New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
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aCGCCTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATc > 1:2444866/1‑86 (MQ=255) aCGCCTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCGGCAGGATCAGGCTGACGCTCATCAGTGGCTCGCCCAACTCGGCCAGCa > 1:402841/1‑150 (MQ=255) gCCTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTACGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCGGCAGGATCAGGCTGACGCTCATCAGTGGCTCGCCCAACTCGGCCCGCAAg > 1:851326/1‑150 (MQ=255) cTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGAtc > 2:658155/1‑64 (MQ=255) cTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGccc < 2:2446916/97‑1 (MQ=255) cTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGccc > 1:2446916/1‑97 (MQ=255) cTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCGGCAGGATCAGGCTGACGCTCATCAGTGGCTCGCCCAACTCGGCCAGCAAGGc > 1:2041958/1‑150 (MQ=255) 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gCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCGGCAGGATCAGGCTGACGCTCATCAGTGGCTCGCCCAACTCGGCCAGCAAGGCCAGGGTGAt > 1:497970/1‑150 (MQ=255) gaaccCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCa < 2:1270423‑M2/63‑1 (MQ=255) gaaccCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCa > 1:1270423‑M2/6‑68 (MQ=255) accCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCGGCAGGATCAGGCTGACGCTCATCAGTGGCTCGCCCAACTCGGCCAGCAAGGCCAGGGTGATGGCAt < 2:52752‑M2/147‑1 (MQ=255) ccCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCGGCAGGATCAGGCTGACGCTCATCAGTGGCTCGCCCAACTCGGCCAGCAAGGCCAGGGTGATGGCATg < 2:2041958‑M2/148‑1 (MQ=255) cCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCGGCAGGATCAGGCTGACGCTCATCAGTGGCTCGCCCAACTCGGCCa < 2:1047969‑M2/126‑1 (MQ=255) cCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCGGCAGGATCAGGCTGACGCTCATCAGTGGCTCGCCCAACTCGGCCa > 1:1047969‑M2/2‑127 (MQ=255) cCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCGGCAGGATCAGGCTGACGCTCATCAGTGGCTCGCCCAACTCGGCCAGCAAGGCCAGGGTGATGGCATgg > 1:1481826‑M2/2‑150 (MQ=255) cCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCGGCAGGATCAGGCAGACGCTCATCAGTGGCTCGCCCAACTCGGCCAGCAAGGCCAGGGTGATGGCATgg > 1:243014‑M2/2‑150 (MQ=255) cGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCGGCAGGATCAGGCTGACGCTCATCAGTGGCTCGCCCAACTCGGCCAGCAAGGCCAGGGTGATGGCATGGt > 1:1398575/1‑150 (MQ=255) | CCTCGACCCGTTCGGCCGGCGCCTCAGGCGCTTCCAGCTGGCTCACGCGTTGACCAGGAATGGCGTGGGGTCGCCACAACCTTCGCGGATCAGTTCCGGTTCGTCGCCGGACAGGTCGATGATGGTCGACGCCTTGAGGTCGCCGAACCCGCCATCGATCACCAGGTCAACATGGTGCTCCAGCCGTTCACGGATCTCGTAAGGGTCGGTCATCGGCTCGCTGTCGCCCGGCAGGATCAGGCTGACGCTCATCAGTGGCTCGCCCAACTCGGCCAGCAAGGCCAGGGTGATGGCATGGT > NC_002947/5114288‑5114586 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |