New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 436376 | 68 (0.790) | intergenic (+206/+27) | PP_0357/PP_0358 | ACT domain‑containing protein/membrane protein |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
AGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACATGAAGGCCGCCAGGGTGCTCGACGACAAATGCTCGTCGA > NC_002947/436212‑436509 | aGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGG < 1:936021‑M1/150‑1 (MQ=255) gCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGcaggcc > 1:1112164/1‑150 (MQ=255) cccTGGGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGcaggcca < 2:116744/150‑1 (MQ=255) ccTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGcaggccag < 1:2339296/150‑1 (MQ=255) cTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGcaggccagg < 2:888571/150‑1 (MQ=255) cTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGcaggccagg > 1:1247611/1‑150 (MQ=255) tgtgGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGcaggccaggc > 1:2049664/1‑150 (MQ=255) cTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGAc < 2:1998759‑M2/150‑2 (MQ=255) tGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCCCGTGCCTTGTACGGTTTTACTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTATGCAGGCCAGGCGCTACAGGAcc < 2:168536‑M2/150‑3 (MQ=255) ggTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGAcctgca < 1:2235581‑M2/150‑7 (MQ=255) tACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGt < 2:1186941/150‑1 (MQ=255) ctctCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGtttt < 2:1724861/150‑1 (MQ=255) ctctCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGtttt > 2:2308624/1‑150 (MQ=255) ctctCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGtttt > 1:765086/1‑150 (MQ=255) ctctCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGttt > 2:2251706/1‑149 (MQ=255) ctctCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGttt > 1:268083/1‑149 (MQ=255) ctctCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGttt < 2:268083/149‑1 (MQ=255) ctctCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGttt < 1:2251706/149‑1 (MQ=255) 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tcCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGtttt < 2:430814/147‑1 (MQ=255) tcCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGag > 1:109380/1‑149 (MQ=255) tcCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGAt > 1:578863/1‑150 (MQ=255) tcCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGAt > 1:1875454/1‑150 (MQ=255) tcCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTAGCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGAt < 2:873262/150‑1 (MQ=255) 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cTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGtt > 1:1651701/1‑150 (MQ=255) ttGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGttt > 2:2390390/1‑150 (MQ=255) tGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAACCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTg < 1:2100900/150‑1 (MQ=255) cTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGAcc > 1:2294060‑M2/1‑99 (MQ=255) cTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGAcc < 2:2294060‑M2/101‑3 (MQ=255) cTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGc < 1:2425253/150‑1 (MQ=255) 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ctctGCAGGCCAGGCGCTACATGAcctgcagagacatctccataggttatccacaccctcgtccccgcgctttgtgcacaagctgctgataattgggcatttttt < 2:483119‑M2/105‑82 (MQ=255) tctGCAGGCCAGGCGCTACATGAcctgcagagacatctccataggttatccacaccctcgtccccgcgctttgtgcacaagctgctgataattgg > 2:534025‑M2/1‑23 (MQ=255) tctGCAGGCCAGGCGCTACATGAcctgcagagacatctccataggttatccacaccctcgtccccgcgctttgtgcacaagctgctgataattgg < 1:534025‑M2/95‑73 (MQ=255) ccGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCATATCTGCCCAGATGAACATGAAGGCCGCCAGGGTGCTCGACGACAAATGCtc > 1:1878169‑M1/3‑150 (MQ=255) CTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACATGAAGGCCGCCAGGGTGCTCGACGACAAATGCtc > 2:2159877‑M1/1‑150 (MQ=255) tGCAGGtcatgtagcgcctggcctgcagagacatctccataggttatccacaccctcgtccccgcgctttgtgcacaagctgctgataattgggcattttttgagcaaaaccgtacaaggcacgtgatacctgggctggagaggtacacc < 1:2235581‑M1/150‑145 (MQ=255) tGCAGGCCAGGCGCTACATGAcctgcagagacatctccataggttatc < 2:208176‑M2/48‑28 (MQ=255) tGCAGGCCAGGCGCTACATGAcctgcagagacatctccataggttatc > 1:208176‑M2/1‑21 (MQ=255) TGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACATGAAGGCCGCCAGGGTGCTCGACGACAAATGCtcg < 1:1007409‑M1/150‑1 (MQ=255) TGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACATGAAGGCCGCCAGGGTGCTCGACGACAAATGCtcg < 1:997232‑M1/150‑1 (MQ=255) gCAGGtcatgtagcgcctggcctgcagagacatctccataggttatccacaccctcgtccccgcgc > 1:1493096‑M1/1‑5 (MQ=255) gCAGGtcatgtagcgcctggcctgcagagacatctccataggttatccacaccctcgtccccgcgc < 2:1493096‑M1/66‑62 (MQ=255) CAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACATGAAGGCCGCCAGGGTGCTCGACGACAAATGCtcgtc > 1:1447094‑M1/1‑150 (MQ=255) AGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACATGaa > 2:1652296‑M1/1‑116 (MQ=255) AGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACATGaa < 1:1652296‑M1/116‑1 (MQ=255) AGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACATGAAGGCCGCCAGGGTGCTCGACGACAAATGCtcgtcg < 1:1101498‑M1/150‑1 (MQ=255) ggtcctgtagcgcctggcctgcatagacatctccataggttatccacaccctcgtccccgcgctttgtgcacaagctgctgataattgggcattttttgagtaaaaccgtacaaggcacgggatacctgggctggagaggtacaccccca < 2:168536‑M1/150‑149 (MQ=255) GGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACATGAAGGCCGCCAGGGTGCTCGACGACAAATGCTCGTCGa < 1:509893‑M1/150‑1 (MQ=255) gtcatgtagcgcctggcctgcagagacatctccataggttatccacaccctcgtccccgcgctttgtgcacaagctgctgataattgggcattttttgagcaaaaccgtacaaggcacgtgatacctgggctggagaggtacacccccag < 2:1998759‑M1/150‑150 (MQ=255) | AGGCCCTGTGGATAACCTGGGGGTGTACCTCTCCAGCCCAGGTATCACGTGCCTTGTACGGTTTTGCTCAAAAAATGCCCAATTATCAGCAGCTTGTGCACAAAGCGCGGGGACGAGGGTGTGGATAACCTATGGAGATGTCTCTGCAGGCCAGGCGCTACATGACCTGCAGAGTTTTGATCGTTTT‑CTGATCAGCTACGTTTGCGCAAGTTCAGCCATGCATCGACGCTGTAAATCGCCAAACCTGCCCAGATGAACATGAAGGCCGCCAGGGTGCTCGACGACAAATGCTCGTCGA > NC_002947/436212‑436509 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |