New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 1783247 | 133 (1.430) | 7 (0.080) | 5/244 | NT | 5.3% | coding (872/2703 nt) | glnD | uridylyltransferase |
? | NC_002947 | = 1783270 | 120 (1.320) | coding (849/2703 nt) | glnD | uridylyltransferase |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
GCGAGGATAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCAAGAAGCCTTCGCCGGCCAGTGCATGCAGGTT > NC_002947/1783121‑1783413 | gCGAGGATAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCtgg < 1:799202/150‑1 (MQ=255) gATAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTc > 2:1559903/1‑150 (MQ=255) aCCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAAc < 2:1582240/150‑1 (MQ=255) ccTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAAca > 1:1068677/1‑150 (MQ=255) ctctTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAAcag > 1:658355/1‑150 (MQ=255) tctTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAAcagc < 1:508359/150‑1 (MQ=255) tctTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAAcagc > 1:1269502/1‑150 (MQ=255) ctTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAAcagca > 2:70466/1‑150 (MQ=255) gAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCg > 1:1162454/1‑150 (MQ=255) gAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCg > 2:1375556/1‑150 (MQ=255) aaGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCgg < 2:658355/150‑1 (MQ=255) tGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCt > 1:1663426/1‑150 (MQ=255) ggATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCg > 1:774331/1‑142 (MQ=255) ggATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCg < 2:774331/142‑1 (MQ=255) gatgatCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGgc > 1:29892/1‑150 (MQ=255) tCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTc > 2:1487486/1‑150 (MQ=255) tCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGATCTTGAAACCACTAGGCGAGCAGCGTGTCTAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTc > 1:1861571/1‑150 (MQ=255) aGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGTGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCg > 1:2327872/1‑150 (MQ=255) 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aTCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCaa > 1:1019398/1‑150 (MQ=255) tCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGATAGCT‑CTCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCaag > 1:2276642/1‑150 (MQ=255) tCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCaag > 1:1556720/1‑150 (MQ=255) tCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCaag > 1:394934/1‑150 (MQ=255) gCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCaagaa < 1:214864/150‑1 (MQ=255) gCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCaagaa < 2:580885/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCAAGAAGCCTTc > 1:1809959/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGtgggctacagcgatgaaaaccccaagcgggcgatcgaacagttcatgcagcagtactaccgggtg < 1:1320437‑M2/91‑66 (MQ=255) ccAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGtgggctacagcgatgaaaaccccaagcgggcgatcgaacagttcatgcagcagtactaccgggtg > 2:1320437‑M2/1‑26 (MQ=255) ccAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGaa > 2:2029896/1‑110 (MQ=255) ccAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGaa < 1:2029896/110‑1 (MQ=255) ccAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGCtgggctacagcgatgaaaaccccaagcgggcgatcgaacagttcatgcagcagtactaccgggtggt > 2:1511530‑M2/1‑26 (MQ=255) ccAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGCtgggctacagcgatgaaaaccccaagcgggcgatcgaacagttcatgcagcagtactaccgggtggt < 1:1511530‑M2/93‑68 (MQ=255) cagcagCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGtgggctacagcgatgaaaaccccaagcgggcgatcgaacagttcatgcagcagtactaccgggtggtgatgagcatcagccagctgtgcgacctgatcatccagcacttcgaagcggttatcctc < 2:1116243‑M2/150‑126 (MQ=255) cagcagCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGtgggctacagcgatgaaaaccccaagcgggcgatcgaacagttcatgcagcagtactaccgggtggtgat < 1:841216‑M2/95‑71 (MQ=255) gcGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCAAGAAGCCTTCGCCGGCCa > 2:1712964/1‑150 (MQ=255) gcGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCAAGAAGCCTTCGCCGGCCa < 2:2194186/150‑1 (MQ=255) cGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAgg > 1:388749/1‑67 (MQ=255) cGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAgg < 2:388749/67‑1 (MQ=255) t‑gctgtgctgGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCAAGAAGCCTTCGCCGGCCAGtgcatgca < 2:2327807/150‑1 (MQ=255) ccgcTCGTGGTCGAACATCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGCCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCAAGAAGCCTTCGCCGGCCAGTGCATGCAGGtt < 1:1085660/149‑1 (MQ=255) | GCGAGGATAACCTCTTCGAAGTGCTGGATGATCAGGTCGCACAGCTGGCTGATGCTCATCACCACCCGGTAGTACTGCTGCATGAACTGTTCGATCGCCCGCTTGGGGTTTTCATCGCTGTAGCCCAGCAGCGTGGCGAT‑GCTGCGCTGGTGGTCGAACAGCAGGCGGTCTTCGGCGCGTCCGGCCAGCATGTGCAGGGCGTAACGGACTTTCCAGAGGAAGTCCTGGGACGAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCAAGAAGCCTTCGCCGGCCAGTGCATGCAGGTT > NC_002947/1783121‑1783413 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |