New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4039437 = | 85 (0.910) | 10 (0.110) | 7/236 | NT | 11.8% | coding (250/864 nt) | PP_3560 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 4039462 = | 69 (0.780) | coding (275/864 nt) | PP_3560 | LysR family transcriptional regulator |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
GCACATCAAAACCCTCGAAGACGAACTGAAGGTGACCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGCAGCTACACATCAGCGTGGCCTCGGGCATGTCGGCGGAGCTGGCGCG > NC_002947/4039289‑4039585 | tcgagctcaccgtcttccacgcgccgcgccagctccgccgacatgcccgaggccacgctgatgtgtagctgcgggtgatgggccttgatccacaccagcgccttgggcaaacgccgcgccagcaccgtgtggatcgcccccaggcgcaaa < 2:1767606‑M1/2‑2 (MQ=255) cacaTCAAAACCCTCGAAGACGAACTGAAGGTGACCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTCCTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGc < 1:2369366/150‑1 (MQ=255) gagctcaccgtcttccacgcgccgcgccagctccgccgacatgcccgaggccacgctgatgtgtagctgcgggtgatgggccttgatccacaccagcgcctttggcaaacgccgcgccagcaccgtgtggatcgcccccaggcgcaAGCg > 2:1863367‑M1/147‑150 (MQ=255) gagctcaccgtcttccacgcgccgcgccagctccgccgacatgcccgaggccacgctgatgtgtagctgcgggtgatgggccttgatccacaccagcgccttgggcaaacgccgcgccagcaccgtgtggatcgcccccaggcgcaAGCg < 2:1594797‑M1/4‑1 (MQ=255) agctcaccgtcttccacgcgccgcgccagctccgccgacatgcccgaggccacgctgatgtgtagctgcgggtgatgggccttgatacacaccagcgcattgggcaaacgccgcgccagcaccgtgtggatcgcccccaggcgcaAGCgg < 1:2366842‑M1/5‑1 (MQ=255) aTCAAAACCCTCGAAGACGAACTGAAGGTGACCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGc > 2:2390070/1‑150 (MQ=255) aTCAAAACCCTCGAAGACGAACTGAAGGTGACCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGACGGTGCCCTGGCGAGCGGc > 2:1878258/1‑150 (MQ=255) cAAAACCCTCGAAGACGAACTGAAGGTGACCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAGAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGccg < 1:2390070/150‑2 (MQ=255) aaaCCCTCGAAGACGAACTGAAGGTGACCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGTCGGTGGCCCCCCCCGAAAGGCGTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCaa < 1:2124298/150‑1 (MQ=255) aaCCCTCGAAGACGAACTGAAGGTGACCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAg < 1:9968/150‑1 (MQ=255) aCCCTCGAAGACGAACTGAAGGTGACCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGc < 1:1916575/150‑1 (MQ=255) cccTCGAAGACGAACTGAAGGTGACCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCaa > 1:1476639/1‑147 (MQ=255) cccTCGAAGACGAACTGAAGGTGACCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCaa < 2:1476639/147‑1 (MQ=255) tCGAAGACGAACTGAAGGTGACCTTGTTCGACCGTATCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTgc > 1:2150242/1‑150 (MQ=255) tCGAAGACGAACTGAAGGTGACCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACGGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTgc > 2:1902123/1‑150 (MQ=255) cgcgccgcgccagctccgccgacatgcccgaggccacgctgatgtgtagctgcgggtgatgggccttgatccacaccagcgccttgggcaaacgccgcgccagcaccgtgtggatcgcccccaggcgcaAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGc > 1:2323677‑M1/130‑150 (MQ=255) agAACTGAAGGTGACCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCg < 1:404330/149‑1 (MQ=255) cgcgccagctccgccgacatgcccgaggccacgctgatgtgtagctgcgggtgatgggccttgatccacaccagcgccttgggcaaacgccgcgccagcaccgtgtggatcgcccccaggcgcaAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCtt > 1:1594797‑M1/125‑150 (MQ=255) cgcgccagctccgccgacatgcccgaggccacgctgatgtgtagctgcgggtgatgggccttgatccacaccagcgccttgggcaaacgccgcgccacaatcttgttgatcgcccccaggcgcaAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCtt > 1:2275294‑M1/125‑150 (MQ=255) aCTGAAGGTGACCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCtt < 2:359480/150‑1 (MQ=255) cggAAGGTGACCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCAGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTg < 2:377135/148‑1 (MQ=255) cTGAAGGTGACCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGc < 1:1097137/144‑1 (MQ=255) cTGAAGGTGACCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGc > 2:1097137/1‑144 (MQ=255) ggTGACCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCt < 1:629213/150‑1 (MQ=255) gctccgccgacatgcccgaggccacgctgatgtgtagctgcgggtgatgggccttgatccacaccagcgccttgggcaaacgccgcgccagcaccgtgtggatcgcccccaggcgccAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTg > 2:1554328‑M1/118‑150 (MQ=255) gTGACCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTg < 1:631431/150‑1 (MQ=255) tccgccgacatgcccgaggccacgctgatgtgtagctgcgggtgatgggccttgatccacaccagcgccttgggcaaacgccgcgccagcaccgtgtggatcgcccccaggcgcaAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTggg < 2:183478‑M1/35‑1 (MQ=255) ctccgccgacatgcccgaggccacgctgatgtgtagctgcgggtgatgggccttgatccacaccagcgccttgggcaaacgccgcgccagcaccgtgtggatcgccccctggcca‑GCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTgggg > 2:2055030‑M1/116‑150 (MQ=255) aCCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTgggg < 1:1502613/150‑1 (MQ=255) cgccgacatgcccgaggccacgctgatgtgtagctgcgggtgatgggccttgatccacaccagcgccttgggcaaacgccgcgccagcaccgtgtggatcgcccccaggcgcaAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTggggg > 1:183478‑M1/114‑150 (MQ=255) ccTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTgggat < 1:1902123/150‑3 (MQ=255) cTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGc > 2:245331/1‑124 (MQ=255) cTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGc < 1:245331/124‑1 (MQ=255) ttGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTgcgc > 1:2184778/1‑129 (MQ=255) ttGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTgcgc < 2:2184778/129‑1 (MQ=255) gTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGAt < 1:130262/150‑1 (MQ=255) aCCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCcaca > 1:1936773/1‑150 (MQ=255) ccGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCacac > 1:1640553/1‑150 (MQ=255) aGCCGCGGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCACGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑Tg < 1:790459/150‑1 (MQ=255) aGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑Tg < 1:571582/150‑1 (MQ=255) gcaggcagGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTgg < 2:2150242/150‑1 (MQ=255) caggcaggTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCca > 1:1169642/1‑138 (MQ=255) caggcaggTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCca < 2:1169642/138‑1 (MQ=255) aggTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑Cgcggc < 1:1135188/150‑1 (MQ=255) aCTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGcc < 2:592711/150‑1 (MQ=255) tgcgggtgatgggccttgatccacaccagcgccttgggcaaacgccgcgccagcaccgtgtggatcgcccccaggcgcaAGCGGc < 1:1188010‑M1/6‑1 (MQ=255) tgcgggtgatgggccttgatccacaccagcgccttgggcaaacgccgcgccagcaccgtgtggatcgcccccaggcgcaAGCGGc > 2:1188010‑M1/80‑85 (MQ=255) aCCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAg < 1:1187080/150‑1 (MQ=255) aCCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAg > 2:464585/1‑150 (MQ=255) cGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGgc > 2:2035808/1‑150 (MQ=255) 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cAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTgg > 2:59751/1‑150 (MQ=255) ttgatccacaccagcgccttgggcaaacgccgcgccagcaccgtgtggatcgcccccaggcgcaAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCtt < 1:2039502‑M1/26‑1 (MQ=255) ttGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCt > 2:1888433/1‑116 (MQ=255) ggTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGc > 1:294153/1‑150 (MQ=255) cacaccagcgccttgggcaaacgccgcgccagcaccgtgtggatcgcccccaggcgcaa < 2:2213216‑M1/1‑1 (MQ=255) cacaccagcgccttgggcaaacgccgcgccagcaccgtgtggatcgcccccaggcgcaa > 1:2213216‑M1/59‑59 (MQ=255) gTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCATGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGcc > 2:722782/1‑150 (MQ=255) 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aaaGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTg < 1:911782/122‑1 (MQ=255) aaaGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTg > 2:911782/1‑122 (MQ=255) aaaGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGtgtg > 2:2129494/1‑127 (MQ=255) aaaGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGtgtg < 1:2129494/127‑1 (MQ=255) aaaGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGCAGc > 2:1348879/1‑150 (MQ=255) aGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGCAGCTa < 1:1497826/150‑1 (MQ=255) cTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGCAGCTacac < 2:2121581/150‑1 (MQ=255) ttCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGCAGCTAcaca > 1:332098/1‑150 (MQ=255) cTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGCAGCTACACATc < 2:193865/150‑1 (MQ=255) tGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGCAGCTACACATCa > 1:759152/1‑150 (MQ=255) ggCTGCCTATGACGCACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGCAGCTACACATCAg < 1:492456/150‑1 (MQ=255) gCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGCTCCACCCGGTTGATGG‑C‑CGGCGGTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGCAGCTACACATCAGc > 1:1750065/1‑150 (MQ=255) tGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCaa > 1:737836/1‑102 (MQ=255) tGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCaa < 2:737836/102‑1 (MQ=255) ccTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGCAGCTACACATCAGCGTgg < 2:1859973/150‑1 (MQ=255) cTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGCAGCTACACATCAGCGTg < 1:1895894/148‑1 (MQ=255) cTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGCAGCTACACATCAGCGTg > 2:1895894/1‑148 (MQ=255) tGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTg < 2:1808141/103‑1 (MQ=255) tGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTg > 1:1808141/1‑103 (MQ=255) gAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGCAGCTACACATCAGCGTGGCCTCGGGc > 1:833024/1‑150 (MQ=255) cTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGc < 1:1745080/121‑1 (MQ=255) cTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGc > 2:1745080/1‑121 (MQ=255) tGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGcc > 2:693396/1‑110 (MQ=255) tGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGcc < 1:693396/110‑1 (MQ=255) gCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGCAGCTACACATCAGCGTGGCCTCGGGCATGTcg > 2:1906524/1‑150 (MQ=255) cGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGCAGCTACACATCAGCGTGGCCTCGGGCATGTcggc < 1:2397424/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGCAGCTACACATCAGCGTGGCCTCGGGCATGTCGGCGGAGCt > 1:1806547/1‑150 (MQ=255) cAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGCAGCTACACATCAGCGTGGCCTCGGGCATGTCGGCGGAGCTggcgcg > 2:2245201/1‑150 (MQ=255) | GCACATCAAAACCCTCGAAGACGAACTGAAGGTGACCTTGTTCGACCGTAGCCGCAGGCAGGTGGTACTGACCGAAGCTGGCCAGTTGGCGGTGGCCCGCGCCGAAAGCCTTCTGGCTGCCTATGACGAACTGGCCGATGCCCTGGCCAGCGGCCCAAGCCTGCGCGGCCGCTTGCGCCTGGGGGCGATCCACACGG‑TGCTGG‑CGCGGCGTTTGCCCAAGGCGCTGGTGTGGATCAAGGCCCATCACCCGCAGCTACACATCAGCGTGGCCTCGGGCATGTCGGCGGAGCTGGCGCG > NC_002947/4039289‑4039585 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |