New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
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ccATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGgtgt > 1:1062611/1‑150 (MQ=255) ccATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGgtgt > 1:2321278/1‑150 (MQ=255) cATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGtgtg > 2:429957/1‑150 (MQ=255) cATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGtgtg > 1:1426533/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTTAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCAAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCa < 1:1864939/150‑1 (MQ=255) gCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCa > 2:1082006/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCa < 1:1711296/150‑1 (MQ=255) gggCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTTGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGa < 1:1846394/150‑1 (MQ=255) cGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCt < 1:1916796/150‑1 (MQ=255) cGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCt < 2:74544/150‑1 (MQ=255) 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aCTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAGTGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAg > 2:2214151/1‑150 (MQ=255) aCTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGcgctcgct < 2:2141156/122‑1 (MQ=255) aCTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAg < 1:418791/150‑1 (MQ=255) gctcgacctgTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCa < 1:1061080‑M2/140‑1 (MQ=255) ctcgacctgTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCTGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAg > 2:661487‑M2/10‑150 (MQ=255) ctcgacctgTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTgg > 2:2092705‑M2/10‑91 (MQ=255) ctcgacctgTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTgg < 1:2092705‑M2/82‑1 (MQ=255) tcgacctgTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCAc > 2:474482‑M2/9‑138 (MQ=255) acctgTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTCGCACGTTTCAGCCAGAAcc > 2:1819688‑M2/6‑150 (MQ=255) cctgTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAaccg > 2:2192032‑M2/5‑149 (MQ=255) ctgTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTg > 1:2346056‑M2/4‑150 (MQ=255) ctgTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTg > 1:1126682‑M2/4‑150 (MQ=255) gTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTc < 2:1052946‑M2/149‑1 (MQ=255) | TCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGGCCTGGCACGTTTCAGCCAGAACCTGTC > NC_002947/5712160‑5712457 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |