New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2954675 = | 74 (1.280) | 11 (0.230) | 11/218 | 3.5 | 14.4% | intergenic (‑135/‑146) | PP_2586/PP_2587 | putative amino acid transporter/LuxR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 2954741 = | 70 (1.480) | intergenic (‑201/‑80) | PP_2586/PP_2587 | putative amino acid transporter/LuxR family transcriptional regulator | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGTTCGAGCACCAGGCCAAGGTCACCGAGGCGA > NC_002947/2954592‑2954881 | cgACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGTGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTAC‑GGt < 1:37448/150‑1 (MQ=255) aCCGTAAAGCGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCAGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGc < 2:187339/150‑1 (MQ=255) tCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGc > 1:1148771/1‑150 (MQ=255) tCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCA‑CCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCCGGGCA‑AGGGCTGTGTCC‑GCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGGTGCCTGc > 2:1015069/1‑150 (MQ=14) tgttgtGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCACAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAgcgc > 1:240142/1‑150 (MQ=255) tgttgtGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCa < 1:1045940/146‑1 (MQ=255) tgttgtGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCa > 2:1045940/1‑146 (MQ=255) tgCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTTATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCCGAACCACCCTTTGGGGTGAGCCGGGCAAGGGCTG‑TGTCC‑GCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGGTGCCTGCAgggtgtgg < 1:1365989/150‑8 (MQ=14) tgCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTgg > 1:633578/1‑150 (MQ=255) tgCAAGGAGGCCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTgg < 2:1148771/150‑1 (MQ=255) cAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGa < 1:1319095/150‑1 (MQ=255) tCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGc > 2:361154/1‑150 (MQ=255) tCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGc < 2:1105937/150‑1 (MQ=255) gAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTc > 2:432445/1‑150 (MQ=255) gAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTc > 1:292997/1‑150 (MQ=255) aGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCa > 2:878847/1‑150 (MQ=255) cGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAac < 2:117163/150‑1 (MQ=255) gAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGa < 1:1393890/135‑1 (MQ=255) gAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGa > 2:1393890/1‑135 (MQ=255) gAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAacga < 1:432445/150‑1 (MQ=255) aGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGAcgc < 2:1422202/150‑1 (MQ=255) gCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGcggcgg < 1:73532/150‑1 (MQ=255) gggTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTg > 2:130885/1‑150 (MQ=255) gggTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTg > 1:1384603/1‑150 (MQ=255) ttGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCa > 2:330333/1‑150 (MQ=255) ttGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCa < 1:1008809/150‑1 (MQ=255) tGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCTTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTga > 1:1031953/1‑150 (MQ=255) tGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTga < 2:633578/150‑1 (MQ=255) tCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGGTGCCTGCAGGG‑TGTGGGAGCATcaac > 1:1345188/1‑109 (MQ=17) tCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CAGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGGTGCCTGCAG‑GGTGTGGGAGCATcaac < 2:1345188/112‑4 (MQ=17) ccACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGaaaa > 1:379296/1‑150 (MQ=255) acCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCAGTGAGAAAACGGc > 1:1167569/1‑150 (MQ=255) cccTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCa < 1:330333/150‑1 (MQ=255) cccTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCa < 2:1012574/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGc > 2:346483/1‑150 (MQ=255) tGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGc > 2:584979/1‑150 (MQ=255) aGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAacgacg > 2:971346/1‑108 (MQ=255) aGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAacgacg < 1:971346/108‑1 (MQ=255) gCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACa < 2:1207144/150‑1 (MQ=255) aCCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGt > 2:1207106/1‑122 (MQ=255) aCCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGt < 1:1207106/122‑1 (MQ=255) ccGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTg < 2:1468086/82‑1 (MQ=255) ccGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTg > 1:1468086/1‑82 (MQ=255) ccGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGa > 2:122530/1‑150 (MQ=255) ccGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGa > 2:542154/1‑150 (MQ=255) cGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGAc > 1:32090/1‑150 (MQ=255) cGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGAc < 1:122530/150‑1 (MQ=255) gAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACca > 2:1389197/1‑150 (MQ=255) aCCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGaaaa < 2:1316356/125‑1 (MQ=255) aCCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGaaaa > 1:1316356/1‑125 (MQ=255) aCCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCCCCAACCAATGGGCTTTTCC‑GGTGCCGGCAATGTCTTGTGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACcaatcaa > 1:772495/1‑150 (MQ=255) cccTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCTTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACcaatcaat < 2:1031953/150‑1 (MQ=255) cccTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACcaatcaat < 2:772495/150‑1 (MQ=255) cccTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACcaatcaat < 2:292997/150‑1 (MQ=255) cTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAgcgc < 2:1476112/67‑1 (MQ=255) cTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAgcgc > 1:1476112/1‑67 (MQ=255) tttGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGc > 1:1475862/1‑150 (MQ=255) ggggTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCttt < 1:542154/150‑1 (MQ=255) gggTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTc > 1:203613/1‑150 (MQ=255) g‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTACTTTCAGAACa > 2:1115180/1‑150 (MQ=255) ggACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAAt < 2:1475862/150‑1 (MQ=255) gACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATg > 2:856406/1‑150 (MQ=255) acacAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATgg < 1:1389197/150‑1 (MQ=255) acaGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGtt > 1:426976/1‑150 (MQ=255) aGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTgg < 2:754716/53‑1 (MQ=255) aGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTgg > 1:754716/1‑53 (MQ=255) aGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGTTCg > 1:696198/1‑150 (MQ=255) t‑tGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGTTCGAGCAc > 2:1206355/1‑150 (MQ=255) gCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGTTCGAGCACCa < 2:379296/150‑1 (MQ=255) ccagCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGTTCGAGCACCAgg > 1:1476291/4‑150 (MQ=255) cGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGTTCGAGCACCAGGc < 1:1392906/150‑1 (MQ=255) cccACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTANAGTNACCANTCAATTGCTTTCAGAACAATGGTTCGAGCACCAGGCCaa < 1:1116122/148‑1 (MQ=255) tCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGTTCGAGCACCAGGCCAAg < 1:346483/150‑1 (MQ=255) ccACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGTTCGAGCACCAGGCCAAg < 1:130885/149‑1 (MQ=255) aCCCCAAAGGGTGATTCCGGGTGCCTGCAG‑GGTGTGGGAGCATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGTTCGAGCACCAGGCCAAGGt > 1:445217/1‑150 (MQ=38) aCCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCa < 2:1070487/92‑1 (MQ=255) aCCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCa > 1:1070487/1‑92 (MQ=255) ccAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCt < 2:968709/114‑1 (MQ=255) ccAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCt > 1:968709/1‑114 (MQ=255) ccAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTACCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGTTCGAGCACCAGGCCAAGGTCAc > 1:1160380/1‑150 (MQ=255) cAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGTTCGAGCACCAGGCCAAGGTCAcc > 2:742327/1‑150 (MQ=255) aGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGTTCGAGCACCAGGCCAAGGTCACCGAg < 2:203613/150‑1 (MQ=255) ggTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATCGTTCTAGCACCGGGCCAAGGTCACCGAGGc > 2:983212/1‑150 (MQ=255) tGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGTTCGAGCACCAGGCCAAGGTCACCGAGGCGa < 1:584979/150‑1 (MQ=255) gTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGTTCGAGCACCAGGCCAAGGTCACCGa > 2:372866/1‑137 (MQ=255) gTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGTTCGAGCACCAGGCCAAGGTCACCGa < 1:372866/137‑1 (MQ=255) | CGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCT‑TGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGTTCGAGCACCAGGCCAAGGTCACCGAGGCGA > NC_002947/2954592‑2954881 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |