| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 1719958 = | 95 (1.020) | 6 (0.070) | 5/244 | NT | 6.4% | coding (95/642 nt) | PP_1515 | Transcriptional regulator, tetR family |
| ? | NC_002947 | 1720004 = | 84 (0.920) | coding (49/642 nt) | PP_1515 | Transcriptional regulator, tetR family | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
CAGGCAACTGGACCTGGCAGGTGGCCATGACCGCCGAGCAGAACAACGTCTGCTTGTCGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGC > NC_002947/1719809‑1720106 | caccctgtcgatcaactcaacgctggcaggccgcaggtaaatgtgagctagttttagccgtatcgcagctgacccgttaagatggggattcttaaaccagatgcagaccacaatgctcaacgacgcacccatcggcccaggccggcccaa > 1:296271‑M1/150‑150 (MQ=255) accctgtcgatcaactcaacgctggcaggccgcaggtaaatgtgagctagttttagccgtatcgcggatcggctgttaagatggggattcttaaaccagatgcagaccacaatgctcaacgacgcacccatcggcccaggccggcccaAg > 1:1861328‑M1/149‑150 (MQ=255) accctgtcgatcaactcaacgctggcaggccgcaggtaaatgtgagctagttttagccgtatcgcagctgacccgttaagatggggattcttaaaccagatgcagaccacaatgctcaacgacgcacccatcggcccaggccggcccaAg < 1:1262620‑M1/2‑1 (MQ=255) accctgtcgatcaactcaacgctggcaggccgcaggtaaatgtgagctagttttagccgtatcgcagctgacccgttaagatggggattcttaaaccagatgcagaccacaatgctcaacgacgcacccatcggcccaggccggcccaAg < 1:1725771‑M1/2‑1 (MQ=255) gCAACTGGACCTGGCAGGTGGCCATGACCGCCGAGCAGAACAACGTCTGCTTGTCGGCGAGGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAggg > 2:1521552/1‑150 (MQ=255) cgggACCTGGCAGGTGGCCATGACCGCCGAGCAGAACAACGTCTGCTTGTCGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCAGCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCtt < 1:1119909/148‑1 (MQ=255) gACCTGGCAGGTGGCCATGACCGCCGAGCAGAACAACGTCTGCTTGTCGGTGAATTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGc < 1:746214/150‑1 (MQ=255) aGGTGGCCATGACCGCCGAGCAGAACAACGTCTGCTTGTCGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGa > 2:725542/1‑150 (MQ=255) ggCCATGACCGCCGAGCAGAACAACGTCTGCTTGTCGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGAt > 2:1571150/1‑150 (MQ=255) ccATGACCGCCGAGCAGAACAACGTCTGCTTGTCGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCg > 1:219463/1‑150 (MQ=255) ccATGACCGCCGAGCAGAACAACGTCTGCTTGTCGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCg > 1:1403618/1‑150 (MQ=255) cATGACCGCCGAGCAGAACAACGTCTGCTTGTCGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGc > 1:2099990/1‑150 (MQ=255) aTGACCGCCGAGCAGAACAACGTCTGCTTGTCGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAgg > 2:1857061/1‑126 (MQ=255) aTGACCGCCGAGCAGAACAACGTCTGCTTGTCGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAgg < 1:1857061/126‑1 (MQ=255) cgccgAGCAGAACAACGTCTGCTTGTCGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTcgcg > 1:372574/1‑150 (MQ=255) gccgAGCAGAACAACGTCTGCTTGTCGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCgcgc < 1:1965419/150‑1 (MQ=255) cgAGCAGAACAACGTCTGCTTGTCGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCtt < 2:219463/150‑1 (MQ=255) cgACCAGAACAACGTCTGCTTGTCGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCtt < 2:1403618/150‑1 (MQ=255) gAGCAGAACAACGTCTGCTTGTCGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTg < 1:1544611/150‑1 (MQ=255) 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cgcAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGtt < 2:2207450/150‑1 (MQ=255) aGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTaa < 1:570187/150‑1 (MQ=255) aGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTaa < 2:1854703/150‑1 (MQ=255) gACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGaa > 2:1387042/1‑150 (MQ=255) cATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATcccc < 1:2225613/150‑1 (MQ=255) aTCCATGCGGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGACAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTGGGTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATACCCa > 1:756330/1‑150 (MQ=255) tCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGtt > 2:1155624/1‑113 (MQ=255) tCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGtt < 1:1155624/113‑1 (MQ=255) tgtTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGt < 1:273665/150‑1 (MQ=255) tgtTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTGCGATGATCGCCGCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGCGGATGGTATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGt < 1:2411344/150‑1 (MQ=255) gtTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTTCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTc > 2:564363/1‑150 (MQ=255) ttGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCa < 1:1387042/150‑1 (MQ=255) gTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGc < 2:713235/150‑1 (MQ=255) gTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGc > 1:791307/1‑150 (MQ=255) ccAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATa > 2:2163112/1‑150 (MQ=255) aaGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACg < 2:1681317/150‑1 (MQ=255) aGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGGCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTaaaa > 2:1262620/1‑150 (MQ=255) aCAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGCGCATTGTGGTCTGCAGGTAAGTGAGGAATCCCCGTCGTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAg < 1:1003859/150‑1 (MQ=255) cAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGc < 2:372574/150‑1 (MQ=255) | CAGGCAACTGGACCTGGCAGGTGGCCATGACCGCCGAGCAGAACAACGTCTGCTTGTCGGTGAAGTGGCTGTAGACGGTGAGCTTTGAAACACCTGCCGCCGCAGCGACCGCATCCATGCTGGTGTTGGCGTAGCCAAGGCTGAGGAACAGGGCCTTGGCCGCTTCGAGGATCGCCTCGCGCTTGGCCAGGTCCTTGGGCCGGCCTGGGCCGATGGGTGCGTCGTTGAGCATTGTGGTCTGCATCTGGTTTAAGAATCCCCATCTTAACGGGTCAGCTGCGATACGGCTAAAACTAGC > NC_002947/1719809‑1720106 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |