New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2054743 | 124 (1.330) | 6 (0.070) | 6/238 | NT | 5.5% | intergenic (‑75/‑160) | PP_1829/aroC | alpha/beta family hydrolase/chorismate synthase |
? | NC_002947 | = 2054829 | 90 (1.010) | intergenic (‑161/‑74) | PP_1829/aroC | alpha/beta family hydrolase/chorismate synthase |
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
TTGCAGTACAGTGGGGGCGGCGGCCTGGGCCAGGCCAGTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCATCTGTATACTGCTGCTTTCGTCCATTTCAGGCAGAACTC > NC_002947/2054594‑2054891 | ttGCAGTACAGTGGGGGCGGCGGCCTGGGCCAGGCCAGTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCC < 2:1781258‑M1/150‑1 (MQ=255) gCAGTACAGTGGGGGCGGCGGCCTGGGCCAGGCCAGTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCag > 1:2357728‑M1/1‑148 (MQ=255) gTACAGTGGGGGCGGCGGCCTGGGCCAGGCCAGTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTc > 1:2305480/1‑150 (MQ=255) cAGTGGGGGCGGCGGCCTGGGCCAGGCCAGTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTcgcg < 1:2220014/150‑1 (MQ=255) aGTCGGGGCGGCGGCCTGGGCCAGGCCAGTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCgg < 1:1797674/150‑1 (MQ=255) tGGGGGCGGCGGCCTGGGCCAGGCCAGTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGt < 1:1043159/150‑1 (MQ=255) cggcggcCTGGGCCAGGCCAGTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAAcc < 2:111600/149‑1 (MQ=255) ggcggcCTGGGCCAGGCCAGTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCg > 2:1826988/1‑150 (MQ=255) actggcCTGGCCCAGGCCAGTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCg > 1:2025770/4‑150 (MQ=255) ccTGGGCCAGGCCAGTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCt > 2:263823/1‑150 (MQ=255) gggCCAGGCCAGTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACg > 1:1608862/1‑150 (MQ=255) ggccaggccaGTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgg < 1:113311/150‑1 (MQ=255) ccaggccagTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCgg < 2:535954/130‑1 (MQ=255) ccaggccagTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgggg > 2:556998/1‑150 (MQ=255) aggccagTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGc < 1:2006287/150‑1 (MQ=255) ggccagGGCAGAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCt < 2:518528/150‑1 (MQ=255) gccagTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTg < 1:1132171/150‑1 (MQ=255) ccagTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGc < 1:2429130/150‑1 (MQ=255) cagTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGAGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGca > 2:1346597/1‑150 (MQ=255) tGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCACTCCTACGGGGGCTGCacac < 2:728933/150‑1 (MQ=255) ggCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCacac < 2:2115565/149‑1 (MQ=255) acaGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCAt > 1:1857931/1‑150 (MQ=255) cagcagGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCAtt < 2:2025770/150‑1 (MQ=255) agcagGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTg < 2:221945/150‑1 (MQ=255) gAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGc > 1:955257/1‑133 (MQ=255) ggCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCtggt < 2:180902/149‑1 (MQ=255) agCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCtggt < 1:737392/150‑1 (MQ=255) gCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCTTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCtggtg < 1:162767/150‑1 (MQ=255) gCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCtggtg < 2:1767309/150‑1 (MQ=255) gCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCtggtg < 1:2129386/150‑1 (MQ=255) aaGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTggtggt > 1:770463/1‑150 (MQ=255) gCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGc < 2:1427740/126‑1 (MQ=255) ccAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTAAAAAATTGTGTGCGGTAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCgt < 2:1882712/149‑1 (MQ=255) aCAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCgt < 1:1318358/150‑1 (MQ=255) aaGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGc < 1:1324992/118‑1 (MQ=255) aaGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTg > 1:205469/1‑130 (MQ=255) aaGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTg < 2:205469/130‑1 (MQ=255) ggCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAg > 1:1913585/1‑150 (MQ=255) gACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCctttcgcgggtaaacccgctcctacacggtcaccaccaggttccaatggtgtgcagcccccgtaggagcg < 2:2305480‑M1/150‑71 (MQ=255) aCATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCgg < 1:700883/150‑1 (MQ=255) aCATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTCACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCgg < 1:863130/150‑1 (MQ=255) catcatGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGGGGTGACCGTGTAGGAGCggg < 1:854876/150‑1 (MQ=255) tcatGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACg > 1:47524/1‑102 (MQ=255) catGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACg < 1:599812/101‑1 (MQ=255) tGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGca > 1:1361916/1‑108 (MQ=255) tGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGca < 2:1361916/108‑1 (MQ=255) gCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCtcttcgcgggtaaacccgctcctacacggtcaccaccaggttccaatggtgtgcagcccccgtaggagcgggttcacc > 1:2032935‑M1/1‑72 (MQ=255) gTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 2:433161/150‑1 (MQ=255) gTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTAC‑GGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCcgcg > 1:328876/1‑150 (MQ=255) cATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCtcttcgcgggtaaacccgctcctacacggtcaccaccaggttccaatggtgtgcagcccccgtaggagcgggttcacccgcgaaagg < 2:2032935‑M1/150‑88 (MQ=255) tGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTAccc < 2:2448028/140‑1 (MQ=255) tGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTAccc > 1:2448028/1‑140 (MQ=255) ggAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAggcc < 2:824838‑M2/148‑5 (MQ=255) ggAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAggcc > 1:824838‑M2/1‑144 (MQ=255) tgtgGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACgg > 2:1498817/1‑80 (MQ=255) tgtgGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAg < 2:388048/150‑1 (MQ=255) tgGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAg > 1:1817735‑M2/1‑137 (MQ=255) tgGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCGATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGc < 2:554753/150‑1 (MQ=255) ggTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCa < 1:1839148/150‑1 (MQ=255) gtgtGACCCAATGTGTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCAc < 1:102871/147‑1 (MQ=255) tttGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCAcc < 2:449899/150‑1 (MQ=255) tttGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCAcc > 1:449899/1‑150 (MQ=255) aCCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCGCCCAAc > 1:1452653/1‑150 (MQ=255) cccAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCtcttcgcgggtaaacccgctcctacacggtcaccaccaggttccaatggtgtgcagcccccgtag > 2:91783‑M1/1‑42 (MQ=255) ccAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAGCCTGGTGCTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGACCAGCACAGGCCACCCAACCa > 2:1212956/1‑150 (MQ=255) ccAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCa > 2:1637988/1‑150 (MQ=255) ccAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCa > 2:1238618/1‑150 (MQ=255) cGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCATCTGTATAct < 1:1716291/150‑1 (MQ=255) gggAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGc < 2:1994145/64‑1 (MQ=255) ggAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCATCTGTATActgc > 2:1915513/1‑150 (MQ=255) ggAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCATAAGTATActgc > 2:169369/1‑150 (MQ=255) gAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCATCTGTATActgct > 2:2396412/1‑150 (MQ=255) ttCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCAt < 1:1451489/133‑1 (MQ=255) ttCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCAt > 2:1451489/1‑133 (MQ=255) ttCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCATCTGTATACTGCTGCttt > 2:1331873/1‑150 (MQ=255) tCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTAGCTCAGGCCACCCAACCATCTGTATACTGCTGCTTTc > 2:190560/1‑150 (MQ=255) tCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCATCTGTATACTGCTGCTTTc > 1:1271453/1‑150 (MQ=255) tCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTGAGCCTCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCATCTGTATACTGCTGCTTTc < 1:169369/150‑1 (MQ=255) tacagggcaggTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCATCTGTATACTGCTGCTTTCGTcc > 1:1975761/3‑150 (MQ=255) tGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCATCTGTATACTGCTGCTTTCGTcc > 2:895267/1‑150 (MQ=255) gcagggcaggTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCATCTGTATACTGCTGCTTTCGTCCa > 2:1958504/1‑150 (MQ=255) ccgagctggTCTGGCCCGTTCGCGGGTGAACCCGCTGATAGGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCATCTGTATACTGCTGCTTTCGTCCAt < 1:1946448/143‑1 (MQ=38) aggTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCATCTGTATACTGCTGCTTTCGTCCATTTCAgg < 2:1651623/150‑1 (MQ=255) aggTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCAAAGGCCACCTAACGATCTGTATACTGCTGCCTTCGTCCAGTTCAgg > 2:261471/1‑150 (MQ=39) cTGGCCtcttcgcgggtaaacccgctcctacacggtcaccaccaggttccaatggtgtgcagcccccgtaggagcgggttcacccgcgaaagggccagacctgccctgcatagaaccttcccgcaaacattgggtcaaacccacacctcc > 1:1679106‑M1/1‑6 (MQ=255) tGGCCtcttcgcgggtaaacccgctcctacacggtcaccaccaggttccaatggtgtgcagcccccgtaggagcgggttcacccgcgaaagggccagacctgccctgcatagaaccttcccgcaaacattgggtcaaacccacacctccc > 2:203565‑M1/1‑5 (MQ=255) tGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCgg < 1:2287536/76‑1 (MQ=255) tGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCgg > 2:2287536/1‑76 (MQ=255) tGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAAc < 2:84856/112‑1 (MQ=255) tGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCATCt > 1:213679/1‑117 (MQ=255) tGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCATCt < 2:213679/117‑1 (MQ=255) ggCCtcttcgcgggtaaacccgctcctacacggtcaccaccaggttcccatggtgtgcagcccccgtaggagcgggttcacccgcgaaagggccagacctgccctgcatagaaccttcccgcacacattgggtcaaacccacacctcccc > 1:329261‑M1/1‑4 (MQ=255) ggCCtcttcgcgggtaaacccgctcctacacggtcaccaccaggttccaatggtgtgcagcccccgtaggagcgggttcacccgcgaaagggccagacctgccctgcatagaaccttcccgcaaacattgggtcaaacccacacctcc > 1:824838‑M1/1‑4 (MQ=255) ggCCtcttcgcgggtaaacccgctcctacacggtcaccaccaggttccaatggtgtgcagcccccgtaggagcgggttcacccgcgaaagggccagacctgccctgcatagaaccttcccgcaaacattgggtcaaacccacacctcc < 2:824838‑M1/148‑145 (MQ=255) gCCtcttctcgggtaaacccgctcctacacggtcaccaccaggttccaatggtgtgcagcccccgtaggagcgggttcacccgcgaaagggccagacctgccctgcatagaaccttcccgcaaacattgggtcaaacccacacctcccca < 2:485701‑M1/150‑148 (MQ=255) cctcttcgcgggtaaacccgctcctacacggtcaccaccaggttccaatggtgtgcagcccccgtaggagcgggttcacccgcgaaagggccagacctgccctgcatagaaccttcccgcaaacattgggtcaaacccacacctccccat > 2:1040129‑M1/1‑2 (MQ=255) ctcttcgcgggtaaacccgctcctacacggtcaccaccaggttccaatggtgtgcagcccccgtaggagcgggttcacccgcgaaagggccagacctgccctgcatagaaccttcccgcaaacattgggtcaaaccca > 1:1817735‑M1/1‑1 (MQ=255) ctcttcgcgggtaaacccgctcctacacggtcaccaccaggttccaatggtgtgcagcccccgtaggagcgggttcacccgcgaaagggccagacctgccctgcatagaaccttcccgcaaacattgggtcaaaccca < 2:1817735‑M1/138‑138 (MQ=255) ccTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGCTTACCCGCGAAGAggc > 1:881752‑M2/1‑87 (MQ=255) ccTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGCTTACCCGCGAAGAggc < 2:881752‑M2/90‑4 (MQ=255) | TTGCAGTACAGTGGGGGCGGCGGCCTGGGCCAGGCCAGTGCACAGCAGGAAGAGCAAGGCGACAAGGCGCGACATCATGCGGTACTACATGGGGAGGTGTGGGTTTGACCCAATGTTTGCGGGAAGGTTCTATGCAGGGCAGGTCTGGCCCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGGCTGCACACCATTGGAACCTGGTGGTGACCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCCACCCAACCATCTGTATACTGCTGCTTTCGTCCATTTCAGGCAGAACTC > NC_002947/2054594‑2054891 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |