New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1613744 = | 73 (0.780) | 4 (0.050) | 4/236 | NT | 5.1% | coding (904/1683 nt) | ushA | 5'‑nucleotidase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase |
? | NC_002947 | 1613794 = | 79 (0.900) | coding (854/1683 nt) | ushA | 5'‑nucleotidase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase |
CTGACGCACTTCCTCTAGCAAACCCGCCAACTGGGCATTGGGCAGGTAGTTCTGTGGGTCAGCAGGAATATTGCGGGCGGTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGCCGCTGATGACGGCATCTACCGCAGGATCCAGCCGCTTCGCCACGTCGACGATCGTGCCACTTAGCTGGCTGCAATCCTGCGTGTCGAAC > NC_002947/1613595‑1613892 | gtcaatgcaatcattgcggtcaggcaccagggaggggataccgccgagccgttcgacacgcaggattgcagccagctaagtggcacgatcgtcgacgtggcgaagcggctggatcctgcggtagatgccgtcatcagcggccactcgcat > 1:318109‑M1/150‑150 (MQ=255) aatgcaatcattgcggtcatgcaccagggaggggataccgccgagccgttcgacacgcaggattgcagccagctaagtggcacgatcgtcgacgtggcgaagcggctggatcctgcggtagatgccgtcatcagcggccactcgcaTGcc < 1:1249419‑M1/4‑1 (MQ=255) aatgcaatcattgcggtaatcctccagggaggggataccgccgagccgttagacacgcacgattgcagccagctaagtggcacgatcgtcgacgtggcgaagcggctggatcctgcggtagatgccgtcatcagcggccactcgcaTGcc > 1:1943629‑M1/147‑150 (MQ=255) atgcaatcattgcggtcatgcaccagggaggggataccgccgagccgttcgacacgcaggattgcagccagctaagtggcacgatcgtcgacgtggcgaagcggctggatcctgcggtagatgccgtcatcagcggccactcgcaTGCCa > 2:1522763‑M1/146‑150 (MQ=255) atgcaatcattgcggtcatgcaccagggaggggataccgccgagccgttcgacacgcaggattgcagccagctaagtggcacgatcgtcgacgtggcgaagcggctggatcctgcggtagatgccgtcatcagcggccactcgcaTGCCa > 2:2214095‑M1/146‑150 (MQ=255) atgcaatcattgcggtcatgcaccagggaggggataccgccgagccgttcgacacgcaggattgcagccagctaagtggcacgatcgtcgacgtggcgaagcggctggatcctgcggtagatgccgtcatcagcggccactcgcaTGCCa < 2:2393587‑M1/5‑1 (MQ=255) gCACTTCCTCTAGCAAACCCGCCAACTGGGCATTGGGCAGGTAGTTCTGTGGGTCAGCAGGAATATTGCGGGCGGTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAg > 2:1856517/1‑150 (MQ=255) gCACTTCCTCTAGCAAACCCGCCAACTGGGCATTGGGCAGGTAGTTCTGTGGGTCAGCAGGAATATTGCGGGCGGTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAg > 2:385001/1‑150 (MQ=255) cACTTCCTCTAGCAAACCCGCCAACTGGGCATTGGGCAGGTAGTTCTGTGGGTCAGCAGGAATATTGCGGGCGGTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGc < 1:1990262/150‑1 (MQ=255) ccTCTAGCAAACCCGCCAACTGGGCATTGGGCAGGTAGTTCTGTGGGTCAGCAGGAATATTGCTGTCGGGCATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAg < 1:1476036/150‑1 (MQ=255) ctctAGCAAACCCGCCAACTGGGCATTGGGCAGGTAGTTCTGTGGGTGAGCAGGAATATTGCGGGCGGTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGCACTTGc > 1:1068676/1‑140 (MQ=255) ctctAGCAAACCCGCCAACTGGGCATTGGGCAGGTAGTTCTGTGGGTCAGCAGGAATATTGCGGGCGGTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGc < 2:1068676/140‑1 (MQ=255) ctctAGCAAACCCGCCAACTGGGCATTGGGCAGGTAGTTCTGTGGGTCAGCAGGAATATTGCGGGCGGTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGt > 2:499494/1‑150 (MQ=255) tctAGCAAACCCGCCAACTGGGCATTGGGCAGGTAGTTCTGTGGGTCAGCAGGAATATTGCGGGCGGTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTg > 2:1194710/1‑150 (MQ=255) ctAGCAAACCCGCCAACTGGGCATTGGGCAGGTAGTTCTGTGGGTCAGCAGGAATATTGCGGGCGGTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGa < 1:1194710/150‑1 (MQ=255) gCAAACCCGCCAACTTGGCATTGGGCAGGTAGTTCTGTGGGTCAGCAGGAATATTGCGGGCGGTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGc > 1:898221/1‑150 (MQ=255) aaaCCCGCCAACTGGGCATTGGGCAGGTAGTTCTGTGGGTCAGCAGGAATATTGCGGGCGGTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGCTc < 2:898221/150‑1 (MQ=255) aCCCGCCAACTGGGCATTGGGCAGGTAGTTCTGTGGGTCAGCAGGAATATTGCGGGCGGTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCaa < 2:1972510/150‑1 (MQ=255) 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aGGTAGTTCTGTGGGTCAGCAGGAATATTGCGGGCGGTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAg > 2:915258/1‑150 (MQ=255) aGGTAGTTCTGTGGGTCAGCAGGAATATTGCGGGCGGTCATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAg < 1:357045/150‑1 (MQ=255) gTAGTTCTGTGGGTCAGCAGGAATATTGCGGGCGGTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCt < 2:80111/150‑1 (MQ=255) tAGTTCTGTGGGTCAGCAGGAATATTGCGGGCGGTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTg < 1:499494/150‑1 (MQ=255) ttcgacacgcaggattgcagccagctaagtggcacgatcgtcgacgtggcgaagcggctggatcctgcggtagatgccgtcatcagcggccactcgcaTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATg > 1:460579‑M1/99‑150 (MQ=255) 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< 1:1707756/84‑1 (MQ=255) tGCGGGCGGTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGCCGCTGATGACgg < 1:2021162/150‑1 (MQ=255) agctaagtggcacgatcgtcgacgtggcgaagcggctggatcctgcggtagatgccgtcatcagcggccactcgcaTGcc > 2:2154030‑M1/77‑80 (MQ=255) agctaagtggcacgatcgtcgacgtggcgaagcggctggatcctgcggtagatgccgtcatcagcggccactcgcaTGcc < 1:2154030‑M1/4‑1 (MQ=255) gggcggTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGCCGCTGATGACGGCAt < 1:2174139/150‑1 (MQ=255) gggcggTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGCCGCTGATGACGGCAt < 1:240327/150‑1 (MQ=255) gcggTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGCCGCTGATGACGGCATCt > 1:1633701/1‑150 (MQ=255) 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2:1396965/150‑1 (MQ=255) aGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGCCGCTGATGACGGCATCTACCGCAGGATCCAGCCGCTTCGCCACGTCGACGATCGTGCCACTTAgctggct < 1:229359/150‑1 (MQ=255) aGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGCCGCTGATGACGGCATCTACCGCAGGATCCAGCCGCTTCGCCACGTCGACGATCGTGCCACTTAgctggct < 1:1415969/150‑1 (MQ=255) tCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGCCGCTGATGACGGCATCTACCGCAGGATCCAGCCGCTTCGCCACGTCGACGATCGTGCCACTTAGCTGGCTGc > 2:1703839/1‑150 (MQ=255) ggAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGGCGCTGATGACGGCATCTACCGCAGGATCTAGCCGCTTCGCCACGTCGACGATCGTGCCACTTAGCTGGCTGCAAt > 2:866453/1‑150 (MQ=255) gTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGCCGCTGATGACGGCATCTACCGCAGGATCCAGCCGCTTCGCCACGTCGACGATCGTGCCACTTAGCTGGCTGCAATCCTg < 2:2369809/150‑1 (MQ=255) tGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGTCGCTGATGACGGCATCTACCGCAGGATCCAGCCGCTTCGCCACGTCGACGATCGTGCCACTTAGCTGGCTGCAATCCTGc < 1:650804/150‑1 (MQ=255) gCCGTTCTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGCCGCTGATGACCGCATCTACCGCAGGATCCAGCCGCTTCGCCACGTCGACGATCGTGCCACTTAGCTGGCTGCAATCCTGCgt < 2:754710/150‑1 (MQ=255) cGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGCCGCTGATGACGGCATCTACCGCAGGATCCAGCCGCTTCGCCACGTCGACGATCGTGCCACTTAGCTGGCTGCAATCATGCgtgt > 1:1535329/1‑150 (MQ=255) cTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGCCGCTGATGACGGCATCTACCGCAGGATCCAGCCGCTTCGCCACGTCGACGATCGTGCCACTTAGCTGGCTGCAATCCTGCGTGTCGaa < 2:1003275/150‑1 (MQ=255) cTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGCCGCTGATGACGGCATCTACCGCAGGATCCAGCCGCTTCGCCACGTCGACGATCGTGCCACTTAGCTGGCTGCAATCCTGCGTGTCGaa > 2:283866/1‑150 (MQ=255) ttGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGCCGCTGATGACGGCATCTACCGCAGGATCCAGCCGCTTCGCCACGTCGACGATCGTGCCACTTAGCTGGCTGCAATCCTGCGTGTCGAAc < 2:543203/150‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGCCGCTGATGACGGCATCTACCGCAGGATCCAGCCGCTTCGCCACGTCGACGATCGTGCCACTTAGCTGGCTGCAATCCTGCGTGTCGAAc > 2:69088/1‑150 (MQ=255) ttGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGCCGCTGATGACGGCATCTACCGCAGGATCCAGCCGCTTCGCCACGTCGACGATCGTGCCACTTAGCTGGCTGCAATCCTGCGTGTCGAAc > 2:850590/1‑150 (MQ=255) ttGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGCCGCTGATGACGGCATCTACCGCAGGATCCAGCCGCTTCGCCACGTCGACGATCGTGCCACTTAGCTGGCTGCAATCCTGCGTGTCGAAc > 1:1029822/1‑150 (MQ=255) | CTGACGCACTTCCTCTAGCAAACCCGCCAACTGGGCATTGGGCAGGTAGTTCTGTGGGTCAGCAGGAATATTGCGGGCGGTGATGTTCGTGACGTGATGGGTGCCTGGCGTTACCTGCAACTTCAACTGAGTCAGGAAGTGGCCGTACTTGCCAGCCTGAGTGATGCTCAAGTCACCCACCTTGCATTGATAGCTGGCATGCGAGTGGCCGCTGATGACGGCATCTACCGCAGGATCCAGCCGCTTCGCCACGTCGACGATCGTGCCACTTAGCTGGCTGCAATCCTGCGTGTCGAAC > NC_002947/1613595‑1613892 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |