| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4573275 | 102 (1.090) | 5 (0.070) | 5/200 | NT | 5.2% | intergenic (+39/‑98) | PP_4054/glgX | hypothetical protein/glycogen debranching enzyme |
| ? | NC_002947 | = 4573292 | 101 (1.350) | intergenic (+56/‑81) | PP_4054/glgX | hypothetical protein/glycogen debranching enzyme | |||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
GCAGCGGCCAAGCCGAAGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACCCGCTCGGTCGCACCATCGCGCATTC > NC_002947/4573126‑4573424 | gCAGCGGCCAAGCCGAAGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA > 2:1734822‑M1/1‑150 (MQ=255) cAAGCCGAAGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTTCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTACGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑tcatc > 1:1773089/1‑150 (MQ=255) cGAAGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAgg < 2:49460/150‑1 (MQ=255) aaGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGgcg > 2:770077/1‑150 (MQ=255) ggCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCa < 2:1623338/150‑1 (MQ=255) gcCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCAtgt < 2:2305721‑M2/150‑4 (MQ=255) cTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGTGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCAtgtag > 1:1086558‑M2/1‑145 (MQ=255) cTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCAtgtag < 1:516098‑M2/150‑6 (MQ=255) cGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCAtgtaggagc > 2:1294079‑M2/1‑141 (MQ=255) cGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGACGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCAtgtaggagc < 2:1659650‑M2/150‑10 (MQ=255) gAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCAtgtaggagcg > 2:926193‑M2/1‑140 (MQ=255) aaCCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAtgcgcctgtgatgaacctgtaggagcgg < 1:2334383‑M1/150‑29 (MQ=255) aaCCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCAtgtaggagcgg > 2:737134‑M2/1‑139 (MQ=255) aaCCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCAtgtaggagcgg > 1:1297698‑M2/1‑139 (MQ=255) aCCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGTCAAGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCAtgtaggagcggg > 1:1841040‑M2/1‑138 (MQ=255) cAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCAtgtaggagcgggttt < 1:756687‑M2/150‑16 (MQ=255) cAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCAtgtaggagcgggttt > 1:236366‑M2/1‑135 (MQ=255) ggcggcTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCAtgtaggagcgggtaaacc > 1:881041‑M2/1‑132 (MQ=255) cctgccGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTg > 1:579906/1‑150 (MQ=255) ctgccGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTgg < 1:575013/150‑1 (MQ=255) tgccGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGc < 2:1602038/150‑1 (MQ=255) tgccGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCACCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGc > 2:438382/1‑150 (MQ=255) ccGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCa > 1:1639993/1‑150 (MQ=255) 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ccGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGGAGTGGCCAATGCAGGACAGCGCAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACCCGGTCGTTCGCAccc > 2:1330488/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACCCGCt > 1:486137/1‑139 (MQ=255) ccGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACCCGCt < 2:486137/139‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAACAAAACCCGCTCGGTCGCACCa > 2:1099163/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACAtgcgcctgtgatgaacctgtaggagcgggtttacccgcgaagaggcccggacaggcttaaccggcagtaggctttttcaccgcccggggctttttcaccgcagtgggtttaacccccggcagggcagccgccttgggttc > 2:926193‑M1/1‑10 (MQ=255) gCTCCTACAtgcgcctgtgatgaacctgtaggagcgggtttacccgcgaagaggcccggacaggcttaacctgcagtaggctttttcaccgcctggggctttttcaccgcagtgggtttaacccccggcagggcagccgccttgggttcg < 1:396556‑M1/150‑142 (MQ=255) gCTCCTACAtgcgcctgtgatgaacctgtaggagcgggtttacccgcgaagaggcccggacaggcttaaccggcagtaggctttttcaccgcccggggctttttcaccgcagtgggtttaacccccggcagggcagccgccttgggttcg > 2:1294079‑M1/1‑9 (MQ=255) tCCTACAtgcgcctgtgatgaacctgtaggagcgggtttcccagccggtgacgctgcactggcttaaccggcagtaggctttttcaccgcccggggctttttcaccgcagtgggtttaacccccggcagggcagccgccttgggttcggc < 2:1242633‑M1/150‑144 (MQ=255) tCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCaaa < 1:2098826/124‑1 (MQ=255) cTACAtgcgcctgtgatgaacctgtaggagcgggtttacccgcgaagaggcccggacaggcttaaccggcagtaggctttttcaccgcccggggctttttcaccgcagtgggtttaacccccggcagggcagccgccttgggttcggcag < 1:2237816‑M1/150‑146 (MQ=255) cTACAtgcgcctgtgatgaacctgtaggagcgggtttacccgcgaagaggcccggacaggcttaaccggcagtaggctttttcaccgcccggggctttttcaccgcagtgggtttaacccacggcagggcagccgccttgggttcggcag > 1:1086558‑M1/1‑5 (MQ=255) aCAtgcgcctgtgatgaacctgtaggagcgggtttacccgcgaagaggcccggacaggcttaaccggcagtaggctttttcaccgcccggggctttttcaccgcagtgggtttaacccccggcagggcagccgccttgggttcggcaggc < 2:236366‑M1/150‑148 (MQ=255) aCAtgcgcctgtgatgaacctgtaggagcgggtttacccgcgaagaggcccggacaggcttaaccggcagtaggctttttcaccgcccggggctttttcaccgcagtgggtttaacccccggcagggcagccgccttgggttcggcaggc < 2:975931‑M1/150‑148 (MQ=255) aGGT‑TCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCACGCACCCCAAAGAAAACCCGCTCGGTCGCACCATCGCGCATTc > 1:1529501/1‑150 (MQ=255) | GCAGCGGCCAAGCCGAAGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGT‑TCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACCCGCTCGGTCGCACCATCGCGCATTC > NC_002947/4573126‑4573424 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |