New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3036028 = | 89 (0.950) | 6 (0.070) | 5/242 | NT | 6.9% | coding (426/930 nt) | PP_2648 | universal stress protein family protein |
? | NC_002947 | 3036056 = | 77 (0.850) | coding (398/930 nt) | PP_2648 | universal stress protein family protein |
CCTTGGCCAATTCGATCGTGCGCAGTGAAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCTGCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAACAGCA > NC_002947/3035880‑3036170 | ccTTGGCCAATTCGATCGTGCGCAGTGAAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCcagcagca > 2:1751268/1‑150 (MQ=255) cgcaggcgagaaaacccacgcactggcagcgctgctgttccagcgttccggtatctacaatcgagcgcatggcgccagcggctcggtgatcacggagatcaaccgggtggtgcaggacaagcacagcgacctgctggtgtgtggggcCAg > 1:542567‑M1/148‑150 (MQ=255) cgcaggcgagaaaacccacgcactggcagcgctgctgttccagcgttacggtatataagatggtgcgccatgtgccagcgcctcggtgatcacggagatcaaccgggtggtgcaggacaagcacagcgacctgctggtgtgtggggcCAg > 1:542392‑M1/148‑150 (MQ=255) aTTCGATCGTGCGCAGTGAAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCcgcg > 2:2426234/1‑150 (MQ=255) ttCGATCGTGCGCAGTGAAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCGGGcgcctccc > 2:1356772/1‑146 (MQ=255) ttCGATCGTGCGCAGTGAAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCgcgc > 1:820529/1‑150 (MQ=255) tCGATCGTGCGCAGTGAAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCGTGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCt > 2:2047618/1‑150 (MQ=255) gATCGTGCGCAGTGAAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTAc < 1:380123/150‑1 (MQ=255) tCGTGCGCAGTGAAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGACGCATTCGC‑GGGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGc > 1:1331733/1‑150 (MQ=255) tGCGCAGTGAAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGctct < 1:1802094/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGTGAAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGctct < 1:609743/150‑1 (MQ=255) gcgcAGTGAAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTctg < 1:1977179/150‑1 (MQ=255) gcAGTGAAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTctggc > 1:1422355/1‑150 (MQ=255) aGTGAAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTctggccc < 1:2426234/150‑1 (MQ=255) gTGAAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTctggcccc < 2:907305/150‑1 (MQ=255) gTGAAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTctggcccc < 2:1446984/150‑1 (MQ=255) gTGAAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCCctggcccc > 1:1080525/1‑150 (MQ=255) gAAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTctggcccctg < 2:863727/150‑1 (MQ=255) 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cTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGt > 1:387803/1‑150 (MQ=255) tGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTc > 1:1710427/1‑150 (MQ=255) gCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGc > 2:615816/1‑150 (MQ=255) gCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGc > 1:2115861/1‑150 (MQ=255) cACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGACGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCt < 2:1772653/150‑1 (MQ=255) 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gAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCTGCACGCCAGCggg > 1:1780911/1‑149 (MQ=255) aGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGt < 1:1857595/103‑1 (MQ=255) aGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGt > 2:1857595/1‑103 (MQ=255) aGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTg < 2:197945/105‑1 (MQ=255) aGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTg > 1:197945/1‑105 (MQ=255) cAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCTGCACGCCAGCGGAGAt < 1:615816/150‑1 (MQ=255) gTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCTGCACGCCAGCGGAGATAc < 1:2065873/150‑1 (MQ=255) tttCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGcacca > 2:685036/1‑92 (MQ=255) tttCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGcacca > 2:685988/1‑92 (MQ=255) tttCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGcacca < 1:685036/92‑1 (MQ=255) tttCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGcacca < 1:685988/92‑1 (MQ=255) cTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCTGCACGCCAGCGGAGATACCGTa > 2:772926/1‑150 (MQ=255) cGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACATCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTTTTTGTTCACCGCGCCGCTGGCGACCTGCACGCCAGCGGAGATACCGTAAAGCt < 1:1879209/150‑1 (MQ=255) gTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCTGCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTgg > 2:1750714/1‑150 (MQ=255) aaCCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCTGCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAAca > 2:2115181/1‑150 (MQ=255) aCCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCTGCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAAcag > 1:688720/1‑150 (MQ=255) aCCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCTGCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAAcag < 2:1319445/150‑1 (MQ=255) ccAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCTGCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAAcagca > 1:1094151/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGCAAACGACGAGGTGCGCGCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCTGCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAAcagca > 2:1798409/1‑150 (MQ=255) | CCTTGGCCAATTCGATCGTGCGCAGTGAAACGGACGAAAAATCGACTGGCACCAGCACGGTGCGGTAGGCATCACGAGGGGCCGGCTTGAC‑CACCAGCAAAGGGCAGGGCATGCGGTTGAGCAGTTTCTGCACGGTCGAACCCAGCAGCAGGCGCCGCGCTACGCTCTGGCCCCTGGCCCCACACACCAGCAGGTCGCTGTGCTTGTCCTGCACCACCCGGTTGATCTCCGTGATCACCGAGCCGCTGGCGACCTGCACGCCAGCGGAGATACCGTAACGCTGGAACAGCA > NC_002947/3035880‑3036170 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |