| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2954675 = | 74 (1.280) | 11 (0.230) | 11/218 | 3.5 | 14.4% | intergenic (‑135/‑146) | PP_2586/PP_2587 | putative amino acid transporter/LuxR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | 2954741 = | 70 (1.480) | intergenic (‑201/‑80) | PP_2586/PP_2587 | putative amino acid transporter/LuxR family transcriptional regulator | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TATGCATTGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGA > NC_002947/2954534‑2954824 | tATGCATTGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCa > 2:413905/1‑150 (MQ=255) tGCATTGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCAcc > 2:1116122/1‑150 (MQ=255) tGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCAccccaaa < 1:413905/150‑5 (MQ=255) tGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTg < 1:945338/150‑1 (MQ=255) aaCTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGt < 1:1159442/150‑1 (MQ=255) tCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAg > 2:509007/1‑150 (MQ=255) cTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑Cg > 2:1392906/1‑150 (MQ=255) cTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCACGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑Cg > 1:187339/1‑150 (MQ=255) aaaGGGATGCAGGACACAACGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTAGGGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGaca > 2:1319095/1‑150 (MQ=255) aGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGAcaca < 2:676150/142‑1 (MQ=255) aGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGAcaca > 1:676150/1‑142 (MQ=255) gACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGccc > 2:1008809/1‑150 (MQ=255) gACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGccc > 2:73532/1‑150 (MQ=255) acacCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCCGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACTCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCg < 2:865833/150‑1 (MQ=255) acacCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCg > 1:1105937/1‑150 (MQ=255) acCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGc > 1:310070/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGCCCGTCCGGTGTTGTGCAACGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTACCACACCATGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCt < 2:208298/150‑1 (MQ=255) cTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTc < 1:509007/150‑1 (MQ=255) tCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTcc > 1:117539/1‑150 (MQ=255) tCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTcc > 1:1207144/1‑150 (MQ=255) cgACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGTGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTAC‑GGt < 1:37448/150‑1 (MQ=255) aCCGTAAAGCGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCAGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGc < 2:187339/150‑1 (MQ=255) tCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCCGGGCAAGGGCTG‑TGTCC‑GCTCACCCCAAAGGGt < 1:75282/135‑1 (MQ=18) tCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGc > 1:1148771/1‑150 (MQ=255) tCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCA‑CCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCCGGGCA‑AGGGCTGTGTCC‑GCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGGTGCCTGc > 2:1015069/1‑150 (MQ=14) tgttgtGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCACAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAgcgc > 1:240142/1‑150 (MQ=255) tgttgtGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCa < 1:1045940/146‑1 (MQ=255) tgttgtGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCa > 2:1045940/1‑146 (MQ=255) tgCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTTATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCCGAACCACCCTTTGGGGTGAGCCGGGCAAGGGCTG‑TGTCC‑GCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGGTGCCTGCAgggtgtgg < 1:1365989/150‑8 (MQ=14) tgCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTgg > 1:633578/1‑150 (MQ=255) tgCAAGGAGGCCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTgg < 2:1148771/150‑1 (MQ=255) cAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCg < 1:722536/68‑1 (MQ=255) cAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCg > 2:722536/1‑68 (MQ=255) cAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGa < 1:1319095/150‑1 (MQ=255) tCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGc < 2:1105937/150‑1 (MQ=255) tCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGc > 2:361154/1‑150 (MQ=255) gAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTc > 2:432445/1‑150 (MQ=255) gAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTc > 1:292997/1‑150 (MQ=255) aGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCa > 2:878847/1‑150 (MQ=255) cGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAac < 2:117163/150‑1 (MQ=255) gAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGt > 1:1323687/1‑108 (MQ=255) gAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGt < 2:1323687/108‑1 (MQ=255) gAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGa < 1:1393890/135‑1 (MQ=255) gAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGa > 2:1393890/1‑135 (MQ=255) gAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAacga < 1:432445/150‑1 (MQ=255) aGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGAcgc < 2:1422202/150‑1 (MQ=255) tCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGccc < 2:187566/85‑1 (MQ=255) tCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGccc > 1:187566/1‑85 (MQ=255) gCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCaa < 1:153245/95‑1 (MQ=255) gCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCaa > 2:153245/1‑95 (MQ=255) gCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAg > 2:933013/1‑97 (MQ=255) gCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAg < 1:933013/97‑1 (MQ=255) gCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGcggcgg < 1:73532/150‑1 (MQ=255) gggTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTg > 2:130885/1‑150 (MQ=255) gggTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTg > 1:1384603/1‑150 (MQ=255) ttGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCa < 1:1008809/150‑1 (MQ=255) ttGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCa > 2:330333/1‑150 (MQ=255) tGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCTTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTga > 1:1031953/1‑150 (MQ=255) tGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTga < 2:633578/150‑1 (MQ=255) tCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGGTGCCTGCAGGG‑TGTGGGAGCATcaac > 1:1345188/1‑109 (MQ=17) tCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CAGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGGTGCCTGCAG‑GGTGTGGGAGCATcaac < 2:1345188/112‑4 (MQ=17) ccACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGaaaa > 1:379296/1‑150 (MQ=255) cacaCCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAg < 1:49025/48‑1 (MQ=255) cacaCCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAg > 2:49025/1‑48 (MQ=255) acCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCAGTGAGAAAACGGc > 1:1167569/1‑150 (MQ=255) cccTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCa < 2:1012574/150‑1 (MQ=255) cccTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCa < 1:330333/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGc > 2:346483/1‑150 (MQ=255) tGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGc > 2:584979/1‑150 (MQ=255) aGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAacgacg < 1:971346/108‑1 (MQ=255) aGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAacgacg > 2:971346/1‑108 (MQ=255) gCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACa < 2:1207144/150‑1 (MQ=255) aCCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGt > 2:1207106/1‑122 (MQ=255) aCCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGt < 1:1207106/122‑1 (MQ=255) ccGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTg < 2:1468086/82‑1 (MQ=255) ccGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTg > 1:1468086/1‑82 (MQ=255) ccGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGa > 2:542154/1‑150 (MQ=255) ccGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGa > 2:122530/1‑150 (MQ=255) | TATGCATTGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGA > NC_002947/2954534‑2954824 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |