New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
GGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCGGTGCCAACACCTGGGACAACAACGCTGCCATCGGCT > NC_002947/1444521‑1444819 | ggCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCaa < 1:1149984/150‑1 (MQ=255) ggCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCaa > 2:2063626/1‑150 (MQ=255) gCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCACGTGCGGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAg > 1:122864‑M2/1‑149 (MQ=255) 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cccAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCt < 1:268591/150‑1 (MQ=255) ccaaaGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCt < 1:2344799/147‑1 (MQ=255) ccAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAggccaggcttgggctaccggccacggccagggtaacccagcggtccagctgagggtcacca < 2:2119584‑M2/102‑62 (MQ=255) cAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAggccatggccgggcttgggctaccggccacggccagggtaacccagcggtccagctgagggtcaccataggcgtgccaccactgctggtcgggccagtgagcgtcagtcg < 1:2225210‑M2/150‑111 (MQ=255) cAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGt > 1:2116498/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCgg < 2:1217485/49‑1 (MQ=255) gCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCgg > 1:1217485/1‑49 (MQ=255) cTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAggccaggcttgggctaccggccacggccagggtaacccagcggtccagctgagggtcaccataggcgtgccaccactgctggtcgg > 1:466816‑M2/1‑35 (MQ=255) tGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCGGTg > 2:2314056/1‑150 (MQ=255) ccATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAggccatggccaggcttgggctaccggccacggccagggtaacccagcggtccagctgagggtcaccataggcgtgccaccactgctggtcgggccagtgagcgtcagtcgcggcttcgc < 1:799275‑M2/150‑120 (MQ=255) ccATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACCAATGCCCGGAAGACCAGCTCTATTTCGCTGGCGCGCTGTCCGGTGCCa > 2:23025/1‑150 (MQ=255) cATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGcc < 2:1976063/98‑1 (MQ=255) aTGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCGGTGCCAac > 2:2373171/1‑150 (MQ=255) aTGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCGGTGCCAac > 1:1105424/1‑150 (MQ=255) gCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAggccatggccaggcttgggctaccggccacggccagggtaacccagcggtccagctgagggtcaccataggcgtgccaccactgctggtcgggccagtgagcgtcagtcgcggcttcgcgaatg < 1:434351‑M2/150‑125 (MQ=255) gCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCGGTGCCAACAcc < 1:163609/150‑1 (MQ=255) gCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCGGTGCCAACACCTgg > 1:945331/1‑150 (MQ=255) gcgGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCCGTCCGGTGCCAACACCTGGGacaa > 1:1123126/1‑150 (MQ=255) gTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCGGTGCCAACACCTGGGACaacaac < 1:616358/150‑1 (MQ=255) gCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCGGTGCCAACACCTGGGACAACAACGCTGCCATc < 1:2327426/150‑1 (MQ=255) cAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCGGTGCCAACACCTGGGACAACAACGCTGCCATCgg < 1:479876/150‑1 (MQ=255) aGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCAAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCGGTGCCAACACCTGGGACAACAACGCTGCCATCGGCt > 1:2340672/1‑150 (MQ=255) | GGCCATTCGCGAAGCCGCGACTGACGCTCACTGGCCCGACCAGCAGTGGTGGCACGCCTATGGTGACCCTCAGCTGGACCGCTGGGTTACCCTGGCCGTGGCCGGTAGCCCAAGCCTGGCCATGGCCGCAGCGCGGGTGCGCGAAGCCAAGGCCATGGCCGGTGTGGTCGAGTCGGCGGAAAAGCTCCAGGCCAACGGCCAGGCCACGCTCAAGCGCCACAACTGGCCGGAAGACCAGTTCTATGGCCCTGGCGCGCTGTCCGGTGCCAACACCTGGGACAACAACGCTGCCATCGGCT > NC_002947/1444521‑1444819 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |