCTCGTAGATGGCCAGGGTGGTGGTCAg > 1:193627/1‑150 (MQ=255) ttGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGAGCAAGATGATGTTCGGGTCGTTTGGGTCGCGGGTGCGGCGGTTGTAAAGTTCCAGCTCGTAGATGGCCAGGGTGGTGGTCAGGCGCTGa < 1:259638/150‑1 (MQ=255) tGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGAGCAAGATGATGTTCGGGTCGTTTGGGTCGCGGGTGCGGCGGTTGTAAAGTTCCAGCTCGTAGATGGCCAGGGTGGTGGTCAGGCGCTGAt < 1:590427/150‑1 (MQ=255) ccGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGAGCAAGATGATGTTCGGGTCGTTTGGGTCGCGGGTGCGGCGGTTGTAAAGTTCCAGCTCGTAGATGGCCAGGGTGGTGGTCAGGCGCTGATcc < 2:432816/150‑1 (MQ=255) ccGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGAGCAAGATGATGTTCGGGTCGTTTGGGTCGCGGGTGCGGCGGTTGTAAAGTTCCAGCTCGTAGATGGCCAGGGTGGTGGTCAGGCGCTGATcc < 2:485767/150‑1 (MQ=255) gTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGAGCAAGATGATGTTCGGGTCGTTTGGGTCGCGGGTGCGGCGGTTGTAAAGATCCAGCTCGTAGATGGCCAGGGTGGTGGTCAGGCGCTGATCCAACCAGTCGCTCTTTACGCCt > 2:248146/1‑150 (MQ=255) TCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGAGCAAGATGATGTTCGGGTCGTTTGGGTCGCGGGTGCGGCGGTTGTAAAGTTCCAGCTCGTAGATGGCCAGGGTGGTGGTCAGGCGCTGATCCAACCAGTCGCTCTTTACGCCTa < 2:604649‑M1/150‑1 (MQ=255) | CCAGGTCACGAACAGGCTGCCATTGCGCTTGGCCACGTCATTGATGCGGTTGCCTTCCTGGCCGTTATTGTCCTTGACGATGATCGCATCCTGCAGGCCAATGCCGCCGCGTACATACCAGTTGCCGACGATGTTGCCGGTGGCAGTCAGCTCGATGCCGCGTGAACGCTGCATGCCGCTGAGCAAGATGATGTTCGGGTCGTTTGGGTCGCGGGTGCGGCGGTTGTAAAGTTCCAGCTCGTAGATGGCCAGGGTGGTGGTCAGGCGCTGATCCAACCAGTCGCTCTTTACGCCTA > NC_002947/322431‑322726 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |