| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 1799104 | 80 (0.860) | 6 (0.070) | 4/236 | NT | 6.9% | coding (985/1128 nt) | lpxB | lipid‑A‑disaccharide synthase |
| ? | NC_002947 | = 1799128 | 86 (0.980) | coding (1009/1128 nt) | lpxB | lipid‑A‑disaccharide synthase | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GGCCGATGGTAGTGGCGTACCGCCTGGCGCCCTTGACCTTCTGGATTCTCAAGCGTCTGGTGAAAAGCCCTTACGTGTCATTGCCGAACCTGCTGGCCCAGCGAGAGCTGGTGCCCGAGTTGCTGCAGGACGACGCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCCGCTGGTGCGCGATGGAAGCCAGCAGACCGAACGTTTCGACGAAATTCACCGCACCCTGCGCCGTGACGCCTCCAATCAGGCGGCCGAGGCGGTACTGGCCCTGCTCAAGGACCGCTGACATGCA > NC_002947/1798961‑1799253 | ggCCGATGGTAGTGGCGTACCGCCTGGCGCCCTTGACCTTCTGGATTCTCAAGCGTCTGGTGAAAAGCCCTTACGTGTCATTGCCGAACCTGCTGGCCCAGCGAGAGCTGGTGCCCGAGTTGCTGCAGGACGACGCTACCAGCGAAgcgc > 1:1164169/1‑150 (MQ=255) cGATGGTAGTGGCGTACCGCCTGGCGCCCTTGACCTTCTGGATTCTCAAGCGTCTGGTGAAAAGCCCTTACGTGTCATTGCCGAACCTGCTGGCCCAGCGAGAGCTGGTGCCCGAGTTGCTGCAGGACGACGCTACCAGCGAAGCGCTgg < 2:1113271/150‑1 (MQ=255) gATGGTAGTGGCGTACCGCCTGGCGCCCTTGACCTTCTGGATTCTCAAGCGTCTGGTGAAAAGCCCTTACGTGTCATTGCCGAACCTGCTGGCCCAGCGAGAGCTGGTGCCCGAGTTGCTGCAGGACGACGCTACCAGCGaa < 1:2287179/142‑1 (MQ=255) gATGGTAGTGGCGTACCGCCTGGCGCCCTTGACCTTCTGGATTCTCAAGCGTCTGGTGAAAAGCCCTTACGTGTCATTGCCGAACCTGCTGGCCCAGCGAGAGCTGGTGCCCGAGTTGCTGCAGGACGACGCTACCAGCGaa > 2:2287179/1‑142 (MQ=255) gATGGTAGTGGCGTACCGCCTGGCGCCCTTGACCTTCTGGATTCTCAAGCGTCTGGTGAAAAGCCCTTACGTGTCATTGCCGAACCTGCTGGCCCAGCGAGAGCTGGTGCCCGAGTTGCTGCAGGACGACGCTACCAGCGAAGCGCTGGc < 1:218666/150‑1 (MQ=255) tAGTGGCGTACCGCCTGGCGCCCTTGACCTTCTGGATTCTCAAGCGTCTGGTGAAAAGCCCTTACGTGTCATTGCCGAACCTGCTGGCCCAGCGAGAGCTGGTGCCCGAGTTGCTGCAGGACGACGCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAaca < 1:432572/150‑1 (MQ=255) tGGCGTACCGCCTGGCGCCCTTGACCTTCTGGATTTTCAAGCATCTGGTGAAAAGCCGTTACGTGTCATTGCCGAACCTGCTGGCCCAGCGAGAGCTGGTGCCCGAGTTGCTGCAGGACGACGCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACAccc < 2:143958/150‑1 (MQ=255) tGGCGTACCGCCTGGCGCCCTTGACCTTCTGGATTCTCAAGCGTCTGGTGAAAAGCCATTACGTGTCATTGCCGAACCTCATGGCCCAGCGAAAGCTAGTTCCCGAGTTGCTGCAGGACGACGCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACAccc > 2:864000/1‑150 (MQ=255) ggCGTACCGCCTGGCGCCCTTGACCTTCTGGATTCTCAAGCGTCTGGTGAAAAGCCCTTACGTGTCATTGCCGAACCTGCTGGCCCAGCGAGAGCTGGTGCCCGAGTTGCTGCAGGACGACGCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCt < 1:997115/150‑1 (MQ=255) ggCGTACCGCCTGGCGCCCTTGACCTTCTGGATTCTCAAGCGTCTGGTGAAAAGCCCTTACGTGTCATTGCCGAACCTGCTGGCCCAGCGAGAGCTGGTGCCCGAGTTGCTGCAGGACGACGCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCt < 2:2157864/150‑1 (MQ=255) gTACCGCCTGGCGCCCTTGACCTTCTGGATTCTCAAGCGTCTGGTGAAAAGCCCTTACGTGTCATTGCCGAACCTGCTGGCCCAGCGAGAGCTGGTGCCCGAGTTGCTGCAGGACGACGCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGgc < 1:1906660/150‑1 (MQ=255) ccGCCTGGCGCCCTTGACCTTCTGGATTCTCAAGCGTCTGGTGAAAAGCCCTTACGTGTCATTGCCGAACCTGCTGGCCCAGCGAGAGCTGGTGCCCGAGTTGCTGCAGGACGACGCTCCCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCc < 2:943626‑M2/150‑2 (MQ=255) cGCCTGGCGCCCTTGACCTTCTGGATTCTCAAGCGTCTGGTGAAAAGCCCTTACGTGTCATTGCCGAACCTGCTGGCCCAGCGAGAGCTGGTGCCCGAGTTAAGGCAGGACGACGCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCcg < 1:1452740‑M2/150‑3 (MQ=255) gCCTGGCGCCCTTGACCTTCTGGATTCTCAAGCGTCTGGTGAAAAGCCCTTACGTGTCATTGCCAAACCTGCTGGCCCAGCGAGAGCTGGTGCCCGAGTTGCTGCAGGACGACGCTACCAGCGgcgccagggtgttggccagcgcttcgc > 1:2049770‑M1/1‑123 (MQ=255) 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aGTTGCTGCAGGACGACGCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCCGCTGGTGCGCGATGGAAGCCAGCAGACCGAACGTTTCGACGAAATTCACCGCACCCTGCGCCGTGACGCCTCCAATCAGGCGGCCGAGGCGGTACTgg < 2:2286529/150‑1 (MQ=255) tgcAGGACGACGCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCCGCTGGTGCGCGATGGAAGCCAGCAGACCGAACGTTTCGACGAAATTCACCGCACCCTGCGCCGTGACGCCTCCAATCAGGCGGCCGAGGCGGTACTGGCCCTGc > 2:2391173/1‑150 (MQ=255) tgcAGGACGACGCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCCGCTGGTGCGCGATGGAAGCCAGCAGACCGAACGTTTCGACGAAATTCACCGCACCCTGCGCCGTGACGCCTCCAATCAGGCGGCCGAGGCGGTACTGGCCCTGc > 1:823507/1‑150 (MQ=255) cAGGACGACGCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCCGCTGGTGCGCGATGGAAGCCAGCAGACCGAACGTTTCGACGAAATTCACCGCACCCTGCGCCGTGACGCCTCCAATCAGGCGGCCGAGGCGGTACTGGCCCTGCTc > 1:291466/1‑150 (MQ=255) acgacgCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCCGCTGGTGCGCGATGGAAGCCAGCAGACCGAACGTTTCGACGAAATTCACCGCACCCTGCGCCGTGACGCCTCCAATCAGGCGGCCGAGGCGGTACTGGCCCTGCTCAAgg < 2:291466/150‑1 (MQ=255) cgacgCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCCGCTGGTGCGCTATGGAAGCCAGCAGACCGAACGTTTCGACGAAATTCACCGCACCCTGCGCCGTGACGCCTCCAATCAGGCGGCCGAGGCGGTACTGGCCCTGCTCAAGGa < 1:1968859/150‑1 (MQ=255) cgCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCcgctggtagcgtcgtcctgcagcaactcgggcaccagctctcgctgg > 1:773474‑M2/1‑35 (MQ=255) cgCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCcgctggtagcgtcgtcctgcagcaactcgggcaccagctctcgctgg > 1:2010978‑M2/1‑35 (MQ=255) cgCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCcgctggtagcgtcgtcctgcagcaactcgggcaccagctctcgctgg < 2:773474‑M2/82‑48 (MQ=255) cgCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCcgctggtagcgtcgtcctgcagcaactcgggcaccagctctcgctgg < 2:2010978‑M2/82‑48 (MQ=255) gCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCCGCTGGTGCGCGATGGAAGCCAGCAGACCGAACGTTTCGACGAAATTCACCGCACCCTGCGCCGTGACGCCTCCAATCAGGCGGCCGAGGCGGTACTGGCCCt < 1:93664/137‑1 (MQ=255) gCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCCGCTGGTGCGCGATGGAAGCCAGCAGACCGAACGTTTCGACGAAATTCACCGCACCCTGCGCCGTGACGCCTCCAATCAGGCGGCCGAGGCGGTACTGGCCCt > 2:93664/1‑137 (MQ=255) gCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCCGCTGGTGCGCGATGGAAGCCAGCAGACCGAACGTTTCGACGAAATTCACCGCACCCTGCGCCGTGACGCCTCCAATCAGGCGGCCGAGGCGGTACTGGCCCTGCTCAAGGACCGc < 1:969584/150‑1 (MQ=255) gCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCCGCTGGTGCGCGATGGAAGCCAGCAGACCGAACGTTTCGACGAAATTCACCGCACCCTGCGCCGTGACGCCTCCAATCAGGCGGCCGAGGCGGTACTGGCCCTGCTCAAGGACCGc < 2:1245763/150‑1 (MQ=255) tACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCcgctggtagcgtcgtcctgcagcaactcgggcaccagctctcgctgggccagcaggtttggcaatgacacgtaagggcttttcaccagacgcttgagaatccagaaggtcaagggcgc < 2:2049770‑M2/150‑119 (MQ=255) cAGCGgcgccagggtgttggccagcgcttcgctggtagcgtcgtcctgcagcaactcgggcaccagctctcgctgggccagcaggttcggcaatgacacgtaagggcttttcaccagacgcttgagaatccagaaggtcaagggcgccag > 1:1070503‑M1/1‑5 (MQ=255) aGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCCGCTGGTGCGCGATGGAAGCCAGCAGACCGAACGTTTCGACGAAATTCACCGCACCCTGCGCCGTGACGCCTCCAATCAGGCGGCCGAGGCGGTACTGGCCCTGCTCAAGGACCGCTGACAt < 2:35264/150‑1 (MQ=255) aGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCCGCTGGTGCGCGATGGAAGCCAGCAGACCGAACGTTTCGACGAAATTCACCGCACCCTGCGCCGTGACGCCTCCAATCAGGCGGCCGAGGCGGTACTGGCCCTGCTCAAGGACCGCTGACAt < 1:233898/150‑1 (MQ=255) aGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCCGCTGGTGCGCGATGGAAGCCAGCAGACCGAACGTTTCGACGAAATTCACCGCACCCTGCGCCGTGACGCCTCCAATCAGGCGGCCGAGGCGGTACTGGCCCTGCTCAAGGACCGCTGACAt > 2:2170020/1‑150 (MQ=255) gCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCcgctggtagcgtcgtcctgcagcaactcgggcaccagctctcgctgggccagcaggtttggcaatgacacgtaagggcttttcaccagacgcttgagaatccagaaggtcaagggcgccaggc > 1:2049770‑M2/1‑27 (MQ=255) cggcgccagggtgttggccagcgcttcgctggtagcgtcgtcctgccttaactcgggcaccagctctcgctgggccagcaggttcggcaatgacacgtaagggcttttcaccagacgcttgagaatccagaaggtcaagggcgccaggcg < 1:1452740‑M1/150‑149 (MQ=255) ggcgccagggtgttggccagcgcttcgctgggagcgtcgtcctgcagcaactcgggcaccagctctcgctgggccagcaggttcggcaatgacacgtaagggcttttcaccagacgcttgagaatccagaaggtcaagggcgccaggcgg < 2:943626‑M1/150‑150 (MQ=255) | GGCCGATGGTAGTGGCGTACCGCCTGGCGCCCTTGACCTTCTGGATTCTCAAGCGTCTGGTGAAAAGCCCTTACGTGTCATTGCCGAACCTGCTGGCCCAGCGAGAGCTGGTGCCCGAGTTGCTGCAGGACGACGCTACCAGCGAAGCGCTGGCCAACACCCTGGCGCCGCTGGTGCGCGATGGAAGCCAGCAGACCGAACGTTTCGACGAAATTCACCGCACCCTGCGCCGTGACGCCTCCAATCAGGCGGCCGAGGCGGTACTGGCCCTGCTCAAGGACCGCTGACATGCA > NC_002947/1798961‑1799253 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |