New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4065632 = | 27 (1.160) | 3 (0.130) | 3/246 | NT | 10.5% | coding (372/1491 nt) | PP_3582 | RND transporter outer membrane protein |
? | NC_002947 | 4065689 = | 25 (1.110) | coding (315/1491 nt) | PP_3582 | RND transporter outer membrane protein |
AGGGTTTCGCGCAGCTTGCCCCACAGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGTTGAGCTCTTCGACCAGCGCATTGAGCCCAGCATCGCCGTAGATTTCC > NC_002947/4065486‑4065779 | ccgaaggctggacccaggcctcgccgtccgacgccatcgcccgcggcgcctggtgggaaatctacggcgatgctgggctcaatgcgctggtcgaagagctcaaccgcagcaaccagaccgtggcgcaatcagaagcccagtatcgcCAgg < 1:483520‑M1/4‑1 (MQ=255) gcAGCTTGCCCCACAGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTgg > 2:418780/1‑150 (MQ=255) gCCCCACAGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAg < 1:280703/150‑1 (MQ=255) cccACAGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAgcg > 1:600986/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAgcgc > 1:219789/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAgcgc < 1:268408/150‑1 (MQ=255) gATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGgct > 2:235143/1‑150 (MQ=255) ccAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCgcct > 2:484067/1‑150 (MQ=255) ccAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCgcct > 1:364128/1‑150 (MQ=255) tGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCgcctgggcc > 1:247167/1‑150 (MQ=255) tGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCgcctgggcc > 1:481376/1‑150 (MQ=255) gggaaatctacggcgatgctgggctcaatgcgctggtcgaagagctcaaccgcagcaaccagaccgtggcgcaatcagaagcccagtatcgcCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCgcctgggcctgg > 2:415961‑M1/93‑150 (MQ=255) ttGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCt > 1:148808/1‑150 (MQ=255) ttGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCt > 1:553749/1‑150 (MQ=255) gCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTc > 2:400389/1‑150 (MQ=255) cGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCt < 1:418780/150‑1 (MQ=255) cGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCt < 1:400389/150‑1 (MQ=255) ctcaatgcgctggtcgaagagctcaaccgcagcaaccagaccgtggcgcaatcagaagcccagtatcgcCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCgcctgg < 1:292719‑M1/52‑1 (MQ=255) ctcaatgcgctggtcgaagagctcaaccgcagcaaccagaccgtggcgcaatcagaagcccagtatcgcCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCgcctgg > 2:292719‑M1/70‑121 (MQ=255) gACAGGCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTtg > 2:422082/1‑150 (MQ=255) cAGGCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGGtgct > 2:3704/1‑150 (MQ=255) ggCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTtgctgc < 2:481376/150‑1 (MQ=255) cTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCTCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGGTGCTGCgg > 1:502488/1‑150 (MQ=255) aCTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGTTGAg > 2:490257/1‑150 (MQ=255) gCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGTTGAGCTCTTCGAc > 1:73629/1‑150 (MQ=255) ggTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGTTGAGCTCTTCGACCAg < 2:247167/150‑1 (MQ=255) gTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGTTGAGCTCTTCGACCAgc < 2:219789/150‑1 (MQ=255) gTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGTTGAGCTCTTCGACCAgc < 1:422082/150‑1 (MQ=255) cTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGTTGAGCTCTTCGACCAGCGCAtt > 1:54284/1‑150 (MQ=255) gCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGTTGAGCTCTTCGAc < 2:20223/123‑1 (MQ=255) gCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGTTGAGCTCTTCGAc > 1:20223/1‑123 (MQ=255) cTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCGGGTTGCTGCGGTTGAGCTCTTCGACCAGCGCATTGAGCCCAGCATCGCCGTAGATTTcc > 1:235435/1‑150 (MQ=255) | AGGGTTTCGCGCAGCTTGCCCCACAGGTCGATCTCCCAGCTCACGCCCAACTGCGCGTTGTAGGTGTTGCGAATGCCGCTGCTGTTATTGGACAGGCTGGAACTGGAGCTGCCGGTGCCCTGCGCCGAGCGGTTCTTGCTGGTGCTCAGGTCCAGGCTGGGGAACAGCGCCGCACGGCTGCTGCGCACCAGCGCCTGGGCCTGGCGATACTGGGCTTCTGATTGCGCCACGGTCTGGTTGCTGCGGTTGAGCTCTTCGACCAGCGCATTGAGCCCAGCATCGCCGTAGATTTCC > NC_002947/4065486‑4065779 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |