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Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
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atgccatcaccctggccttgctggccgagttgggcgagccactgatgagcgtcagcctgatcctgccgggcgacagcgagccgatgaccgacccttacgagatccgtgaacggctggagcaccatgttgacctggtgatcgatggcgG‑Gt < 2:52752‑M1/3‑1 (MQ=255) tCGGTCAGGGCTTCACCATAGACCAGCGCCAACTGCAGTTGCCGAGGCTCCTCGACCCGTTCGGCCGGCGCCTCAGGCGCTTCCAGCTGGCTCACGCGTTGACCAGGACTCGCGTGGGGTCGCCACAACCTTCGCGGATCAGTTCCG‑Gtt > 1:1205197/1‑150 (MQ=255) tCAGGGCTTCACCATAGACCAGCGCCAACTGCAGTTGCCGAGGCTCCTCGACCCGTTCGGCCGGCGCCTCAGGCGCTTCCAGCTGGCTCACGCGTTGACCAGGAATGGCGTGGGGTCGCCACAACCTTAGCGGATCAGTTCCG‑GTtcgtc > 1:374171/1‑150 (MQ=255) tCAGGGCTTCACCATAGACCAGCGCCAACTGCAGTTGCCGAGGCTCCTCGACCCGTTCGGCCGGCGCCTCAGGCGCTTCCAGCTGGCTCACGCGTTGACCAGGAACTGCGTGGGGTCGCCACAACCTTCGCGGATCAGTTCCG‑GTtcgtc > 1:1452581/1‑150 (MQ=255) aGGGCTTCACCATAGACCAGCGCCAACTGCAGTTGCCGAGGCTCCTCGACCCGTTCGGCCGGCGCCTCAGGCGCTTCCAGCTGGCTCACGCGTTGACCAGGAATGGCGTGGGGTCGCCACAACCTTCGCGGATCAGTTCCG‑GTTCGTCGc < 2:1582961/150‑1 (MQ=255) 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gCCACAACCTTCGCGGATCAGTTCCG‑GTTCGTCGCCGGACAGGTCGATGATGGTCGACGCCTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCt < 2:2164626/150‑1 (MQ=255) cacaACCTTCGCGGATCAGTTCCG‑GTTCGTCGCCGGACAGGTCGATGATGGTCGACGCCTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGt > 2:735573/1‑150 (MQ=255) acaACCTTCGCGGATCAGTTCCG‑GTTCGTCGCCGGACAGGTCGATGATGGTCGACGCCTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTc > 2:1038962/1‑150 (MQ=255) cactCGCGGATCAGTTCCG‑GTTCTTCGCCGGACAGGTCGATGATGGTCGACGCCTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGccc < 2:1956865/147‑1 (MQ=255) ttCGCGGATCAGTTCCG‑GTTCGTCGCCGGACAGGTCGATGATGGTCGACGCCTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATAGTGCTCCAGCCGTTCACGGAGGTCGGGAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCgg > 2:2411455/1‑150 (MQ=255) cgcgGATCAGTTCCG‑GTTCGTCGCCGGACAGGTCGATGATGGTCGACGCCTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCGGCa < 1:753311/150‑1 (MQ=255) ggATCAGTTCCG‑GTTCGTCGCCGGACAGGTCGATGATGGTCGACGCCTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCCCTCACCAGTTCAACATGCTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCGGCAGGa > 1:884170/1‑150 (MQ=255) cAGTTCCG‑GTTCGTCGCCGGACAGGTCGATGATGGTCGACGCCTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCGGCAGGATCAg < 2:307144/150‑1 (MQ=255) ttCCG‑GTTCGTCGCCGGACAGGTCGATGATGGTCGACGCCTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCGGCAGGATCAGGCt < 1:1492756/150‑1 (MQ=255) ttCCG‑GTTCGTCGCCGGACAGGTCGATGATGGTCGACGCCTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCGGCAGGATCAGGCt > 2:738250/1‑150 (MQ=255) cG‑GTTCGTCGCCGGACAGGTCGATGATGGTCGACGCCTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCAt < 1:1575696/117‑1 (MQ=255) cG‑GTTCGTCGCCGGACAGGTCGATGATGGTCGACGCCTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCAt > 2:1575696/1‑117 (MQ=255) cG‑GTTCGTCGCCGGACAGGTCGATGATGGTCGACGCCTTGAGGTCACCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCGGCAGGATCAGGCTGAc < 2:2058061/150‑1 (MQ=255) | AGCTCGGTCAGGGCTTCACCATAGACCAGCGCCAACTGCAGTTGCCGAGGCTCCTCGACCCGTTCGGCCGGCGCCTCAGGCGCTTCCAGCTGGCTCACGCGTTGACCAGGAATGGCGTGGGGTCGCCACAACCTTCGCGGATCAGTTCCG‑GTTCGTCGCCGGACAGGTCGATGATGGTCGACGCCTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCGGCAGGATCAGGCTGAC > NC_002947/5114236‑5114533 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |