New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
CCCTGCAGGTGTTCATCCTGCCCGATGAAGAGGGCCTGATGCTCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCG > NC_002947/5712118‑5712415 | gacaggttctggctgaaacgtgccaggccttggcgagtccagcgagcgcgcaggcggatatggccggccagcattgccgtggcgaccgggccaagccagcgttgcagctcgtgctcccagtccagctccaggtcctgcagcacaccgaac < 2:1052946‑M1/1‑1 (MQ=255) caggttctggctgaaacgtgccaggccttggcgagtccagcgagcgcgcaggcggatatggccggccagcattgccgtggcgaccgggccaagccagcgttgcagctcgtgctcccagtccagctccaggtcctgcagcacaccgaaCAg > 1:2346056‑M1/148‑150 (MQ=255) caggttctggctgaaacgtgccaggccttggcgagtccagcgagcgcgcaggcggatatggccggccagcattgccgtggcgaccgggccaagccagcgttgcagctcgtgctcccagtccagctccaggtcctgcagcacaccgaaCAg > 1:1126682‑M1/148‑150 (MQ=255) cTGCAGGTGTTCATCCTGCCCGATGAAGAGGGCCTGATGCTCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAg < 2:225830/150‑1 (MQ=255) ggttctggctgaaacgtgcgaggccttggcgagtccagcgagcgcgcaggcggatatggccggccagcattgccgtggcgaccgggccaagccagcgttgcagctcgtgctcccagtccagctccaggtcctgcagcacaccgaaCAGGt > 2:1819688‑M1/146‑150 (MQ=255) ctggctgaaacgtgccaggccttggcgagtccagcgagcgcgcaggcggatatggccggccagcattgccgtggcgaccaggccaagccagcgttgcagctcgtgctcccagtccagctccaggtcctgcagcacaccgaaCAGGTCGAg > 2:661487‑M1/142‑150 (MQ=255) tggctgaaacgtgccaggccttggcgagtccagcgagcgcgcaggcggatatggccggccagcattgccgtggcgaccgggccaagccagcgttgcagctcgtgctcccagtccagctccaggtcctgcagcacaccgaaCAGGTCGAGc < 1:1061080‑M1/10‑1 (MQ=255) aTCCTGCCCGATGAAGAGGGCCTGATGCTCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCAc > 1:261944/1‑150 (MQ=255) tGCCCGATGAAGAGGGCCTGATGCTCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGgcg < 2:210297‑M2/150‑4 (MQ=255) gtgccaggccttggcgagtccagcgagcgcgcaggcggatatggccggccagcattgccgtggcgaccgggccaagccagcgttgcagctcgtgctcccagtccagctccaggtcctgcagcacaccgaaCAGGTCGa > 2:474482‑M1/131‑138 (MQ=255) gtgccaggccttggcgagtccagcgagcgcgcaggcggatatggccggccagcattgccgtggcgaccgggccaagccagcgttgcagctcgtgctcccagtccagctccaggtcctgcagcacaccgaaCAGGTCGa < 1:474482‑M1/8‑1 (MQ=255) cccGATGAAGAGGGCCTGATGCTCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGGCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGAc > 2:418791/1‑150 (MQ=255) gATGAAGAGGGCCTGATGCTCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAg‑c > 2:1846386/1‑150 (MQ=255) aaGAGGGCCTGATGCTCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCg > 2:841828/1‑150 (MQ=255) gagGGCCTGATGCTCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTa > 1:74544/1‑150 (MQ=255) agGGCCTGATGCTCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTAc < 1:580359/150‑1 (MQ=255) ccTGATGCTCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCt > 1:900124/1‑150 (MQ=255) ccagcgagcgcgcaggcggatatggccggccagcattgccgtggctaccgggccaagccagcgttgcagctcgtgctcccagtccagctccaggtcctgcagcacaccgaaCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGAc > 2:280802‑M1/112‑150 (MQ=255) 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aCCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGgcggtcttgtccttgaccaaggccagttgcgccaggctaccggcgggggcgcgcaggcggcagtcgacctcgccctgccaatgggcggcga > 1:920686‑M2/1‑37 (MQ=255) cGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCa < 1:2330837/150‑1 (MQ=255) gCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGgcggtcttgtccttgaccaaggccagttgcgccaggctaccggcgggggcgcgcaggcggcagtcgacctcgccctgccaatgggcggcgagcatcaggccctcttcatcgggcag < 2:1814625‑M2/150‑117 (MQ=255) tgtgCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCatat > 2:51735/1‑150 (MQ=255) tgctgcACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATcc > 2:2247503/1‑150 (MQ=255) tgcACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGcc > 1:1537690/1‑150 (MQ=255) acaGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCt > 2:766071/1‑76 (MQ=255) accgaaCAGGTCGAGCAGTACGGCG‑CTGTCGCCGTGCAGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTggccg < 2:1392638‑M1/127‑1 (MQ=255) accgaaCAGGTCGAGCAGTACGGCG‑CTGTCGCCGTGCAGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTggccg > 1:1392638‑M1/7‑133 (MQ=255) aGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTgcgc > 2:489110/1‑150 (MQ=255) cccGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGAc < 1:1922459/43‑1 (MQ=255) cccGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGAc > 2:1922459/1‑43 (MQ=255) cccGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTggccggc > 1:677955/1‑133 (MQ=255) cccGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTggccggc < 2:677955/133‑1 (MQ=255) cccGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTgcgcgc > 2:1047687/1‑150 (MQ=255) cGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGcgctc > 2:1548825/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGTCCGGCCATATCCGCCTGCGcgctcg > 1:603302/1‑150 (MQ=255) | CCCTGCAGGTGTTCATCCTGCCCGATGAAGAGGGCCTGATGCTCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCG > NC_002947/5712118‑5712415 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |