New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5594143 = | 25 (1.070) | 3 (0.170) | 3/198 | NT | 14.1% | intergenic (‑39/+106) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase |
? | NC_002947 | 5594236 = | 17 (0.940) | intergenic (‑132/+13) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase |
TGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCGAG > NC_002947/5594092‑5594384 | tggGTGATTTTATGGTCATATCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTTGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGTCAAGC‑CCGCTCCCACAGTGTAAGGtg < 1:195903/150‑1 (MQ=37) tGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGt > 2:293256/1‑150 (MQ=255) gtcatggtcatgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGtt < 1:421712/150‑1 (MQ=255) catggtcatgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTa < 1:517604/150‑1 (MQ=255) atgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTtg < 1:352823/150‑1 (MQ=255) gTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTtgtg < 2:411959/150‑1 (MQ=255) gAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGtgct < 1:168018/125‑1 (MQ=255) gAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGtgct > 2:168018/1‑125 (MQ=255) gTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGcc > 2:517285/1‑150 (MQ=255) tGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTg > 2:307486/1‑150 (MQ=255) gCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGATCATAGGTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGc > 1:433680/1‑150 (MQ=25) accaccCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGTACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTATAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAAcc < 1:582955/150‑1 (MQ=255) caccCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCAAAGCCGGTGCCATGAAGCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGCCTTTGTGGTACAGCTTGGCACCTTCCTTGCGGAACCGc > 2:100310/1‑150 (MQ=25) caccCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGc > 2:94413/1‑150 (MQ=255) CCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCg < 2:97160‑M1/150‑1 (MQ=255) TGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGc > 2:386816‑M1/1‑150 (MQ=255) GGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACg > 1:517285‑M1/1‑150 (MQ=255) CTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCAt > 1:31375‑M1/1‑150 (MQ=255) ccgcgaagcaagcactgcggtgcatggcaccggctttgccggtgttcgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGTCCAGCTCTAGAGTTTGTTGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCtt > 1:318831‑M2/73‑150 (MQ=255) gcgaagcaagcactgcggtgcatggcaccggctttgccggtgttcgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGaa < 1:163509‑M2/52‑1 (MQ=255) gcgaagcaagcactgcggtgcatggcaccggctttgccggtgttcgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGaa > 2:163509‑M2/71‑122 (MQ=255) GAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTc > 1:97160‑M1/1‑150 (MQ=255) cGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGt > 2:92226/1‑150 (MQ=255) aaaGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGATGTTGTGGTACAGCTTGCTGACTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTcaca > 1:74769/1‑150 (MQ=255) aaGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACAt > 2:21840/1‑150 (MQ=255) cttgcttCCCGCGTAAGCACCGC‑CCCACACCGCAACGTGATGGGGTGTAGGCTTTGTGGTGCGGGTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGt > 2:466848/1‑150 (MQ=255) gcttCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTg < 2:186580/76‑1 (MQ=255) gcttCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTg > 1:186580/1‑76 (MQ=255) ttcgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCa > 2:198415‑M2/29‑150 (MQ=255) ttcgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCa > 1:197750‑M2/29‑150 (MQ=255) cgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGt < 1:307486‑M2/136‑1 (MQ=255) agggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGATCGGCGTGCGCACGCATCCATTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGTCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCAt < 1:293256‑M2/145‑1 (MQ=255) tAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCGAg < 1:94413‑M2/149‑1 (MQ=255) | TGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGC‑CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCGAG > NC_002947/5594092‑5594384 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |