New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 156028 = | 115 (1.230) | 6 (0.070) | 6/242 | NT | 5.1% | coding (348/798 nt) | ygdQ | transport protein |
? | NC_002947 | 156056 = | 110 (1.220) | coding (320/798 nt) | ygdQ | transport protein |
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
CCGGTACGTGGGAAACCATGCCCACAGCGGTGATCACCGAGTCCAGCGAGAACACGATGTCGATGATGGCGATCTGGATGATGGTGTAGAAGAACTTGCCACCTGCGCCTTTGGGCTCCTCTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAGGTAATCGACAGCAGCAGCATGATAC > NC_002947/155880‑156176 | tcggcctggccctggccatggtcacccgtatcatgctgctgctgtcgattacctgggtcatgcgcctcaccgccgacctgttcgtggtctttggccaaggcatctccgggcgtgacctgatcctgttcttcggtggcctgttcctgctgt > 1:972317‑M1/149‑150 (MQ=255) tcggcctgcccctgccgatggtcacccgtatcatgctgctgctgtcgattatctgggtcatgcgcctcaccgccgtcctgttcgtggtctttggccaaggcacctccgggcgtgacctgatcctgttcttcggtggcctgtgcctgctgt > 2:729647‑M1/149‑150 (MQ=255) cGGTACGTGGGAAACCATGCCCACAGCGGTGATCACCGAGTCCAGCGAGAACACGATGTCGATGATGGCGATCTGGATGATGGTGTAGAAGAACTTGCCACCTGCGCCTTTGGGCTCCTCTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTg < 1:2200334/150‑1 (MQ=255) 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tGGGCTCCTCTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGgc < 2:217868/150‑1 (MQ=255) ggCTCCTCTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGgcgc > 1:286931/1‑150 (MQ=255) ggCTCCTCTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGgcgc < 1:2044060/150‑1 (MQ=255) gCTCCTCTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCa > 2:1785220/1‑150 (MQ=255) ctcctcTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCAt < 2:543860/150‑1 (MQ=255) ctcctcTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCAt > 1:2396746/1‑150 (MQ=255) ctcctcTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCAt < 1:2037916/150‑1 (MQ=255) tcctcTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGt < 2:2400356/94‑1 (MQ=255) tcctcTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGt > 1:2400356/1‑94 (MQ=255) tcctcTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTAACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATg > 1:1721123/1‑150 (MQ=255) cctcTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGa < 1:1785220/150‑1 (MQ=255) ctctACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGAc < 2:2247536/150‑1 (MQ=255) tctACGTTCTCGCCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGccc < 1:629492/150‑1 (MQ=255) aCGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAg < 1:2307022/150‑1 (MQ=255) tcGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAGGTAATc > 2:2225619/1‑150 (MQ=255) tCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAGGTAATCGAc < 2:1359829/150‑1 (MQ=255) tgttcctgctGTGGAAGAGCTCGCAAGAGATCTACCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAGGTAATCGAcagcagca < 2:1339135‑M1/140‑1 (MQ=255) cTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAGGTAATCGAcagcagca < 1:2285476/150‑1 (MQ=255) aGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAg < 2:833139/129‑1 (MQ=255) aGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAg > 1:833139/1‑129 (MQ=255) aGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAGGTAATCGACAGCAGCAGCATg > 2:2336040/1‑150 (MQ=255) aCCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAg > 2:1779374/1‑57 (MQ=255) aCCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAg < 1:1779374/57‑1 (MQ=255) | CCGGTACGTGGGAAACCATGCCCACAGCGGTGATCACCGAGTCCAGCGAGAACACGATGTCGATGATGGCGATCTGGATGATGGTGTAGAAGAACTTGCCACCTGCGCCTTTGGGCTCCTCTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAGGTAATCGACAGCAGCAGCATGATAC > NC_002947/155880‑156176 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |