| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 1444641 | 135 (1.450) | 7 (0.080) | 6/240 | NT | 5.3% | coding (258/1530 nt) | PP_1263 | fusaric acid resistance protein |
| ? | NC_002947 | = 1444670 | 121 (1.350) | coding (287/1530 nt) | PP_1263 | fusaric acid resistance protein | |||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
AAGCCAATACCTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCGGTGCCAA > NC_002947/1444496‑1444790 | aaGCCAATACCTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATgg < 2:101245/150‑1 (MQ=255) aGCCAATACCTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGc < 1:1748275/150‑1 (MQ=255) cAATACCTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGTTCGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACGGCCGGGTGGCCCGGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGc > 1:534377/1‑150 (MQ=255) cAATACCTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGc > 1:1568486/1‑150 (MQ=255) cAATACCTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGc > 1:1537805/1‑150 (MQ=255) ccTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAgcgc < 1:1680502/150‑1 (MQ=255) ttGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCgg > 2:1149984/1‑150 (MQ=255) ttGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCgg < 1:1190438/150‑1 (MQ=255) caccGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTgcg > 1:1405683/1‑150 (MQ=255) accGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTgcgc > 1:2446182/1‑150 (MQ=255) gACGCGGCCATTCGCGCAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCGGGAGCGCGaa > 2:1223253/1‑150 (MQ=255) gACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGCCAAGCAATGGGGGCACGCCGATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGaa < 1:2380460/150‑1 (MQ=255) gACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGaa < 2:1537805/150‑1 (MQ=255) gACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGaa < 2:1783462/150‑1 (MQ=255) ggCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCaa < 1:1149984/150‑1 (MQ=255) ggCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCaa > 1:40350/1‑150 (MQ=255) ggCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCaa > 2:2063626/1‑150 (MQ=255) gCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCACGTGCGGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAg > 1:122864‑M2/1‑149 (MQ=255) 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tggccgtggccgGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGGGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCt < 1:65043/150‑1 (MQ=255) tggccgtggccgGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCt > 1:700306/1‑150 (MQ=255) ccgtggccgGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATg < 2:2311735/150‑1 (MQ=255) gtggccgGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACggc < 1:1755387/102‑1 (MQ=255) gtggccgGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACggc > 2:1755387/1‑102 (MQ=255) ggccgGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGccc > 2:1055419/1‑150 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AAGCCAATACCTTGACCACCGACGCGGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCC‑‑‑‑‑‑TGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCGGTGCCAA > NC_002947/1444496‑1444790 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |