New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4666548 | 112 (1.200) | 7 (0.080) | 9/232 | NT | 6.2% | coding (268/1854 nt) | nuoL | NADH‑quinone oxidoreductase subunit L |
? | NC_002947 | = 4666557 | 109 (1.260) | coding (277/1854 nt) | nuoL | NADH‑quinone oxidoreductase subunit L |
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
GCCACGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAACCTGCT > NC_002947/4666407‑4666696 | ccACGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCg > 2:2232567/1‑150 (MQ=255) cACGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGt < 1:417514‑M2/150‑2 (MQ=255) aCGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGtg > 1:819663‑M2/1‑148 (MQ=255) aCGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGtg > 1:1164700‑M2/1‑148 (MQ=255) cGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGCGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCTGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGtgg > 1:758058‑M2/1‑147 (MQ=255) cGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGtgg > 1:243956‑M2/1‑147 (MQ=255) cGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGtgg > 1:172296‑M2/1‑147 (MQ=255) ccgccTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGCCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCAcgccgagcatggtga < 1:1420202‑M1/150‑16 (MQ=255) cgccTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGATGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGtggtgac > 2:287318‑M2/1‑143 (MQ=255) ccTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGtggtgaccg < 1:2056294‑M2/150‑10 (MQ=255) cTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCg‑g > 2:276817/1‑150 (MQ=255) gTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCTGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTc < 1:1699095/150‑1 (MQ=255) gTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTc > 2:1869162/1‑150 (MQ=255) tCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCg < 1:1237647/150‑1 (MQ=255) tCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCg < 1:862749/150‑1 (MQ=255) tCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCACGC‑CGAGCAtggtgaccgacag < 2:1683642‑M2/145‑14 (MQ=255) tCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCACGC‑CGAGCAtggtgaccgacag > 1:1683642‑M2/1‑132 (MQ=255) ggCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTcc > 2:652281/1‑150 (MQ=255) gCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCt > 2:1116227/1‑150 (MQ=255) ttCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGtggtgac > 1:611246‑M2/1‑124 (MQ=255) ttCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATc < 2:1597444/150‑1 (MQ=255) ttCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATc > 1:1991190/1‑150 (MQ=255) tCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATcc < 2:1126084/150‑1 (MQ=255) accGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGCACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGCCCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCAc < 2:1123473/148‑1 (MQ=255) aaCGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCAc < 1:562854/150‑1 (MQ=255) aaCGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCAc < 2:1415582/150‑1 (MQ=255) gTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTg > 1:815858/1‑150 (MQ=255) cGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGtt < 2:815858/150‑1 (MQ=255) gCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTc < 2:206237/150‑1 (MQ=255) ccccGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑gtgt < 1:963328/127‑1 (MQ=255) ccccGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGAACG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCg > 2:1002849/1‑150 (MQ=255) cccGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGc > 1:694211/1‑150 (MQ=255) cccGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGCTGGCCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGc > 2:1246783/1‑150 (MQ=255) cccGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCGTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGc > 2:83163/1‑150 (MQ=255) tGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTg > 1:1350031/1‑150 (MQ=255) gcgcGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGc < 1:1869162/150‑1 (MQ=255) gcgcGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGGCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGCTCCCCCTGTTCGCATCCTGGTACATGc < 2:31697/150‑1 (MQ=255) agccagcTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGaa < 1:1169644/150‑1 (MQ=255) agccagcTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGaa > 1:1094591/1‑150 (MQ=255) agccagcTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCACGC‑CGAGCAtggtgaccgacaggccgtcc < 2:1917244‑M2/111‑21 (MQ=255) agccagcTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCACGC‑CGAGCAtggtgaccgacaggccgtcc > 1:1917244‑M2/1‑91 (MQ=255) ccagcTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGCCGGTCACCACGC‑CGAGCAtggtgaccgacag > 2:1625946‑M2/1‑89 (MQ=255) ccagcTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGCCGGTCACCACGC‑CGAGCAtggtgaccgacag < 1:1625946‑M2/102‑14 (MQ=255) ctgTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCAcgccgagcatggtga < 2:765631‑M1/88‑16 (MQ=255) ctgTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCAcgccgagcatggtga > 1:765631‑M1/1‑73 (MQ=255) tgGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTcg > 1:2166631/1‑150 (MQ=255) ggCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTcgc < 2:694211/150‑1 (MQ=255) gCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTcgcg > 2:1021317/1‑150 (MQ=255) cAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGtgg > 1:2035207‑M2/1‑76 (MQ=255) aGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGct > 2:40762/1‑150 (MQ=255) gTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGct > 1:2129464/1‑143 (MQ=255) gTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCCGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTac > 1:882880/1‑150 (MQ=255) ggACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTacac < 1:652281/150‑1 (MQ=255) ggCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAAc > 1:1762307/1‑150 (MQ=255) ggCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAAc > 1:1384040/1‑150 (MQ=255) gCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAAcc > 2:2384243/1‑150 (MQ=255) gCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCCTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAAcc > 1:1008843/1‑150 (MQ=255) cTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTc < 1:1135211/52‑1 (MQ=255) ttCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTtctc < 1:742920/137‑1 (MQ=255) tCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGt < 2:1350031/150‑1 (MQ=255) gcgcCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCAcgccgagcatggtgac > 2:1294595‑M1/1‑43 (MQ=255) gcgcCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCAcgccgagcatggtgac < 1:1294595‑M1/59‑17 (MQ=255) cTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGCAGTCAG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAg > 2:928951/1‑150 (MQ=255) cACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCCTGCTCG‑GTGGCGT‑ACCGCGTGGCGGCTGCCTGATCCACCTGTGCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCAt < 1:1116227/150‑1 (MQ=255) cACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCgg < 1:1006899/105‑1 (MQ=255) ccTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCt > 2:2255488/1‑150 (MQ=255) tGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTa < 1:1548310/82‑1 (MQ=255) tGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTa > 2:1548310/1‑82 (MQ=255) tGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGGTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGt > 2:1484841/1‑150 (MQ=255) aCCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATc < 2:1753997/73‑1 (MQ=255) aCCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTcc > 2:963262/1‑150 (MQ=255) cTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCAc > 2:1090322/1‑60 (MQ=255) cTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCt > 1:132524/1‑125 (MQ=255) cTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTg > 1:2073989/1‑150 (MQ=255) cTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTg < 1:1951405/150‑1 (MQ=255) cTGGAAGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTg > 2:874558/1‑150 (MQ=255) tGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGa < 1:2232567/150‑1 (MQ=255) tGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGa > 2:1389666/1‑150 (MQ=255) ggACGGCCTGTCGGTCACCAtgctcggcgtggtgaccgacaggccgtccaggtacagggtgaagttcggcgcgaagccgtccaccgacatccactgccacagcagctggct < 2:1917244‑M1/111‑92 (MQ=255) ccTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTgg < 1:874558/150‑1 (MQ=255) ccTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTAAGACTCGTAGTCCTACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTgg < 1:2255488/150‑1 (MQ=255) ccTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCCTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTgg < 2:1008843/150‑1 (MQ=255) ccTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTCTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTgg < 1:978562/150‑1 (MQ=255) cTGTCGGTCACCAtgctcggcgtggtgaccggcaggccgtccaggtacagggtgaagttcggcgcgaagccgtccaccgacatccactgccacagcagctgg < 1:1625946‑M1/102‑90 (MQ=255) cTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGc > 2:2152135/1‑150 (MQ=255) cTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGGGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTTGc > 2:884804/1‑150 (MQ=255) gTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGa < 1:40762/150‑1 (MQ=255) cGGTCACCAcgccgagcatggtgaccgacaggccgtccaggtacagggtgaagttcggcgcgaagccgtccaccgacatccactgccacagcagctggctgtacgcgccgccctcaggcggggcgacgttgaactgccagatgacgtagg > 1:313261‑M1/1‑9 (MQ=255) gTCACCAcgccgagcatggtgaccgacaggccgtccaggtacagggtgaagttcggcgcgaagccgtccaccgacatccactgccacagcagctggctgtacgcgccgccctcaggcggggcgacgttgaa < 2:611246‑M1/131‑125 (MQ=255) gTCACCATGCTCG‑GCGtggtgaccgacaggccgtccaggtacagggtgaagttcggcgc > 2:1294595‑M2/1‑16 (MQ=255) gTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAAc < 1:1040022/150‑1 (MQ=255) tCACCATGCTCG‑GCGtggtgaccgacaggccgtccaggtacagggtgaagttcggcgcgaagccgtccaccgacatccactgccacagcagctggctgtacgcgccggcctcaggcggggcgacgttgaactgccagatgacgtaggcgg < 1:1420202‑M2/150‑136 (MQ=255) aCCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAACctg > 1:1747000/1‑150 (MQ=255) ccacgccgagcatggtgaccgacaggccgtccaggtacagggtgaagttcggcgcgaagccgtccaccgacatccactgccacagcagctggctgtacgcgccgccctcaggcggggcgacgttgaactgccagatgacgtaggcggccg > 1:243956‑M1/1‑3 (MQ=255) ccacgccgagcatggtgaccgacaggccgtccaggtacagggtgaagttcggcgcgaagccgtccaccgacatccactg < 2:2035207‑M1/79‑77 (MQ=255) ccATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAACctgc > 1:1910372/1‑150 (MQ=255) cacaccgagcatggtgaccgacaggccgtccaggtacagggtgaagttcggcgcgaagccggccaccgacatccactgccacagcagctggctgtacacgccgccctcaggcggggcgacgctgaactgccagatgacgtaggcggccga > 2:148097‑M1/1‑2 (MQ=255) cATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCATCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAACctgct > 2:419145/1‑150 (MQ=255) cATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAACctgct > 1:2280917/1‑150 (MQ=255) acgccgagcatggttaccgacaggccttccaggaacagggtgaagttcggcgcgaagccgtccaccgacatccactgccacagcagctggctgtacgcgccgccctcaggcggggcgacgttgaactgccagatgacgtaggcggccgtg < 2:957495‑M1/150‑150 (MQ=255) | GCCACGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAACCTGCT > NC_002947/4666407‑4666696 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |