New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 1783247 | 133 (1.430) | 7 (0.080) | 5/244 | NT | 5.3% | coding (872/2703 nt) | glnD | uridylyltransferase |
? | NC_002947 | = 1783270 | 120 (1.320) | coding (849/2703 nt) | glnD | uridylyltransferase |
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
TGCCACTTTCCTCATCGGCGAGGATAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCAAGAAGCCTTCGCC > NC_002947/1783104‑1783395 | tgcCACTTTCCTCATCGGCGAGGATAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCg > 1:48753/1‑150 (MQ=255) tgcCACTTTCCTCATCGGCGAGGATAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGGACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCGTGGGGATTGCATCGCGGTAGCCCAGCAGCg > 2:1947899/1‑150 (MQ=255) gcCACTTTCCTCATCGGCGAGGATAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGt < 2:1628144/150‑1 (MQ=255) ccACTTTCCTCATCGGCGAGGATAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTg > 2:1427244/1‑150 (MQ=255) ccACTTTCCTCATCGGCGAGGATAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTg > 1:2164919/1‑150 (MQ=255) ccACTTTCCTCATCGGCGAGGATAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTg > 1:1582240/1‑150 (MQ=255) cACTTTCCTCATCGGCGAGGATAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTgg > 1:1904697/1‑150 (MQ=255) ttCCTCATCGGCGAGGATAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAt < 1:1405316/150‑1 (MQ=255) tCATCGGCGAGGATAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAt‑gctg > 2:799202/1‑150 (MQ=255) tCATCGGCGAGGATAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAt‑gctg > 1:1536186/1‑150 (MQ=255) cGGCGAGGATAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCt < 1:1855965/150‑1 (MQ=255) gCGAGGATAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCtgg < 1:799202/150‑1 (MQ=255) gAGGATAACCGCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAccagcgcagcatcgccacgctgctg < 2:1116243‑M1/150‑26 (MQ=255) gATAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTc > 2:1559903/1‑150 (MQ=255) tAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGa > 2:1803974/1‑150 (MQ=255) aaCCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGaa < 1:2273616/150‑1 (MQ=255) ctctTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAAcag > 1:658355/1‑150 (MQ=255) tctTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGa < 2:1857496/127‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCCGCGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATtctc < 2:1681655/150‑1 (MQ=255) cTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATtctc < 1:1559903/150‑1 (MQ=255) ttGGGGTTTTCAACGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCTGCAGTTCa > 1:492308/1‑144 (MQ=255) ttGGGGTTTTCAACGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCa < 2:492308/144‑1 (MQ=255) gTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTc > 2:1713458/1‑150 (MQ=255) ttttCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGACGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTcc > 2:1583476/1‑150 (MQ=255) ccacGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCa > 2:214864/4‑150 (MQ=255) aTCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCaa > 2:889604/1‑150 (MQ=255) aTCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCaa > 1:1195969/1‑150 (MQ=255) aTCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCaa > 1:1082022/1‑150 (MQ=255) aTCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCaa > 1:1019398/1‑150 (MQ=255) tCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGATAGCT‑CTCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCaag > 1:2276642/1‑150 (MQ=255) tCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCaag > 1:394934/1‑150 (MQ=255) gCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCaagaa < 2:580885/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCAAGAAGCCTTc > 1:1809959/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGtgggctacagcgatgaaaaccccaagcgggcgatcgaacagttcatgcagcagtactaccgggtg > 2:1320437‑M2/1‑26 (MQ=255) ccAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGtgggctacagcgatgaaaaccccaagcgggcgatcgaacagttcatgcagcagtactaccgggtg < 1:1320437‑M2/91‑66 (MQ=255) ccAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGaa < 1:2029896/110‑1 (MQ=255) ccAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCAAGAAGCCTTCGc < 2:35516/150‑1 (MQ=255) ccAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGCtgggctacagcgatgaaaaccccaagcgggcgatcgaacagttcatgcagcagtactaccgggtggt > 2:1511530‑M2/1‑26 (MQ=255) ccAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGCtgggctacagcgatgaaaaccccaagcgggcgatcgaacagttcatgcagcagtactaccgggtggt < 1:1511530‑M2/93‑68 (MQ=255) cagcagCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGtgggctacagcgatgaaaaccccaagcgggcgatcgaacagttcatgcagcagtactaccgggtggtgatgagcatcagccagctgtgcgacctgatcatccagcacttcgaagcggttatcctc < 2:1116243‑M2/150‑126 (MQ=255) cagcagCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGtgggctacagcgatgaaaaccccaagcgggcgatcgaacagttcatgcagcagtactaccgggtggtgat < 1:841216‑M2/95‑71 (MQ=255) cagcagCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGtgggctacagcgatgaaaaccccaagcgggcgatcgaacagttcatgcagcagtactaccgggtggtgat > 2:841216‑M2/1‑25 (MQ=255) | TGCCACTTTCCTCATCGGCGAGGATAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCAAGAAGCCTTCGCC > NC_002947/1783104‑1783395 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |